RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588707.5

GTF3C2-AS1-205, GTF3C2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene GTF3C2-AS1, Length 607 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SOX12O15370 315 aa9.93□□□□□ -0.82
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa9.93□□□□□ -0.82
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 CD163L1Q9NR16 1453 aa9.92□□□□□ -0.82
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 AATKQ6ZMQ8 1374 aa9.92□□□□□ -0.82
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 BARGINQ6ZT62 677 aa9.92□□□□□ -0.82
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP9.92□□□□□ -0.82
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 KCNH5Q8NCM2 988 aa9.92□□□□□ -0.82
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ZRANB1Q9UGI0 708 aa9.92□□□□□ -0.82
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ARHGEF25Q86VW2 580 aa9.91□□□□□ -0.82
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 TCP11L2Q8N4U5 519 aa9.91□□□□□ -0.82
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 AXIN2Q9Y2T1 843 aa9.91□□□□□ -0.82
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 MON2Q7Z3U7 1717 aa9.9□□□□□ -0.82
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 A0A1W2PP64 1363 aa9.9□□□□□ -0.82
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 NME9Q86XW9 330 aa9.9□□□□□ -0.82
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 CRB1P82279 1406 aa9.9□□□□□ -0.83
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa9.89□□□□□ -0.83
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 BAG6P46379 1132 aa9.89□□□□□ -0.83
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa9.89□□□□□ -0.83
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 TERF2IPQ9NYB0 399 aa9.89□□□□□ -0.83
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 USP31Q70CQ4 1352 aa9.88□□□□□ -0.83
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 COL18A1P39060 1754 aa9.88□□□□□ -0.83
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 WDR17Q8IZU2 1322 aa9.88□□□□□ -0.83
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 NFAT5O94916 1531 aa9.88□□□□□ -0.83
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 PDE3BQ13370 1112 aa9.88□□□□□ -0.83
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 FAM196AQ6ZSG2 479 aa9.88□□□□□ -0.83
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa9.88□□□□□ -0.83
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 TRIM37O94972 964 aa9.87□□□□□ -0.83
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa9.87□□□□□ -0.83
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 PARD3Q8TEW0 1356 aa9.87□□□□□ -0.83
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 MRS2Q9HD23 443 aa9.86□□□□□ -0.83
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 MYOM1P52179 1685 aa9.86□□□□□ -0.83
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 USP54Q70EL1 1684 aa9.86□□□□□ -0.83
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 CGNL1Q0VF96 1302 aa9.85□□□□□ -0.83
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 RGPD1P0DJD0 1748 aa9.85□□□□□ -0.83
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 DDB1Q16531 1140 aa9.85□□□□□ -0.83
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 NSD2O96028 1365 aa9.85□□□□□ -0.83
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa9.84□□□□□ -0.83
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 OVOS2Q6IE36 1432 aa9.84□□□□□ -0.83
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ABCC6O95255 1503 aa9.84□□□□□ -0.83
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 APBA3O96018 575 aa9.84□□□□□ -0.83
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 CARD10Q9BWT7 1032 aa9.84□□□□□ -0.83
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 RGPD5Q99666 1765 aa9.83□□□□□ -0.84
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 DISP2A7MBM2 1401 aa9.83□□□□□ -0.84
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 LRRC37A3O60309 1634 aa9.83□□□□□ -0.84
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 COG3Q96JB2 828 aa9.83□□□□□ -0.84
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 CAMKK2Q96RR4 588 aa9.83□□□□□ -0.84
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ERBB3P21860 1342 aa9.82□□□□□ -0.84
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa9.82□□□□□ -0.84
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 NSD3Q9BZ95 1437 aa9.82□□□□□ -0.84
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 FBLN1P23142 703 aa9.82□□□□□ -0.84
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 CARD14Q9BXL6 1004 aa9.82□□□□□ -0.84
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 NLRP2Q9NX02 1062 aa9.82□□□□□ -0.84
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 LTN1O94822 1766 aa9.81□□□□□ -0.84
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ANKRD24Q8TF21 1146 aa9.81□□□□□ -0.84
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 GGNBP2Q9H3C7 697 aa9.81□□□□□ -0.84
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa9.8□□□□□ -0.84
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 WNK3Q9BYP7 1800 aa9.8□□□□□ -0.84
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 PEAK1Q9H792 1746 aa9.8□□□□□ -0.84
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 EXOC5O00471 708 aa9.8□□□□□ -0.84
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 FYB1O15117 783 aa9.8□□□□□ -0.84
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 MORC1Q86VD1 984 aa9.8□□□□□ -0.84
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 IP6K1Q92551 441 aa9.8□□□□□ -0.84
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 MAP3K19Q56UN5 1328 aa9.8□□□□□ -0.84
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 HOXC9P31274 260 aa9.79□□□□□ -0.84
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 PTF1AQ7RTS3 328 aa9.79□□□□□ -0.84
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 IL2RBP14784 551 aa9.78□□□□□ -0.84
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 PPP2R1AP30153 589 aa9.78□□□□□ -0.84
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 AMPHP49418 695 aa9.78□□□□□ -0.84
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 FAM9BQ8IZU0 186 aa9.78□□□□□ -0.84
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 BCL9O00512 1426 aa9.77□□□□□ -0.85
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 TNS2Q63HR2 1409 aa9.77□□□□□ -0.85
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 CCDC184Q52MB2 194 aa9.77□□□□□ -0.85
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 INSRP06213 1382 aa9.76□□□□□ -0.85
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 PLSCR1O15162 318 aa9.76□□□□□ -0.85
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 RREB1Q92766 1687 aa9.76□□□□□ -0.85
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 KCNQ2O43526 872 aa9.75□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms