RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341935.9

CCR6-201, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 4,018 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-201ENST00000341935 LRRC40Q9H9A6 602 aa6.12□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa6.12□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 TBC1D14Q9P2M4 693 aa6.12□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 CHMP2BQ9UQN3 213 aa6.12□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 TEX264Q9Y6I9 313 aa6.12□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 ANXA9O76027 345 aa6.12□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 TMCC1O94876 653 aa6.12□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 HOXD12P35452 270 aa6.12□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 CSKP41240 450 aa6.12□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 RGS19P49795 217 aa6.12□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 GEMP55040 296 aa6.12□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 GPX6P59796 221 aa6.12□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 ITKQ08881 620 aa6.12□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 OLIG2Q13516 323 aa6.12□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 CRY1Q16526 586 aa6.12□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 MAJINQ3KP22 176 aa6.12□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 SYCE2Q6PIF2 218 aa6.12□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 KRT77Q7Z794 578 aa6.12□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 IGDCC3Q8IVU1 814 aa6.12□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 NPAS3Q8IXF0 933 aa6.12□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 SPATA22Q8NHS9 363 aa6.12□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 FEM1AQ9BSK4 669 aa6.12□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 SLC25A51Q9H1U9 297 aa6.12□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 PLK2Q9NYY3 685 aa6.12□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 UBP1Q9NZI7 540 aa6.12□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 CDH22Q9UJ99 828 aa6.12□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 OR51B4Q9Y5P0 310 aa6.12□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 ACTL7AQ9Y615 435 aa6.12□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 CBX4O00257 560 aa6.11□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 CPP00450 1065 aa6.11□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 TSHRP16473 764 aa6.11□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 ZNF235Q14590 738 aa6.11□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 FAM78AQ5JUQ0 283 aa6.11□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 C6orf183Q5T699 404 aa6.11□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa6.11□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 PALM2Q8IXS6 379 aa6.11□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 MPP5Q8N3R9 675 aa6.11□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 FIBINQ8TAL6 211 aa6.11□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 LRRC39Q96DD0 335 aa6.11□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 ALG14Q96F25 216 aa6.11□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 SIGLEC10Q96LC7 697 aa6.11□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 TBL1YQ9BQ87 522 aa6.11□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 LINC00597Q9H2U6 94 aa6.11□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 VPS37BQ9H9H4 285 aa6.11□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 CASS4Q9NQ75 786 aa6.11□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 SPHK2Q9NRA0 654 aa6.11□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 VPS28Q9UK41 221 aa6.11□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa6.11□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 CLEC4EQ9ULY5 219 aa6.11□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 DENND4AQ7Z401 1863 aa6.11□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 REV3LO60673 3130 aa6.11□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 MIA3Q5JRA6 1907 aa6.11□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 ZMPSTE24O75844 475 aa6.11□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 PENKP01210 267 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 MMP2P08253 660 aa6.11□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 S100A5P33763 92 aa6.11□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 TSPAN7P41732 249 aa6.11□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 MAXP61244 160 aa6.11□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 ARF5P84085 180 aa6.11□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 NIPAL4Q0D2K0 466 aa6.11□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 LMAN2Q12907 356 aa6.11□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 LINC00523Q86TU6 105 aa6.11□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 TMEM25Q86YD3 366 aa6.11□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 OR52K1Q8NGK4 314 aa6.11□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 STON2Q8WXE9 905 aa6.11□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 FGF13Q92913 245 aa6.11□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 IRF7Q92985 503 aa6.11□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 OTUB2Q96DC9 234 aa6.11□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 RSPRY1Q96DX4 576 aa6.11□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 CFAP36Q96G28 342 aa6.11□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 LMLNQ96KR4 655 aa6.11□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 ASB16Q96NS5 453 aa6.11□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 TMEM109Q9BVC6 243 aa6.11□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 TMBIM4Q9HC24 238 aa6.11□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 PLSCR2Q9NRY7 297 aa6.11□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 CLEC1BQ9P126 229 aa6.11□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 WNT6Q9Y6F9 365 aa6.11□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 CDH23Q9H251 3354 aa6.11□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 MYLKQ15746 1914 aa6.11□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 GOLGA8KD6RF30 607 aa6.11□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa6.11□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 SNAP91O60641 907 aa6.11□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 USP12O75317 370 aa6.11□□□□□ -1.43
CCR6-201ENST00000341935 MYZAPP0CAP1 466 aa6.11□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20 ms