RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619438.4

SGMS1-210, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SGMS1, Length 1,680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-210ENST00000619438 COG3Q96JB2 828 aa29.09■■■□□ 2.25
SGMS1-210ENST00000619438 USP35Q9P2H5 1018 aa29.09■■■□□ 2.25
SGMS1-210ENST00000619438 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa29.09■■■□□ 2.25
SGMS1-210ENST00000619438 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa29.09■■■□□ 2.25
SGMS1-210ENST00000619438 SEPT12Q8IYM1 358 aa29.09■■■□□ 2.25
SGMS1-210ENST00000619438 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
SGMS1-210ENST00000619438 LMO7Q8WWI1 1683 aa29.08■■■□□ 2.24
SGMS1-210ENST00000619438 AATKQ6ZMQ8 1374 aa29.07■■■□□ 2.24
SGMS1-210ENST00000619438 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa29.06■■■□□ 2.24
SGMS1-210ENST00000619438 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP29.06■■■□□ 2.24
SGMS1-210ENST00000619438 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
SGMS1-210ENST00000619438 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa29.04■■■□□ 2.24
SGMS1-210ENST00000619438 CCDC184Q52MB2 194 aa29.03■■■□□ 2.24
SGMS1-210ENST00000619438 AXIN2Q9Y2T1 843 aa29.03■■■□□ 2.24
SGMS1-210ENST00000619438 FYB1O15117 783 aa29.02■■■□□ 2.24
SGMS1-210ENST00000619438 CARD14Q9BXL6 1004 aa29.02■■■□□ 2.24
SGMS1-210ENST00000619438 GGNBP2Q9H3C7 697 aa29.02■■■□□ 2.24
SGMS1-210ENST00000619438 MRS2Q9HD23 443 aa29.02■■■□□ 2.24
SGMS1-210ENST00000619438 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa29■■■□□ 2.23
SGMS1-210ENST00000619438 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP29■■■□□ 2.23
SGMS1-210ENST00000619438 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa28.99■■■□□ 2.23
SGMS1-210ENST00000619438 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa28.98■■■□□ 2.23
SGMS1-210ENST00000619438 OVOS2Q6IE36 1432 aa28.98■■■□□ 2.23
SGMS1-210ENST00000619438 COL18A1P39060 1754 aa28.98■■■□□ 2.23
SGMS1-210ENST00000619438 TCP11L2Q8N4U5 519 aa28.98■■■□□ 2.23
SGMS1-210ENST00000619438 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
SGMS1-210ENST00000619438 USP54Q70EL1 1684 aa28.98■■■□□ 2.23
SGMS1-210ENST00000619438 RGPD5Q99666 1765 aa28.97■■■□□ 2.23
SGMS1-210ENST00000619438 KRT27Q7Z3Y8 459 aa28.97■■■□□ 2.23
SGMS1-210ENST00000619438 NFAT5O94916 1531 aa28.96■■■□□ 2.23
SGMS1-210ENST00000619438 NSD3Q9BZ95 1437 aa28.96■■■□□ 2.23
SGMS1-210ENST00000619438 PANK3Q9H999 370 aa28.95■■■□□ 2.22
SGMS1-210ENST00000619438 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa28.95■■■□□ 2.22
SGMS1-210ENST00000619438 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
SGMS1-210ENST00000619438 FBLN1P23142 703 aa28.93■■■□□ 2.22
SGMS1-210ENST00000619438 BARGINQ6ZT62 677 aa28.93■■■□□ 2.22
SGMS1-210ENST00000619438 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
SGMS1-210ENST00000619438 WDR17Q8IZU2 1322 aa28.93■■■□□ 2.22
SGMS1-210ENST00000619438 CGNL1Q0VF96 1302 aa28.93■■■□□ 2.22
SGMS1-210ENST00000619438 CRB1P82279 1406 aa28.93■■■□□ 2.22
SGMS1-210ENST00000619438 MYOM1P52179 1685 aa28.92■■■□□ 2.22
SGMS1-210ENST00000619438 AMPHP49418 695 aa28.91■■■□□ 2.22
SGMS1-210ENST00000619438 LTN1O94822 1766 aa28.91■■■□□ 2.22
SGMS1-210ENST00000619438 RALBP1Q15311 655 aa28.89■■■□□ 2.21
SGMS1-210ENST00000619438 IP6K1Q92551 441 aa28.89■■■□□ 2.21
SGMS1-210ENST00000619438 MAP3K19Q56UN5 1328 aa28.87■■■□□ 2.21
SGMS1-210ENST00000619438 PDE3BQ13370 1112 aa28.87■■■□□ 2.21
SGMS1-210ENST00000619438 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
SGMS1-210ENST00000619438 ZBED9Q6R2W3 1325 aa28.87■■■□□ 2.21
