RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359315.6

TPGS1-201, Transcript of tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TPGS1, Length 1,114 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1-201ENST00000359315 ITKQ08881 620 aa27.17■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 NIPAL4Q0D2K0 466 aa27.17■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 ELP6Q0PNE2 266 aa27.17■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 KIF5AQ12840 1032 aa27.17■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 SGCGQ13326 291 aa27.17■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 TFDP3Q5H9I0 405 aa27.17■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 IQCHQ86VS3 1027 aa27.17■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 RCOR2Q8IZ40 523 aa27.17■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa27.17■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 PAF1Q8N7H5 531 aa27.17■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 EXD1Q8NHP7 514 aa27.17■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 ARRDC2Q8TBH0 407 aa27.17■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 KIAA1524Q8TCG1 905 aa27.17■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 ALG3Q92685 438 aa27.17■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 HAUS1Q96CS2 278 aa27.17■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 KLHDC7BQ96G42 594 aa27.17■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 SMIM14Q96QK8 99 aa27.17■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa27.17■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 A8MX80 341 aa27.16■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 SOCS5O75159 536 aa27.16■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 JCHAINP01591 159 aa27.16■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF883P0CG24 379 aa27.16■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 C6P13671 934 aa27.16■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 IGFALSP35858 605 aa27.16■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 CCT8P50990 548 aa27.16■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 SUOXP51687 545 aa27.16■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 AP1B1Q10567 949 aa27.16■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 SLC14A1Q13336 389 aa27.16■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 TPRG1LQ5T0D9 272 aa27.16■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 ALG1LQ6GMV1 187 aa27.16■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 AADACL2Q6P093 401 aa27.16■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 NT5DC3Q86UY8 548 aa27.16■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 NAXDQ8IW45 347 aa27.16■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 SKA1Q96BD8 255 aa27.16■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 IL12RB2Q99665 862 aa27.16■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 HEMGNQ9BXL5 484 aa27.16■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP27.16■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 BTBD3Q9Y2F9 522 aa27.16■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa27.16■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 TM7SF2O76062 418 aa27.15■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 FTCDO95954 541 aa27.15■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 CPP00450 1065 aa27.15■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 LIG3P49916 1009 aa27.15■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 PEX5P50542 639 aa27.15■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 TFDP2Q14188 446 aa27.15■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 PDK1Q15118 436 aa27.15■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 ERAP2Q6P179 960 aa27.15■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 Q6ZSR6 202 aa27.15■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 ZSCAN30Q86W11 494 aa27.15■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 GATAD2AQ86YP4 633 aa27.15■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 ASB12Q8WXK4 309 aa27.15■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 CENPTQ96BT3 561 aa27.15■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 B4GALT6Q9UBX8 382 aa27.15■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP27.15■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 RAI2Q9Y5P3 530 aa27.15■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 DOCK9Q9BZ29 2069 aa27.14■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 A6NNZ2 444 aa27.14■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 PGLSO95336 258 aa27.14■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 PDHA1P08559 390 aa27.14■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 CCZ1BP86790 482 aa27.14■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 OVGP1Q12889 678 aa27.14■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 PPP2R5EQ16537 467 aa27.14■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 RALGPS1Q5JS13 557 aa27.14■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 SPOCK2Q92563 424 aa27.14■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 GPR27Q9NS67 375 aa27.14■■□□□ 1.94
TPGS1-201ENST00000359315 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
TPGS1-201ENST00000359315 A0A0U1RQS6 177 aa27.13■■□□□ 1.93
TPGS1-201ENST00000359315 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa27.13■■□□□ 1.93
TPGS1-201ENST00000359315 GOLGA8CPA6NN73 597 aa27.13■■□□□ 1.93
TPGS1-201ENST00000359315 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
TPGS1-201ENST00000359315 ARHGAP6O43182 974 aa27.13■■□□□ 1.93
TPGS1-201ENST00000359315 MMP2P08253 660 aa27.13■■□□□ 1.93
TPGS1-201ENST00000359315 GM2AP17900 193 aa27.13■■□□□ 1.93
TPGS1-201ENST00000359315 TGM2P21980 687 aa27.13■■□□□ 1.93
TPGS1-201ENST00000359315 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
TPGS1-201ENST00000359315 IRF4Q15306 451 aa27.13■■□□□ 1.93
TPGS1-201ENST00000359315 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
TPGS1-201ENST00000359315 DBX2Q6ZNG2 339 aa27.13■■□□□ 1.93
TPGS1-201ENST00000359315 DPPA4Q7L190 304 aa27.13■■□□□ 1.93
TPGS1-201ENST00000359315 LRRC8AQ8IWT6 810 aa27.13■■□□□ 1.93
TPGS1-201ENST00000359315 DENND6BQ8NEG7 585 aa27.13■■□□□ 1.93
TPGS1-201ENST00000359315 SEPT10Q9P0V9 454 aa27.13■■□□□ 1.93
TPGS1-201ENST00000359315 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa27.13■■□□□ 1.93
TPGS1-201ENST00000359315 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa27.13■■□□□ 1.93
TPGS1-201ENST00000359315 CCDC66A2RUB6 948 aa27.12■■□□□ 1.93
TPGS1-201ENST00000359315 FZD6O60353 706 aa27.12■■□□□ 1.93
TPGS1-201ENST00000359315 CBFA2T3O75081 653 aa27.12■■□□□ 1.93
TPGS1-201ENST00000359315 NEBLO76041 1014 aa27.12■■□□□ 1.93
TPGS1-201ENST00000359315 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
TPGS1-201ENST00000359315 BNIP3Q12983 259 aa27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms