RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610468.4

MUC1-222, Transcript of mucin 1, cell surface associated, human

TSL 1 (best)

Gene MUC1, Length 1,162 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MUC1-222	ENST00000610468	NFAT5	O94916	1531 aa		19.88	■□□□□ 0.77
MUC1-222	ENST00000610468	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		19.88	■□□□□ 0.77
MUC1-222	ENST00000610468	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		19.88	■□□□□ 0.77
MUC1-222	ENST00000610468	BCL9	O00512	1426 aa		19.87	■□□□□ 0.77
MUC1-222	ENST00000610468	AKAP12	Q02952	1782 aa		19.87	■□□□□ 0.77
MUC1-222	ENST00000610468	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		19.87	■□□□□ 0.77
MUC1-222	ENST00000610468	ABCC6	O95255	1503 aa		19.86	■□□□□ 0.77
MUC1-222	ENST00000610468	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	19.86	■□□□□ 0.77
MUC1-222	ENST00000610468	DDB1	Q16531	1140 aa		19.86	■□□□□ 0.77
MUC1-222	ENST00000610468	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	19.86	■□□□□ 0.77
MUC1-222	ENST00000610468	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		19.84	■□□□□ 0.77
MUC1-222	ENST00000610468	CD163L1	Q9NR16	1453 aa		19.84	■□□□□ 0.77
MUC1-222	ENST00000610468	USP31	Q70CQ4	1352 aa		19.83	■□□□□ 0.77
MUC1-222	ENST00000610468	PLSCR1	O15162	318 aa		19.83	■□□□□ 0.77
MUC1-222	ENST00000610468	NBPF14	Q5TI25	921 aa		19.83	■□□□□ 0.77
MUC1-222	ENST00000610468	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	19.82	■□□□□ 0.76
MUC1-222	ENST00000610468	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		19.82	■□□□□ 0.76
MUC1-222	ENST00000610468	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	19.81	■□□□□ 0.76
MUC1-222	ENST00000610468	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		19.81	■□□□□ 0.76
MUC1-222	ENST00000610468	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	19.81	■□□□□ 0.76
MUC1-222	ENST00000610468	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		19.81	■□□□□ 0.76
MUC1-222	ENST00000610468	SOX12	O15370	315 aa		19.8	■□□□□ 0.76
MUC1-222	ENST00000610468	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		19.8	■□□□□ 0.76
MUC1-222	ENST00000610468	CCDC7	Q96M83	1385 aa		19.8	■□□□□ 0.76
MUC1-222	ENST00000610468	USP54	Q70EL1	1684 aa		19.79	■□□□□ 0.76
MUC1-222	ENST00000610468	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		19.78	■□□□□ 0.76
MUC1-222	ENST00000610468	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		19.78	■□□□□ 0.76
MUC1-222	ENST00000610468	PUS7	Q96PZ0	661 aa	Known RBP	19.77	■□□□□ 0.76
MUC1-222	ENST00000610468	ERBB3	P21860	1342 aa		19.76	■□□□□ 0.75
MUC1-222	ENST00000610468	TNS2	Q63HR2	1409 aa		19.76	■□□□□ 0.75
MUC1-222	ENST00000610468	NME9	Q86XW9	330 aa		19.76	■□□□□ 0.75
MUC1-222	ENST00000610468	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	19.76	■□□□□ 0.75
MUC1-222	ENST00000610468	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	19.76	■□□□□ 0.75
MUC1-222	ENST00000610468	SBF2	Q86WG5	1849 aa		19.75	■□□□□ 0.75
MUC1-222	ENST00000610468	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	19.75	■□□□□ 0.75
MUC1-222	ENST00000610468	TONSL	Q96HA7	1378 aa		19.74	■□□□□ 0.75
MUC1-222	ENST00000610468	PROM2	Q8N271	834 aa		19.74	■□□□□ 0.75
MUC1-222	ENST00000610468	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		19.74	■□□□□ 0.75
MUC1-222	ENST00000610468	SPON1	Q9HCB6	807 aa		19.74	■□□□□ 0.75
MUC1-222	ENST00000610468		A0A1W2PP64	1363 aa		19.73	■□□□□ 0.75
MUC1-222	ENST00000610468	EXOC5	O00471	708 aa		19.73	■□□□□ 0.75
MUC1-222	ENST00000610468	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	19.73	■□□□□ 0.75
MUC1-222	ENST00000610468	KCNQ2	O43526	872 aa		19.72	■□□□□ 0.75
MUC1-222	ENST00000610468	TMC1	Q8TDI8	760 aa		19.72	■□□□□ 0.75
MUC1-222	ENST00000610468	RGPD5	Q99666	1765 aa		19.72	■□□□□ 0.75
MUC1-222	ENST00000610468	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		19.71	■□□□□ 0.75
MUC1-222	ENST00000610468	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		19.7	■□□□□ 0.74
MUC1-222	ENST00000610468	TESK2	Q96S53	571 aa		19.7	■□□□□ 0.74
