RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601247.5

FCHO1-235, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 4

Gene FCHO1, Length 458 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-235ENST00000601247 IP6K1Q92551 441 aa20.4■□□□□ 0.86
FCHO1-235ENST00000601247 KIAA0232Q92628 1395 aa20.4■□□□□ 0.86
FCHO1-235ENST00000601247 ABCA3Q99758 1704 aa20.4■□□□□ 0.86
FCHO1-235ENST00000601247 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa20.39■□□□□ 0.85
FCHO1-235ENST00000601247 INSRP06213 1382 aa20.38■□□□□ 0.85
FCHO1-235ENST00000601247 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
FCHO1-235ENST00000601247 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
FCHO1-235ENST00000601247 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa20.37■□□□□ 0.85
FCHO1-235ENST00000601247 ADAMTS2O95450 1211 aa20.36■□□□□ 0.85
FCHO1-235ENST00000601247 CHRNA2Q15822 529 aa20.36■□□□□ 0.85
FCHO1-235ENST00000601247 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
FCHO1-235ENST00000601247 ABCC6O95255 1503 aa20.36■□□□□ 0.85
FCHO1-235ENST00000601247 PEAK1Q9H792 1746 aa20.36■□□□□ 0.85
FCHO1-235ENST00000601247 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
FCHO1-235ENST00000601247 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP20.35■□□□□ 0.85
FCHO1-235ENST00000601247 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
FCHO1-235ENST00000601247 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa20.34■□□□□ 0.85
FCHO1-235ENST00000601247 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
FCHO1-235ENST00000601247 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
FCHO1-235ENST00000601247 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
FCHO1-235ENST00000601247 ANKRD24Q8TF21 1146 aa20.33■□□□□ 0.85
FCHO1-235ENST00000601247 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
FCHO1-235ENST00000601247 NEFMP07197 916 aa20.32■□□□□ 0.84
FCHO1-235ENST00000601247 IL13P35225 146 aa20.32■□□□□ 0.84
FCHO1-235ENST00000601247 EVA1CP58658 441 aa20.32■□□□□ 0.84
FCHO1-235ENST00000601247 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
FCHO1-235ENST00000601247 FAM83GA6ND36 823 aa20.29■□□□□ 0.84
FCHO1-235ENST00000601247 ADAMTS8Q9UP79 889 aa20.28■□□□□ 0.84
FCHO1-235ENST00000601247 AXIN2Q9Y2T1 843 aa20.28■□□□□ 0.84
FCHO1-235ENST00000601247 ERBB3P21860 1342 aa20.27■□□□□ 0.84
FCHO1-235ENST00000601247 STRN4Q9NRL3 753 aa20.27■□□□□ 0.84
FCHO1-235ENST00000601247 NLRP2Q9NX02 1062 aa20.27■□□□□ 0.84
FCHO1-235ENST00000601247 BTG4Q9NY30 223 aa20.27■□□□□ 0.84
FCHO1-235ENST00000601247 NGLY1Q96IV0 654 aa20.26■□□□□ 0.83
FCHO1-235ENST00000601247 C8orf37Q96NL8 207 aa20.26■□□□□ 0.83
FCHO1-235ENST00000601247 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa20.26■□□□□ 0.83
FCHO1-235ENST00000601247 HMOX1P09601 288 aa20.25■□□□□ 0.83
FCHO1-235ENST00000601247 COL18A1P39060 1754 aa20.25■□□□□ 0.83
FCHO1-235ENST00000601247 LMO7Q8WWI1 1683 aa20.24■□□□□ 0.83
FCHO1-235ENST00000601247 FCHSD2O94868 740 aa20.24■□□□□ 0.83
FCHO1-235ENST00000601247 SULT6B1Q6IMI4 303 aa20.24■□□□□ 0.83
FCHO1-235ENST00000601247 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa20.24■□□□□ 0.83
FCHO1-235ENST00000601247 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
FCHO1-235ENST00000601247 EYA1Q99502 592 aa20.24■□□□□ 0.83
FCHO1-235ENST00000601247 WDR17Q8IZU2 1322 aa20.24■□□□□ 0.83
FCHO1-235ENST00000601247 IGSF1Q8N6C5 1336 aa20.24■□□□□ 0.83
FCHO1-235ENST00000601247 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
FCHO1-235ENST00000601247 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa20.23■□□□□ 0.83
FCHO1-235ENST00000601247 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
FCHO1-235ENST00000601247 RGPD5Q99666 1765 aa20.22■□□□□ 0.83
FCHO1-235ENST00000601247 RUNDC1Q96C34 613 aa20.22■□□□□ 0.83
FCHO1-235ENST00000601247 LRP6O75581 1613 aa20.21■□□□□ 0.83
FCHO1-235ENST00000601247 CCDC146Q8IYE0 955 aa20.21■□□□□ 0.83
FCHO1-235ENST00000601247 PLCH1Q4KWH8 1693 aa20.21■□□□□ 0.83
FCHO1-235ENST00000601247 PRKAR2BP31323 418 aa20.2■□□□□ 0.82
FCHO1-235ENST00000601247 NBPF6Q5VWK0 638 aa20.2■□□□□ 0.82
FCHO1-235ENST00000601247 USHBP1Q8N6Y0 703 aa20.2■□□□□ 0.82
FCHO1-235ENST00000601247 NBPF4Q96M43 638 aa20.2■□□□□ 0.82
FCHO1-235ENST00000601247 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP20.19■□□□□ 0.82
FCHO1-235ENST00000601247 RSPH6AQ9H0K4 717 aa20.19■□□□□ 0.82
FCHO1-235ENST00000601247 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
FCHO1-235ENST00000601247 RGPD1P0DJD0 1748 aa20.19■□□□□ 0.82
FCHO1-235ENST00000601247 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
FCHO1-235ENST00000601247 AEBP1Q8IUX7 1158 aa20.18■□□□□ 0.82
FCHO1-235ENST00000601247 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa20.18■□□□□ 0.82
FCHO1-235ENST00000601247 NWD2Q9ULI1 1742 aa20.18■□□□□ 0.82
FCHO1-235ENST00000601247 CRB1P82279 1406 aa20.18■□□□□ 0.82
FCHO1-235ENST00000601247 CARD10Q9BWT7 1032 aa20.17■□□□□ 0.82
FCHO1-235ENST00000601247 SLIT2O94813 1529 aa20.17■□□□□ 0.82
FCHO1-235ENST00000601247 TATP17735 454 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
FCHO1-235ENST00000601247 UNC5CLQ8IV45 518 aa20.16■□□□□ 0.82
FCHO1-235ENST00000601247 USP21Q9UK80 565 aa20.16■□□□□ 0.82
FCHO1-235ENST00000601247 KDRP35968 1356 aa20.16■□□□□ 0.82
FCHO1-235ENST00000601247 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
FCHO1-235ENST00000601247 USP35Q9P2H5 1018 aa20.14■□□□□ 0.81
FCHO1-235ENST00000601247 AFF2P51816 1311 aa20.13■□□□□ 0.81
FCHO1-235ENST00000601247 APAF1O14727 1248 aa20.13■□□□□ 0.81
FCHO1-235ENST00000601247 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
FCHO1-235ENST00000601247 TCP11L2Q8N4U5 519 aa20.12■□□□□ 0.81
FCHO1-235ENST00000601247 NGEFQ8N5V2 710 aa20.12■□□□□ 0.81
FCHO1-235ENST00000601247 PLEKHF1Q96S99 279 aa20.12■□□□□ 0.81
FCHO1-235ENST00000601247 RGPD2P0DJD1 1756 aa20.12■□□□□ 0.81
FCHO1-235ENST00000601247 NRAPQ86VF7 1730 aa20.12■□□□□ 0.81
FCHO1-235ENST00000601247 NCAPD2Q15021 1401 aa20.11■□□□□ 0.81
FCHO1-235ENST00000601247 AMOTQ4VCS5 1084 aa20.11■□□□□ 0.81
FCHO1-235ENST00000601247 GAS2L2Q8NHY3 880 aa20.11■□□□□ 0.81
FCHO1-235ENST00000601247 IL2RBP14784 551 aa20.1■□□□□ 0.81
FCHO1-235ENST00000601247 NEUROD2Q15784 382 aa20.1■□□□□ 0.81
FCHO1-235ENST00000601247 VPS72Q15906 364 aa20.1■□□□□ 0.81
FCHO1-235ENST00000601247 SPG7Q9UQ90 795 aa20.1■□□□□ 0.81
FCHO1-235ENST00000601247 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
FCHO1-235ENST00000601247 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
FCHO1-235ENST00000601247 LMOD3Q0VAK6 560 aa20.09■□□□□ 0.81
FCHO1-235ENST00000601247 NFE2L2Q16236 605 aa20.09■□□□□ 0.81
FCHO1-235ENST00000601247 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa20.08■□□□□ 0.81
FCHO1-235ENST00000601247 BCL9LQ86UU0 1499 aa20.08■□□□□ 0.81
FCHO1-235ENST00000601247 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa20.08■□□□□ 0.81
FCHO1-235ENST00000601247 TMPOP42166 694 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
FCHO1-235ENST00000601247 PHACTR3Q96KR7 559 aa20.08■□□□□ 0.81
FCHO1-235ENST00000601247 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.4 ms