RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590198.1

ROGDI-212, Transcript of rogdi homolog, humanhuman

TSL 3

Gene ROGDI, Length 537 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROGDI-212ENST00000590198 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP42.09■■■■■ 4.33
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ROGDI-212ENST00000590198 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa42.08■■■■■ 4.33
ROGDI-212ENST00000590198 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP42.08■■■■■ 4.33
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ROGDI-212ENST00000590198 ERBB3P21860 1342 aa41.9■■■■■ 4.3
ROGDI-212ENST00000590198 RTL1A6NKG5 1358 aa41.89■■■■■ 4.3
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ROGDI-212ENST00000590198 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP41.85■■■■■ 4.29
ROGDI-212ENST00000590198 CARD10Q9BWT7 1032 aa41.85■■■■■ 4.29
ROGDI-212ENST00000590198 NLRP2Q9NX02 1062 aa41.85■■■■■ 4.29
ROGDI-212ENST00000590198 POLKQ9UBT6 870 aa41.84■■■■■ 4.29
ROGDI-212ENST00000590198 FLT4P35916 1363 aa41.83■■■■■ 4.29
ROGDI-212ENST00000590198 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa41.82■■■■■ 4.29
ROGDI-212ENST00000590198 KIF24Q5T7B8 1368 aa41.82■■■■■ 4.29
ROGDI-212ENST00000590198 PEAK1Q9H792 1746 aa41.81■■■■■ 4.28
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ROGDI-212ENST00000590198 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa41.76■■■■■ 4.28
ROGDI-212ENST00000590198 KRT27Q7Z3Y8 459 aa41.75■■■■■ 4.27
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ROGDI-212ENST00000590198 IL2RBP14784 551 aa41.61■■■■■ 4.25
ROGDI-212ENST00000590198 FAM182BQ5T319 152 aa41.61■■■■■ 4.25
ROGDI-212ENST00000590198 RGPD2P0DJD1 1756 aa41.6■■■■■ 4.25
ROGDI-212ENST00000590198 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP41.6■■■■■ 4.25
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ROGDI-212ENST00000590198 WNK3Q9BYP7 1800 aa41.6■■■■■ 4.25
ROGDI-212ENST00000590198 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP41.59■■■■■ 4.25
ROGDI-212ENST00000590198 MTHFSP49914 203 aa41.59■■■■■ 4.25
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ROGDI-212ENST00000590198 NCAPD2Q15021 1401 aa41.39■■■■■ 4.22
ROGDI-212ENST00000590198 IGSF1Q8N6C5 1336 aa41.39■■■■■ 4.22
ROGDI-212ENST00000590198 PARD3Q8TEW0 1356 aa41.38■■■■■ 4.22
ROGDI-212ENST00000590198 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa41.38■■■■■ 4.22
ROGDI-212ENST00000590198 CCDC125Q86Z20 511 aa41.38■■■■■ 4.21
ROGDI-212ENST00000590198 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP41.38■■■■■ 4.21
ROGDI-212ENST00000590198 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP41.37■■■■■ 4.21
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ROGDI-212ENST00000590198 RALBP1Q15311 655 aa41.32■■■■■ 4.21
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