MUC1-222	ENST00000610468	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	19.68	■□□□□ 0.74
MUC1-222	ENST00000610468	TXNRD1	Q16881	649 aa		19.68	■□□□□ 0.74
MUC1-222	ENST00000610468	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		19.68	■□□□□ 0.74
MUC1-222	ENST00000610468	CASZ1	Q86V15	1759 aa		19.67	■□□□□ 0.74
MUC1-222	ENST00000610468	IL2RB	P14784	551 aa		19.67	■□□□□ 0.74
MUC1-222	ENST00000610468	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		19.67	■□□□□ 0.74
MUC1-222	ENST00000610468	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	19.65	■□□□□ 0.74
MUC1-222	ENST00000610468	NHS	Q6T4R5	1651 aa		19.65	■□□□□ 0.74
MUC1-222	ENST00000610468	ST20-MTHFS	A0A0A6YYL1	179 aa		19.64	■□□□□ 0.73
MUC1-222	ENST00000610468	SLC24A1	O60721	1099 aa		19.64	■□□□□ 0.73
MUC1-222	ENST00000610468	IP6K1	Q92551	441 aa		19.64	■□□□□ 0.73
MUC1-222	ENST00000610468	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	19.64	■□□□□ 0.73
MUC1-222	ENST00000610468	LTN1	O94822	1766 aa		19.63	■□□□□ 0.73
MUC1-222	ENST00000610468	SLC15A2	Q16348	729 aa		19.62	■□□□□ 0.73
MUC1-222	ENST00000610468	STK32B	Q9NY57	414 aa		19.62	■□□□□ 0.73
MUC1-222	ENST00000610468	PTGER2	P43116	358 aa		19.61	■□□□□ 0.73
MUC1-222	ENST00000610468	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		19.6	■□□□□ 0.73
MUC1-222	ENST00000610468	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		19.59	■□□□□ 0.73
MUC1-222	ENST00000610468	PAPPA	Q13219	1627 aa		19.59	■□□□□ 0.73
MUC1-222	ENST00000610468	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		19.59	■□□□□ 0.73
MUC1-222	ENST00000610468	ZBTB7A	O95365	584 aa		19.59	■□□□□ 0.73
MUC1-222	ENST00000610468	COG3	Q96JB2	828 aa		19.58	■□□□□ 0.72
MUC1-222	ENST00000610468	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	19.56	■□□□□ 0.72
MUC1-222	ENST00000610468	HOXC9	P31274	260 aa		19.56	■□□□□ 0.72
MUC1-222	ENST00000610468	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		19.56	■□□□□ 0.72
MUC1-222	ENST00000610468	RTL1	A6NKG5	1358 aa		19.56	■□□□□ 0.72
MUC1-222	ENST00000610468	MTFR1L	Q9H019	292 aa		19.55	■□□□□ 0.72
MUC1-222	ENST00000610468	YY1	P25490	414 aa		19.54	■□□□□ 0.72
MUC1-222	ENST00000610468	USP47	Q96K76	1375 aa		19.54	■□□□□ 0.72
MUC1-222	ENST00000610468	MYOM1	P52179	1685 aa		19.53	■□□□□ 0.72
MUC1-222	ENST00000610468	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	19.53	■□□□□ 0.72
MUC1-222	ENST00000610468	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		19.53	■□□□□ 0.72
MUC1-222	ENST00000610468	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	19.53	■□□□□ 0.72
MUC1-222	ENST00000610468	BTAF1	O14981	1849 aa		19.53	■□□□□ 0.72
MUC1-222	ENST00000610468	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		19.52	■□□□□ 0.72
MUC1-222	ENST00000610468	FBLN1	P23142	703 aa		19.52	■□□□□ 0.72
MUC1-222	ENST00000610468	AMPH	P49418	695 aa		19.52	■□□□□ 0.72
MUC1-222	ENST00000610468	TMF1	P82094	1093 aa		19.52	■□□□□ 0.72
MUC1-222	ENST00000610468	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	19.52	■□□□□ 0.72
MUC1-222	ENST00000610468	FYB1	O15117	783 aa		19.51	■□□□□ 0.71
MUC1-222	ENST00000610468	ZNF827	Q17R98	1081 aa		19.51	■□□□□ 0.71
MUC1-222	ENST00000610468	MEGF6	O75095	1541 aa		19.51	■□□□□ 0.71
MUC1-222	ENST00000610468	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		19.5	■□□□□ 0.71
MUC1-222	ENST00000610468	NSD2	O96028	1365 aa		19.49	■□□□□ 0.71
MUC1-222	ENST00000610468	AKT1S1	Q96B36	256 aa		19.49	■□□□□ 0.71
MUC1-222	ENST00000610468	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	19.49	■□□□□ 0.71
MUC1-222	ENST00000610468	MAP3K5	Q99683	1374 aa		19.48	■□□□□ 0.71
MUC1-222	ENST00000610468	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	19.47	■□□□□ 0.71
MUC1-222	ENST00000610468	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	19.47	■□□□□ 0.71
MUC1-222	ENST00000610468	SYT17	Q9BSW7	474 aa		19.47	■□□□□ 0.71
MUC1-222	ENST00000610468	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		19.47	■□□□□ 0.71
MUC1-222	ENST00000610468	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		19.47	■□□□□ 0.71

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