RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620944.4

NME4-211, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene NME4, Length 1,193 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-211ENST00000620944 CRB1P82279 1406 aa30.39■■■□□ 2.46
NME4-211ENST00000620944 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa30.39■■■□□ 2.46
NME4-211ENST00000620944 FAM182BQ5T319 152 aa30.38■■■□□ 2.45
NME4-211ENST00000620944 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa30.37■■■□□ 2.45
NME4-211ENST00000620944 PDE3BQ13370 1112 aa30.37■■■□□ 2.45
NME4-211ENST00000620944 AXIN2Q9Y2T1 843 aa30.36■■■□□ 2.45
NME4-211ENST00000620944 NFAT5O94916 1531 aa30.35■■■□□ 2.45
NME4-211ENST00000620944 WDR17Q8IZU2 1322 aa30.34■■■□□ 2.45
NME4-211ENST00000620944 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa30.32■■■□□ 2.44
NME4-211ENST00000620944 DEFB132Q7Z7B7 95 aa30.32■■■□□ 2.44
NME4-211ENST00000620944 FAM196AQ6ZSG2 479 aa30.31■■■□□ 2.44
NME4-211ENST00000620944 BAG6P46379 1132 aa30.3■■■□□ 2.44
NME4-211ENST00000620944 COG3Q96JB2 828 aa30.29■■■□□ 2.44
NME4-211ENST00000620944 COL18A1P39060 1754 aa30.28■■■□□ 2.44
NME4-211ENST00000620944 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa30.27■■■□□ 2.44
NME4-211ENST00000620944 OVOS2Q6IE36 1432 aa30.27■■■□□ 2.44
NME4-211ENST00000620944 ABCC6O95255 1503 aa30.27■■■□□ 2.44
NME4-211ENST00000620944 USP54Q70EL1 1684 aa30.27■■■□□ 2.44
NME4-211ENST00000620944 CARD10Q9BWT7 1032 aa30.24■■■□□ 2.43
NME4-211ENST00000620944 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP30.23■■■□□ 2.43
NME4-211ENST00000620944 TRIM37O94972 964 aa30.22■■■□□ 2.43
NME4-211ENST00000620944 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP30.22■■■□□ 2.43
NME4-211ENST00000620944 DDB1Q16531 1140 aa30.22■■■□□ 2.43
NME4-211ENST00000620944 POLR3GLQ9BT43 218 aa30.2■■■□□ 2.43
NME4-211ENST00000620944 NLRP2Q9NX02 1062 aa30.2■■■□□ 2.43
NME4-211ENST00000620944 CCDC7Q96M83 1385 aa30.19■■■□□ 2.42
NME4-211ENST00000620944 ERBB3P21860 1342 aa30.19■■■□□ 2.42
NME4-211ENST00000620944 RGPD1P0DJD0 1748 aa30.19■■■□□ 2.42
NME4-211ENST00000620944 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP30.18■■■□□ 2.42
NME4-211ENST00000620944 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP30.17■■■□□ 2.42
NME4-211ENST00000620944 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP30.17■■■□□ 2.42
NME4-211ENST00000620944 ANKRD24Q8TF21 1146 aa30.17■■■□□ 2.42
NME4-211ENST00000620944 GGNBP2Q9H3C7 697 aa30.17■■■□□ 2.42
NME4-211ENST00000620944 FYB1O15117 783 aa30.15■■■□□ 2.42
NME4-211ENST00000620944 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa30.14■■■□□ 2.42
NME4-211ENST00000620944 RGPD5Q99666 1765 aa30.14■■■□□ 2.42
NME4-211ENST00000620944 APBA3O96018 575 aa30.14■■■□□ 2.42
NME4-211ENST00000620944 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP30.14■■■□□ 2.42
NME4-211ENST00000620944 AMPHP49418 695 aa30.14■■■□□ 2.42
NME4-211ENST00000620944 IP6K1Q92551 441 aa30.14■■■□□ 2.42
NME4-211ENST00000620944 LTN1O94822 1766 aa30.13■■■□□ 2.41
NME4-211ENST00000620944 MAP3K19Q56UN5 1328 aa30.12■■■□□ 2.41
NME4-211ENST00000620944 DISP2A7MBM2 1401 aa30.12■■■□□ 2.41
NME4-211ENST00000620944 LRRC37A3O60309 1634 aa30.11■■■□□ 2.41
NME4-211ENST00000620944 EXOC5O00471 708 aa30.11■■■□□ 2.41
NME4-211ENST00000620944 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP30.11■■■□□ 2.41
NME4-211ENST00000620944 NSD3Q9BZ95 1437 aa30.11■■■□□ 2.41
NME4-211ENST00000620944 FBLN1P23142 703 aa30.08■■■□□ 2.41
NME4-211ENST00000620944 CARD14Q9BXL6 1004 aa30.08■■■□□ 2.41
NME4-211ENST00000620944 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
NME4-211ENST00000620944 HOXC9P31274 260 aa30.07■■■□□ 2.4
NME4-211ENST00000620944 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP30.07■■■□□ 2.4
NME4-211ENST00000620944 IL2RBP14784 551 aa30.06■■■□□ 2.4
NME4-211ENST00000620944 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP30.06■■■□□ 2.4
NME4-211ENST00000620944 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
NME4-211ENST00000620944 MYOM1P52179 1685 aa30.06■■■□□ 2.4
NME4-211ENST00000620944 WNK3Q9BYP7 1800 aa30.05■■■□□ 2.4
NME4-211ENST00000620944 RTL1A6NKG5 1358 aa30.04■■■□□ 2.4
NME4-211ENST00000620944 PARD3Q8TEW0 1356 aa30.04■■■□□ 2.4
NME4-211ENST00000620944 CAMKK2Q96RR4 588 aa30.03■■■□□ 2.4
NME4-211ENST00000620944 TNS2Q63HR2 1409 aa30.03■■■□□ 2.4
NME4-211ENST00000620944 CGNL1Q0VF96 1302 aa30.02■■■□□ 2.4
NME4-211ENST00000620944 KIF20BQ96Q89 1820 aa29.99■■■□□ 2.39
NME4-211ENST00000620944 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP29.99■■■□□ 2.39
NME4-211ENST00000620944 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP29.99■■■□□ 2.39
NME4-211ENST00000620944 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP29.98■■■□□ 2.39
NME4-211ENST00000620944 PEAK1Q9H792 1746 aa29.98■■■□□ 2.39
NME4-211ENST00000620944 BCL9O00512 1426 aa29.96■■■□□ 2.39
NME4-211ENST00000620944 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP29.95■■■□□ 2.38
NME4-211ENST00000620944 FLT4P35916 1363 aa29.94■■■□□ 2.38
NME4-211ENST00000620944 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
NME4-211ENST00000620944 KIF24Q5T7B8 1368 aa29.92■■■□□ 2.38
NME4-211ENST00000620944 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP29.92■■■□□ 2.38
NME4-211ENST00000620944 PANK3Q9H999 370 aa29.92■■■□□ 2.38
NME4-211ENST00000620944 NBPF14Q5TI25 921 aa29.91■■■□□ 2.38
NME4-211ENST00000620944 INSRP06213 1382 aa29.9■■■□□ 2.38
NME4-211ENST00000620944 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa29.9■■■□□ 2.38
NME4-211ENST00000620944 PLSCR1O15162 318 aa29.89■■■□□ 2.38
NME4-211ENST00000620944 PTF1AQ7RTS3 328 aa29.89■■■□□ 2.38
NME4-211ENST00000620944 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP29.89■■■□□ 2.38
NME4-211ENST00000620944 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa29.89■■■□□ 2.38
NME4-211ENST00000620944 ACSBG1Q96GR2 724 aa29.88■■■□□ 2.37
NME4-211ENST00000620944 NBPF6Q5VWK0 638 aa29.87■■■□□ 2.37
NME4-211ENST00000620944 USHBP1Q8N6Y0 703 aa29.87■■■□□ 2.37
NME4-211ENST00000620944 NBPF4Q96M43 638 aa29.87■■■□□ 2.37
NME4-211ENST00000620944 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa29.86■■■□□ 2.37
NME4-211ENST00000620944 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP29.85■■■□□ 2.37
NME4-211ENST00000620944 KCNQ2O43526 872 aa29.84■■■□□ 2.37
NME4-211ENST00000620944 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa29.84■■■□□ 2.37
NME4-211ENST00000620944 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP29.83■■■□□ 2.37
NME4-211ENST00000620944 SBF2Q86WG5 1849 aa29.82■■■□□ 2.36
NME4-211ENST00000620944 RREB1Q92766 1687 aa29.82■■■□□ 2.36
NME4-211ENST00000620944 KNSTRNQ9Y448 316 aa29.81■■■□□ 2.36
NME4-211ENST00000620944 MEGF6O75095 1541 aa29.81■■■□□ 2.36
NME4-211ENST00000620944 TATP17735 454 aaPredicted RBP29.8■■■□□ 2.36
NME4-211ENST00000620944 NSD2O96028 1365 aa29.79■■■□□ 2.36
NME4-211ENST00000620944 KIF7Q2M1P5 1343 aa29.79■■■□□ 2.36
NME4-211ENST00000620944 NUP188Q5SRE5 1749 aa29.79■■■□□ 2.36
NME4-211ENST00000620944 WASHC2AQ641Q2 1341 aa29.78■■■□□ 2.36
NME4-211ENST00000620944 POLKQ9UBT6 870 aa29.78■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.1 ms