SGMS1-210ENST00000619438 ANKRD24Q8TF21 1146 aa28.86■■■□□ 2.21
SGMS1-210ENST00000619438 CARD10Q9BWT7 1032 aa28.86■■■□□ 2.21
SGMS1-210ENST00000619438 NLRP2Q9NX02 1062 aa28.86■■■□□ 2.21
SGMS1-210ENST00000619438 FAM182BQ5T319 152 aa28.86■■■□□ 2.21
SGMS1-210ENST00000619438 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP28.86■■■□□ 2.21
SGMS1-210ENST00000619438 FAM9BQ8IZU0 186 aa28.85■■■□□ 2.21
SGMS1-210ENST00000619438 CCDC125Q86Z20 511 aa28.84■■■□□ 2.21
SGMS1-210ENST00000619438 ERBB3P21860 1342 aa28.84■■■□□ 2.21
SGMS1-210ENST00000619438 HOXC9P31274 260 aa28.83■■■□□ 2.21
SGMS1-210ENST00000619438 KNSTRNQ9Y448 316 aa28.83■■■□□ 2.21
SGMS1-210ENST00000619438 ABCC6O95255 1503 aa28.82■■■□□ 2.2
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SGMS1-210ENST00000619438 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP28.82■■■□□ 2.2
SGMS1-210ENST00000619438 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP28.81■■■□□ 2.2
SGMS1-210ENST00000619438 NEFLP07196 543 aa28.81■■■□□ 2.2
SGMS1-210ENST00000619438 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP28.8■■■□□ 2.2
SGMS1-210ENST00000619438 PARD3Q8TEW0 1356 aa28.8■■■□□ 2.2
SGMS1-210ENST00000619438 KIF20BQ96Q89 1820 aa28.8■■■□□ 2.2
SGMS1-210ENST00000619438 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP28.8■■■□□ 2.2
SGMS1-210ENST00000619438 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP28.78■■■□□ 2.2
SGMS1-210ENST00000619438 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP28.78■■■□□ 2.2
SGMS1-210ENST00000619438 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP28.78■■■□□ 2.2
SGMS1-210ENST00000619438 DDB1Q16531 1140 aa28.78■■■□□ 2.2
SGMS1-210ENST00000619438 FKBP8Q14318 412 aa28.77■■■□□ 2.2
SGMS1-210ENST00000619438 WNK3Q9BYP7 1800 aa28.77■■■□□ 2.2
SGMS1-210ENST00000619438 FAM196AQ6ZSG2 479 aa28.76■■■□□ 2.19
SGMS1-210ENST00000619438 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP28.76■■■□□ 2.19
SGMS1-210ENST00000619438 EXOC5O00471 708 aa28.74■■■□□ 2.19
SGMS1-210ENST00000619438 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa28.74■■■□□ 2.19
SGMS1-210ENST00000619438 RTL1A6NKG5 1358 aa28.73■■■□□ 2.19
SGMS1-210ENST00000619438 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa28.73■■■□□ 2.19
SGMS1-210ENST00000619438 DEFB132Q7Z7B7 95 aa28.72■■■□□ 2.19
SGMS1-210ENST00000619438 MORC1Q86VD1 984 aa28.72■■■□□ 2.19
SGMS1-210ENST00000619438 RGPD1P0DJD0 1748 aa28.72■■■□□ 2.19
SGMS1-210ENST00000619438 LRRC37A3O60309 1634 aa28.71■■■□□ 2.19
SGMS1-210ENST00000619438 IL2RBP14784 551 aa28.7■■■□□ 2.19
SGMS1-210ENST00000619438 FLT4P35916 1363 aa28.7■■■□□ 2.18
SGMS1-210ENST00000619438 NSD2O96028 1365 aa28.69■■■□□ 2.18
SGMS1-210ENST00000619438 KIF24Q5T7B8 1368 aa28.69■■■□□ 2.18
SGMS1-210ENST00000619438 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP28.68■■■□□ 2.18
SGMS1-210ENST00000619438 POLKQ9UBT6 870 aa28.67■■■□□ 2.18
SGMS1-210ENST00000619438 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
SGMS1-210ENST00000619438 INSRP06213 1382 aa28.67■■■□□ 2.18
SGMS1-210ENST00000619438 TRIM37O94972 964 aa28.67■■■□□ 2.18
SGMS1-210ENST00000619438 NBPF6Q5VWK0 638 aa28.64■■■□□ 2.18
SGMS1-210ENST00000619438 NBPF4Q96M43 638 aa28.64■■■□□ 2.18
SGMS1-210ENST00000619438 BAG6P46379 1132 aa28.64■■■□□ 2.17
SGMS1-210ENST00000619438 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP28.64■■■□□ 2.17
SGMS1-210ENST00000619438 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP28.63■■■□□ 2.17
SGMS1-210ENST00000619438 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP28.63■■■□□ 2.17
SGMS1-210ENST00000619438 DISP2A7MBM2 1401 aa28.63■■■□□ 2.17
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