RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588340.1

EFTUD2-210, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 595 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-210ENST00000588340 CD163L1Q9NR16 1453 aa9.67□□□□□ -0.86
EFTUD2-210ENST00000588340 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
EFTUD2-210ENST00000588340 FAM182BQ5T319 152 aa9.67□□□□□ -0.86
EFTUD2-210ENST00000588340 USP35Q9P2H5 1018 aa9.67□□□□□ -0.86
EFTUD2-210ENST00000588340 USP54Q70EL1 1684 aa9.67□□□□□ -0.86
EFTUD2-210ENST00000588340 AATKQ6ZMQ8 1374 aa9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-210ENST00000588340 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-210ENST00000588340 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-210ENST00000588340 ZBTB7CA1YPR0 619 aa9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-210ENST00000588340 BARGINQ6ZT62 677 aa9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-210ENST00000588340 DEFB132Q7Z7B7 95 aa9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-210ENST00000588340 KCNH5Q8NCM2 988 aa9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-210ENST00000588340 TMC1Q8TDI8 760 aa9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-210ENST00000588340 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-210ENST00000588340 ZRANB1Q9UGI0 708 aa9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-210ENST00000588340 LTN1O94822 1766 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-210ENST00000588340 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-210ENST00000588340 SLC24A1O60721 1099 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-210ENST00000588340 ARHGEF25Q86VW2 580 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-210ENST00000588340 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-210ENST00000588340 TCP11L2Q8N4U5 519 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-210ENST00000588340 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-210ENST00000588340 NFAT5O94916 1531 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-210ENST00000588340 WNK3Q9BYP7 1800 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-210ENST00000588340 CRB1P82279 1406 aa9.65□□□□□ -0.87
EFTUD2-210ENST00000588340 HAX1O00165 279 aa9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-210ENST00000588340 SOX12O15370 315 aa9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-210ENST00000588340 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-210ENST00000588340 AXIN2Q9Y2T1 843 aa9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-210ENST00000588340 USP31Q70CQ4 1352 aa9.63□□□□□ -0.87
EFTUD2-210ENST00000588340 BAG6P46379 1132 aa9.63□□□□□ -0.87
EFTUD2-210ENST00000588340 PDE3BQ13370 1112 aa9.63□□□□□ -0.87
EFTUD2-210ENST00000588340 FAM196AQ6ZSG2 479 aa9.63□□□□□ -0.87
EFTUD2-210ENST00000588340 NME9Q86XW9 330 aa9.63□□□□□ -0.87
EFTUD2-210ENST00000588340 TERF2IPQ9NYB0 399 aa9.63□□□□□ -0.87
EFTUD2-210ENST00000588340 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
EFTUD2-210ENST00000588340 SBF2Q86WG5 1849 aa9.63□□□□□ -0.87
EFTUD2-210ENST00000588340 A0A1W2PP64 1363 aa9.63□□□□□ -0.87
EFTUD2-210ENST00000588340 NINLQ9Y2I6 1382 aa9.63□□□□□ -0.87
EFTUD2-210ENST00000588340 WDR17Q8IZU2 1322 aa9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-210ENST00000588340 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-210ENST00000588340 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-210ENST00000588340 ABCC6O95255 1503 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-210ENST00000588340 MYOM1P52179 1685 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-210ENST00000588340 LRRC37A3O60309 1634 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-210ENST00000588340 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-210ENST00000588340 DISP2A7MBM2 1401 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-210ENST00000588340 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-210ENST00000588340 PEAK1Q9H792 1746 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-210ENST00000588340 TRIM37O94972 964 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-210ENST00000588340 TMF1P82094 1093 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-210ENST00000588340 KAT6BQ8WYB5 2073 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-210ENST00000588340 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-210ENST00000588340 OVOS2Q6IE36 1432 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-210ENST00000588340 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-210ENST00000588340 CARD10Q9BWT7 1032 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-210ENST00000588340 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
EFTUD2-210ENST00000588340 APBA3O96018 575 aa9.58□□□□□ -0.88
EFTUD2-210ENST00000588340 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP9.58□□□□□ -0.88
EFTUD2-210ENST00000588340 DDB1Q16531 1140 aa9.58□□□□□ -0.88
EFTUD2-210ENST00000588340 CAMKK2Q96RR4 588 aa9.58□□□□□ -0.88
EFTUD2-210ENST00000588340 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
EFTUD2-210ENST00000588340 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa9.58□□□□□ -0.88
EFTUD2-210ENST00000588340 RREB1Q92766 1687 aa9.58□□□□□ -0.88
EFTUD2-210ENST00000588340 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa9.57□□□□□ -0.88
EFTUD2-210ENST00000588340 KIF20BQ96Q89 1820 aa9.57□□□□□ -0.88
EFTUD2-210ENST00000588340 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
EFTUD2-210ENST00000588340 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
EFTUD2-210ENST00000588340 CCDC7Q96M83 1385 aa9.57□□□□□ -0.88
EFTUD2-210ENST00000588340 ERBB3P21860 1342 aa9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-210ENST00000588340 RGPD2P0DJD1 1756 aa9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-210ENST00000588340 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-210ENST00000588340 CDCA8Q53HL2 280 aa9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-210ENST00000588340 COG3Q96JB2 828 aa9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-210ENST00000588340 NUP188Q5SRE5 1749 aa9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-210ENST00000588340 PARD3Q8TEW0 1356 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-210ENST00000588340 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-210ENST00000588340 EXOC5O00471 708 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-210ENST00000588340 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-210ENST00000588340 ANKRD24Q8TF21 1146 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-210ENST00000588340 IP6K1Q92551 441 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-210ENST00000588340 NLRP2Q9NX02 1062 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-210ENST00000588340 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-210ENST00000588340 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-210ENST00000588340 FYB1O15117 783 aa9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-210ENST00000588340 FBLN1P23142 703 aa9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-210ENST00000588340 BCL9O00512 1426 aa9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-210ENST00000588340 LRP5O75197 1615 aa9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-210ENST00000588340 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-210ENST00000588340 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-210ENST00000588340 GGNBP2Q9H3C7 697 aa9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-210ENST00000588340 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-210ENST00000588340 TNS2Q63HR2 1409 aa9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-210ENST00000588340 MAP3K19Q56UN5 1328 aa9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-210ENST00000588340 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-210ENST00000588340 PLSCR1O15162 318 aa9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-210ENST00000588340 IL2RBP14784 551 aa9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-210ENST00000588340 HOXC9P31274 260 aa9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-210ENST00000588340 AMPHP49418 695 aa9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-210ENST00000588340 PTF1AQ7RTS3 328 aa9.52□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms