RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588358.5

ZNF444-208, Transcript of zinc finger protein 444, human

TSL 2

Gene ZNF444, Length 642 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF444-208	ENST00000588358	CABP1	Q9NZU7	370 aa		31.61	■■■□□ 2.65
ZNF444-208	ENST00000588358	SBF2	Q86WG5	1849 aa		31.61	■■■□□ 2.65
ZNF444-208	ENST00000588358	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		31.6	■■■□□ 2.65
ZNF444-208	ENST00000588358	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	31.59	■■■□□ 2.65
ZNF444-208	ENST00000588358	USP6	P35125	1406 aa		31.58	■■■□□ 2.65
ZNF444-208	ENST00000588358	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		31.58	■■■□□ 2.65
ZNF444-208	ENST00000588358	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	31.58	■■■□□ 2.65
ZNF444-208	ENST00000588358	LRRC37A3	O60309	1634 aa		31.57	■■■□□ 2.64
ZNF444-208	ENST00000588358	PROM2	Q8N271	834 aa		31.57	■■■□□ 2.64
ZNF444-208	ENST00000588358	AXIN2	Q9Y2T1	843 aa		31.57	■■■□□ 2.64
ZNF444-208	ENST00000588358	SLIT3	O75094	1523 aa		31.57	■■■□□ 2.64
ZNF444-208	ENST00000588358	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	31.56	■■■□□ 2.64
ZNF444-208	ENST00000588358	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		31.56	■■■□□ 2.64
ZNF444-208	ENST00000588358	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		31.56	■■■□□ 2.64
ZNF444-208	ENST00000588358	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		31.55	■■■□□ 2.64
ZNF444-208	ENST00000588358	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	31.55	■■■□□ 2.64
ZNF444-208	ENST00000588358	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	31.55	■■■□□ 2.64
ZNF444-208	ENST00000588358	COL18A1	P39060	1754 aa		31.55	■■■□□ 2.64
ZNF444-208	ENST00000588358	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		31.51	■■■□□ 2.64
ZNF444-208	ENST00000588358	CASZ1	Q86V15	1759 aa		31.51	■■■□□ 2.64
ZNF444-208	ENST00000588358	EVC2	Q86UK5	1308 aa		31.5	■■■□□ 2.63
ZNF444-208	ENST00000588358	PIK3C2A	O00443	1686 aa		31.48	■■■□□ 2.63
ZNF444-208	ENST00000588358	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		31.48	■■■□□ 2.63
ZNF444-208	ENST00000588358	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	31.48	■■■□□ 2.63
ZNF444-208	ENST00000588358	BCL9	O00512	1426 aa		31.48	■■■□□ 2.63
ZNF444-208	ENST00000588358	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		31.47	■■■□□ 2.63
ZNF444-208	ENST00000588358	ZBTB7A	O95365	584 aa		31.47	■■■□□ 2.63
ZNF444-208	ENST00000588358	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		31.45	■■■□□ 2.63
ZNF444-208	ENST00000588358	PTGER2	P43116	358 aa		31.45	■■■□□ 2.63
ZNF444-208	ENST00000588358	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	31.45	■■■□□ 2.63
ZNF444-208	ENST00000588358	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		31.44	■■■□□ 2.62
ZNF444-208	ENST00000588358	UTRN	P46939	3433 aa		31.44	■■■□□ 2.62
ZNF444-208	ENST00000588358	TXNRD1	Q16881	649 aa		31.42	■■■□□ 2.62
ZNF444-208	ENST00000588358	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	31.42	■■■□□ 2.62
ZNF444-208	ENST00000588358	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		31.42	■■■□□ 2.62
ZNF444-208	ENST00000588358	RGPD5	Q99666	1765 aa		31.41	■■■□□ 2.62
ZNF444-208	ENST00000588358	SLC24A1	O60721	1099 aa		31.41	■■■□□ 2.62
ZNF444-208	ENST00000588358	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		31.41	■■■□□ 2.62
ZNF444-208	ENST00000588358	AKAP12	Q02952	1782 aa		31.4	■■■□□ 2.62
ZNF444-208	ENST00000588358	SOX12	O15370	315 aa		31.4	■■■□□ 2.62
ZNF444-208	ENST00000588358	EXOC5	O00471	708 aa		31.39	■■■□□ 2.62
ZNF444-208	ENST00000588358	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		31.39	■■■□□ 2.62
ZNF444-208	ENST00000588358	ZNF692	Q9BU19	519 aa	Predicted RBP	31.39	■■■□□ 2.62
ZNF444-208	ENST00000588358	STK32B	Q9NY57	414 aa		31.39	■■■□□ 2.62
ZNF444-208	ENST00000588358	SLC15A2	Q16348	729 aa		31.38	■■■□□ 2.61
ZNF444-208	ENST00000588358	MYOM1	P52179	1685 aa		31.37	■■■□□ 2.61
ZNF444-208	ENST00000588358	ST20-MTHFS	A0A0A6YYL1	179 aa		31.33	■■■□□ 2.61
ZNF444-208	ENST00000588358	USP47	Q96K76	1375 aa		31.32	■■■□□ 2.6
ZNF444-208	ENST00000588358	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		31.32	■■■□□ 2.6
ZNF444-208	ENST00000588358	SYT17	Q9BSW7	474 aa		31.32	■■■□□ 2.6
ZNF444-208	ENST00000588358	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	31.32	■■■□□ 2.6
ZNF444-208	ENST00000588358	PUS7	Q96PZ0	661 aa	Known RBP	31.31	■■■□□ 2.6
ZNF444-208	ENST00000588358	CCDC7	Q96M83	1385 aa		31.3	■■■□□ 2.6
ZNF444-208	ENST00000588358	NFAT5	O94916	1531 aa		31.3	■■■□□ 2.6
ZNF444-208	ENST00000588358	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		31.3	■■■□□ 2.6
ZNF444-208	ENST00000588358	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	31.29	■■■□□ 2.6
ZNF444-208	ENST00000588358	MTFR1L	Q9H019	292 aa		31.29	■■■□□ 2.6
ZNF444-208	ENST00000588358	TESK2	Q96S53	571 aa		31.28	■■■□□ 2.6
ZNF444-208	ENST00000588358	TNS2	Q63HR2	1409 aa		31.27	■■■□□ 2.6
ZNF444-208	ENST00000588358	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		31.26	■■■□□ 2.59
ZNF444-208	ENST00000588358	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	31.25	■■■□□ 2.59
ZNF444-208	ENST00000588358	NHS	Q6T4R5	1651 aa		31.22	■■■□□ 2.59
ZNF444-208	ENST00000588358	ABCC6	O95255	1503 aa		31.21	■■■□□ 2.59
ZNF444-208	ENST00000588358	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		31.2	■■■□□ 2.59
ZNF444-208	ENST00000588358	TMF1	P82094	1093 aa		31.19	■■■□□ 2.58
ZNF444-208	ENST00000588358	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	31.19	■■■□□ 2.58
ZNF444-208	ENST00000588358	ARX	Q96QS3	562 aa		31.19	■■■□□ 2.58
ZNF444-208	ENST00000588358	ERBB3	P21860	1342 aa		31.19	■■■□□ 2.58
ZNF444-208	ENST00000588358	USP31	Q70CQ4	1352 aa		31.18	■■■□□ 2.58
ZNF444-208	ENST00000588358	IL2RB	P14784	551 aa		31.17	■■■□□ 2.58
ZNF444-208	ENST00000588358	PAPPA	Q13219	1627 aa		31.16	■■■□□ 2.58
ZNF444-208	ENST00000588358	ZNF827	Q17R98	1081 aa		31.15	■■■□□ 2.58
ZNF444-208	ENST00000588358	CDCA8	Q53HL2	280 aa		31.15	■■■□□ 2.58
ZNF444-208	ENST00000588358	NME9	Q86XW9	330 aa		31.15	■■■□□ 2.58
ZNF444-208	ENST00000588358	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		31.15	■■■□□ 2.58
ZNF444-208	ENST00000588358	CHD4	Q14839	1912 aa		31.14	■■■□□ 2.58
ZNF444-208	ENST00000588358	TMC1	Q8TDI8	760 aa		31.14	■■■□□ 2.58
ZNF444-208	ENST00000588358	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		31.14	■■■□□ 2.58
ZNF444-208	ENST00000588358	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		31.13	■■■□□ 2.57
ZNF444-208	ENST00000588358	BTAF1	O14981	1849 aa		31.12	■■■□□ 2.57
ZNF444-208	ENST00000588358	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		31.12	■■■□□ 2.57
ZNF444-208	ENST00000588358	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	31.11	■■■□□ 2.57
ZNF444-208	ENST00000588358	MAP3K5	Q99683	1374 aa		31.11	■■■□□ 2.57
ZNF444-208	ENST00000588358	CD163L1	Q9NR16	1453 aa		31.1	■■■□□ 2.57
ZNF444-208	ENST00000588358	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	31.1	■■■□□ 2.57
ZNF444-208	ENST00000588358	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		31.1	■■■□□ 2.57
ZNF444-208	ENST00000588358	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		31.1	■■■□□ 2.57
ZNF444-208	ENST00000588358	USP54	Q70EL1	1684 aa		31.09	■■■□□ 2.57
ZNF444-208	ENST00000588358	LTN1	O94822	1766 aa		31.08	■■■□□ 2.57
ZNF444-208	ENST00000588358	AKT1S1	Q96B36	256 aa		31.07	■■■□□ 2.56
ZNF444-208	ENST00000588358	C1QTNF8	P60827	252 aa		31.05	■■■□□ 2.56
ZNF444-208	ENST00000588358	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		31.02	■■■□□ 2.56
ZNF444-208	ENST00000588358	GPR162	Q16538	588 aa		31.02	■■■□□ 2.56
ZNF444-208	ENST00000588358	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	31.02	■■■□□ 2.56
ZNF444-208	ENST00000588358	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	31.01	■■■□□ 2.55
ZNF444-208	ENST00000588358	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	31.01	■■■□□ 2.55
ZNF444-208	ENST00000588358	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		31.01	■■■□□ 2.55
ZNF444-208	ENST00000588358	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		31	■■■□□ 2.55
ZNF444-208	ENST00000588358	IP6K1	Q92551	441 aa		30.99	■■■□□ 2.55
ZNF444-208	ENST00000588358	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		30.98	■■■□□ 2.55

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