RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000277010.8

SIGMAR1-201, Transcript of sigma non-opioid intracellular receptor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SIGMAR1, Length 1,656 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIGMAR1-201ENST00000277010 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
SIGMAR1-201ENST00000277010 EPHB1P54762 984 aa22.95■■□□□ 1.26
SIGMAR1-201ENST00000277010 WNT3AP56704 352 aa22.95■■□□□ 1.26
SIGMAR1-201ENST00000277010 FAM193AP78312 1265 aa22.95■■□□□ 1.26
SIGMAR1-201ENST00000277010 GALNT3Q14435 633 aa22.95■■□□□ 1.26
SIGMAR1-201ENST00000277010 PTPRRQ15256 657 aa22.95■■□□□ 1.26
SIGMAR1-201ENST00000277010 SLC14A2Q15849 920 aa22.95■■□□□ 1.26
SIGMAR1-201ENST00000277010 FAXCQ5TGI0 409 aa22.95■■□□□ 1.26
SIGMAR1-201ENST00000277010 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
SIGMAR1-201ENST00000277010 KDELC1Q6UW63 502 aa22.95■■□□□ 1.26
SIGMAR1-201ENST00000277010 ATL2Q8NHH9 583 aa22.95■■□□□ 1.26
SIGMAR1-201ENST00000277010 SMIM14Q96QK8 99 aa22.95■■□□□ 1.26
SIGMAR1-201ENST00000277010 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
SIGMAR1-201ENST00000277010 VPS45Q9NRW7 570 aa22.95■■□□□ 1.26
SIGMAR1-201ENST00000277010 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
SIGMAR1-201ENST00000277010 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa22.95■■□□□ 1.26
SIGMAR1-201ENST00000277010 A8MX80 341 aa22.94■■□□□ 1.26
SIGMAR1-201ENST00000277010 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
SIGMAR1-201ENST00000277010 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
SIGMAR1-201ENST00000277010 RHOBTB1O94844 696 aa22.94■■□□□ 1.26
SIGMAR1-201ENST00000277010 CTPS1P17812 591 aa22.94■■□□□ 1.26
SIGMAR1-201ENST00000277010 ACTN2P35609 894 aa22.94■■□□□ 1.26
SIGMAR1-201ENST00000277010 SUOXP51687 545 aa22.94■■□□□ 1.26
SIGMAR1-201ENST00000277010 CDK18Q07002 472 aa22.94■■□□□ 1.26
SIGMAR1-201ENST00000277010 PRPSAP1Q14558 356 aa22.94■■□□□ 1.26
SIGMAR1-201ENST00000277010 PARP6Q2NL67 630 aa22.94■■□□□ 1.26
SIGMAR1-201ENST00000277010 KIAA0895LQ68EN5 471 aa22.94■■□□□ 1.26
SIGMAR1-201ENST00000277010 ERAP2Q6P179 960 aa22.94■■□□□ 1.26
SIGMAR1-201ENST00000277010 IPMKQ8NFU5 416 aa22.94■■□□□ 1.26
SIGMAR1-201ENST00000277010 SNX19Q92543 992 aa22.94■■□□□ 1.26
SIGMAR1-201ENST00000277010 BIRC7Q96CA5 298 aa22.94■■□□□ 1.26
SIGMAR1-201ENST00000277010 IFT43Q96FT9 208 aa22.94■■□□□ 1.26
SIGMAR1-201ENST00000277010 TRIB3Q96RU7 358 aa22.94■■□□□ 1.26
SIGMAR1-201ENST00000277010 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
SIGMAR1-201ENST00000277010 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
SIGMAR1-201ENST00000277010 ABCA7Q8IZY2 2146 aa22.94■■□□□ 1.26
SIGMAR1-201ENST00000277010 FANCMQ8IYD8 2048 aa22.94■■□□□ 1.26
SIGMAR1-201ENST00000277010 A0A1W2PQU0 124 aa22.93■■□□□ 1.26
SIGMAR1-201ENST00000277010 METTL12A8MUP2 240 aa22.93■■□□□ 1.26
SIGMAR1-201ENST00000277010 ANXA9O76027 345 aa22.93■■□□□ 1.26
SIGMAR1-201ENST00000277010 URI1O94763 535 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
SIGMAR1-201ENST00000277010 TUBB4AP04350 444 aa22.93■■□□□ 1.26
SIGMAR1-201ENST00000277010 IGHV4-34P06331 123 aa22.93■■□□□ 1.26
SIGMAR1-201ENST00000277010 ALPIP09923 528 aa22.93■■□□□ 1.26
SIGMAR1-201ENST00000277010 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
SIGMAR1-201ENST00000277010 GEMP55040 296 aa22.93■■□□□ 1.26
SIGMAR1-201ENST00000277010 ELP6Q0PNE2 266 aa22.93■■□□□ 1.26
SIGMAR1-201ENST00000277010 MPP3Q13368 585 aa22.93■■□□□ 1.26
SIGMAR1-201ENST00000277010 SPDYCQ5MJ68 293 aa22.93■■□□□ 1.26
SIGMAR1-201ENST00000277010 SEL1L3Q68CR1 1132 aa22.93■■□□□ 1.26
SIGMAR1-201ENST00000277010 FOXJ1Q92949 421 aa22.93■■□□□ 1.26
SIGMAR1-201ENST00000277010 MRGPRX2Q96LB1 330 aa22.93■■□□□ 1.26
SIGMAR1-201ENST00000277010 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
SIGMAR1-201ENST00000277010 PCED1AQ9H1Q7 454 aa22.93■■□□□ 1.26
SIGMAR1-201ENST00000277010 RAB23Q9ULC3 237 aa22.93■■□□□ 1.26
SIGMAR1-201ENST00000277010 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
SIGMAR1-201ENST00000277010 ANKRD36A6QL64 1941 aa22.93■■□□□ 1.26
SIGMAR1-201ENST00000277010 MEI4A8MW99 385 aa22.93■■□□□ 1.26
SIGMAR1-201ENST00000277010 C10orf142B7Z368 130 aa22.93■■□□□ 1.26
SIGMAR1-201ENST00000277010 TSPAN6O43657 245 aa22.93■■□□□ 1.26
SIGMAR1-201ENST00000277010 RPL22P35268 128 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
SIGMAR1-201ENST00000277010 MMP12P39900 470 aa22.93■■□□□ 1.26
SIGMAR1-201ENST00000277010 NHLH1Q02575 133 aa22.93■■□□□ 1.26
SIGMAR1-201ENST00000277010 SUMF1Q8NBK3 374 aa22.93■■□□□ 1.26
SIGMAR1-201ENST00000277010 KLK6Q92876 244 aa22.93■■□□□ 1.26
SIGMAR1-201ENST00000277010 RMDN1Q96DB5 314 aa22.93■■□□□ 1.26
SIGMAR1-201ENST00000277010 ADGRE3Q9BY15 652 aa22.93■■□□□ 1.26
SIGMAR1-201ENST00000277010 B4GALT6Q9UBX8 382 aa22.93■■□□□ 1.26
SIGMAR1-201ENST00000277010 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
SIGMAR1-201ENST00000277010 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
SIGMAR1-201ENST00000277010 FRYLO94915 3013 aa22.92■■□□□ 1.26
SIGMAR1-201ENST00000277010 MAOBP27338 520 aa22.92■■□□□ 1.26
SIGMAR1-201ENST00000277010 DEKP35659 375 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
SIGMAR1-201ENST00000277010 FNTAP49354 379 aa22.92■■□□□ 1.26
SIGMAR1-201ENST00000277010 RPL26P61254 145 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
SIGMAR1-201ENST00000277010 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
SIGMAR1-201ENST00000277010 QPCTQ16769 361 aa22.92■■□□□ 1.26
SIGMAR1-201ENST00000277010 LYSMD4Q5XG99 296 aa22.92■■□□□ 1.26
SIGMAR1-201ENST00000277010 NEK5Q6P3R8 708 aa22.92■■□□□ 1.26
SIGMAR1-201ENST00000277010 USP45Q70EL2 814 aa22.92■■□□□ 1.26
SIGMAR1-201ENST00000277010 HORMAD1Q86X24 394 aa22.92■■□□□ 1.26
SIGMAR1-201ENST00000277010 SCRN2Q96FV2 425 aa22.92■■□□□ 1.26
SIGMAR1-201ENST00000277010 FEM1CQ96JP0 617 aa22.92■■□□□ 1.26
SIGMAR1-201ENST00000277010 PHOX2BQ99453 314 aa22.92■■□□□ 1.26
SIGMAR1-201ENST00000277010 FSD1LQ9BXM9 530 aa22.92■■□□□ 1.26
SIGMAR1-201ENST00000277010 PAK5Q9P286 719 aa22.92■■□□□ 1.26
SIGMAR1-201ENST00000277010 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
SIGMAR1-201ENST00000277010 PPIL1Q9Y3C6 166 aa22.92■■□□□ 1.26
SIGMAR1-201ENST00000277010 A0A0J9YYE9 177 aa22.91■■□□□ 1.26
SIGMAR1-201ENST00000277010 A0A0U1RQS6 177 aa22.91■■□□□ 1.26
SIGMAR1-201ENST00000277010 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
SIGMAR1-201ENST00000277010 ANKRD66B4E2M5 251 aa22.91■■□□□ 1.26
SIGMAR1-201ENST00000277010 MMP20O60882 483 aa22.91■■□□□ 1.26
SIGMAR1-201ENST00000277010 TRBC1P01850 177 aa22.91■■□□□ 1.26
SIGMAR1-201ENST00000277010 ITPKAP23677 461 aa22.91■■□□□ 1.26
SIGMAR1-201ENST00000277010 HNF1BP35680 557 aa22.91■■□□□ 1.26
SIGMAR1-201ENST00000277010 CHRNA4P43681 627 aa22.91■■□□□ 1.26
SIGMAR1-201ENST00000277010 CCR5P51681 352 aa22.91■■□□□ 1.26
SIGMAR1-201ENST00000277010 LMNB2Q03252 620 aa22.91■■□□□ 1.26
SIGMAR1-201ENST00000277010 RALGDSQ12967 914 aa22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms