RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583656.5

MTMR4-209, Transcript of myotubularin related protein 4, human

TSL 3

Gene MTMR4, Length 810 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MTMR4-209	ENST00000583656	MYOM1	P52179	1685 aa		33.24	■■■□□ 2.91
MTMR4-209	ENST00000583656	FYB1	O15117	783 aa		33.24	■■■□□ 2.91
MTMR4-209	ENST00000583656	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		33.24	■■■□□ 2.91
MTMR4-209	ENST00000583656	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	33.24	■■■□□ 2.91
MTMR4-209	ENST00000583656	USP54	Q70EL1	1684 aa		33.23	■■■□□ 2.91
MTMR4-209	ENST00000583656	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		33.2	■■■□□ 2.91
MTMR4-209	ENST00000583656	COL18A1	P39060	1754 aa		33.19	■■■□□ 2.9
MTMR4-209	ENST00000583656	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		33.18	■■■□□ 2.9
MTMR4-209	ENST00000583656	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		33.18	■■■□□ 2.9
MTMR4-209	ENST00000583656	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		33.18	■■■□□ 2.9
MTMR4-209	ENST00000583656	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		33.18	■■■□□ 2.9
MTMR4-209	ENST00000583656	FBLN1	P23142	703 aa		33.17	■■■□□ 2.9
MTMR4-209	ENST00000583656	CRB1	P82279	1406 aa		33.15	■■■□□ 2.9
MTMR4-209	ENST00000583656	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		33.14	■■■□□ 2.9
MTMR4-209	ENST00000583656	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		33.14	■■■□□ 2.9
MTMR4-209	ENST00000583656	PANK3	Q9H999	370 aa		33.14	■■■□□ 2.9
MTMR4-209	ENST00000583656	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		33.13	■■■□□ 2.89
MTMR4-209	ENST00000583656	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	33.12	■■■□□ 2.89
MTMR4-209	ENST00000583656	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		33.11	■■■□□ 2.89
MTMR4-209	ENST00000583656	RGPD5	Q99666	1765 aa		33.09	■■■□□ 2.89
MTMR4-209	ENST00000583656	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		33.09	■■■□□ 2.89
MTMR4-209	ENST00000583656	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		33.08	■■■□□ 2.89
MTMR4-209	ENST00000583656	AMPH	P49418	695 aa		33.08	■■■□□ 2.89
MTMR4-209	ENST00000583656	IP6K1	Q92551	441 aa		33.08	■■■□□ 2.89
MTMR4-209	ENST00000583656	LTN1	O94822	1766 aa		33.08	■■■□□ 2.89
MTMR4-209	ENST00000583656	ABCC6	O95255	1503 aa		33.07	■■■□□ 2.89
MTMR4-209	ENST00000583656	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	33.07	■■■□□ 2.88
MTMR4-209	ENST00000583656	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		33.07	■■■□□ 2.88
MTMR4-209	ENST00000583656	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		33.07	■■■□□ 2.88
MTMR4-209	ENST00000583656	FAM182B	Q5T319	152 aa		33.06	■■■□□ 2.88
MTMR4-209	ENST00000583656	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		33.06	■■■□□ 2.88
MTMR4-209	ENST00000583656	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		33.05	■■■□□ 2.88
MTMR4-209	ENST00000583656	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	33.04	■■■□□ 2.88
MTMR4-209	ENST00000583656	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		33.04	■■■□□ 2.88
MTMR4-209	ENST00000583656	ERBB3	P21860	1342 aa		33.03	■■■□□ 2.88
MTMR4-209	ENST00000583656	HOXC9	P31274	260 aa		33.02	■■■□□ 2.88
MTMR4-209	ENST00000583656	PDE3B	Q13370	1112 aa		33.02	■■■□□ 2.88
MTMR4-209	ENST00000583656	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	33	■■■□□ 2.87
MTMR4-209	ENST00000583656	CCDC125	Q86Z20	511 aa		32.98	■■■□□ 2.87
MTMR4-209	ENST00000583656	CCDC7	Q96M83	1385 aa		32.96	■■■□□ 2.87
MTMR4-209	ENST00000583656	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		32.96	■■■□□ 2.87
MTMR4-209	ENST00000583656	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	32.95	■■■□□ 2.87
MTMR4-209	ENST00000583656	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	32.94	■■■□□ 2.86
MTMR4-209	ENST00000583656	DDB1	Q16531	1140 aa		32.94	■■■□□ 2.86
MTMR4-209	ENST00000583656	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		32.94	■■■□□ 2.86
MTMR4-209	ENST00000583656	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		32.93	■■■□□ 2.86
MTMR4-209	ENST00000583656	RTL1	A6NKG5	1358 aa		32.93	■■■□□ 2.86
MTMR4-209	ENST00000583656	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	32.92	■■■□□ 2.86
MTMR4-209	ENST00000583656	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	32.92	■■■□□ 2.86
MTMR4-209	ENST00000583656	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		32.91	■■■□□ 2.86
MTMR4-209	ENST00000583656	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		32.9	■■■□□ 2.86
MTMR4-209	ENST00000583656	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	32.88	■■■□□ 2.85
MTMR4-209	ENST00000583656	DISP2	A7MBM2	1401 aa		32.87	■■■□□ 2.85
MTMR4-209	ENST00000583656	FLT4	P35916	1363 aa		32.87	■■■□□ 2.85
MTMR4-209	ENST00000583656	EXOC5	O00471	708 aa		32.87	■■■□□ 2.85
MTMR4-209	ENST00000583656	NSD2	O96028	1365 aa		32.86	■■■□□ 2.85
MTMR4-209	ENST00000583656	IL2RB	P14784	551 aa		32.86	■■■□□ 2.85
MTMR4-209	ENST00000583656	MORC1	Q86VD1	984 aa		32.86	■■■□□ 2.85
MTMR4-209	ENST00000583656	INSR	P06213	1382 aa		32.84	■■■□□ 2.85
MTMR4-209	ENST00000583656	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		32.84	■■■□□ 2.85
MTMR4-209	ENST00000583656	EP400	Q96L91	3159 aa		32.84	■■■□□ 2.85
MTMR4-209	ENST00000583656	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		32.84	■■■□□ 2.85
MTMR4-209	ENST00000583656	POLK	Q9UBT6	870 aa		32.84	■■■□□ 2.85
MTMR4-209	ENST00000583656	PEAK1	Q9H792	1746 aa		32.83	■■■□□ 2.85
MTMR4-209	ENST00000583656	TRIM37	O94972	964 aa		32.83	■■■□□ 2.85
MTMR4-209	ENST00000583656	LRRC37A3	O60309	1634 aa		32.83	■■■□□ 2.85
MTMR4-209	ENST00000583656	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		32.82	■■■□□ 2.84
MTMR4-209	ENST00000583656	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	32.82	■■■□□ 2.84
MTMR4-209	ENST00000583656	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	32.81	■■■□□ 2.84
MTMR4-209	ENST00000583656	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		32.81	■■■□□ 2.84
MTMR4-209	ENST00000583656	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	32.81	■■■□□ 2.84
MTMR4-209	ENST00000583656	NBPF4	Q96M43	638 aa		32.81	■■■□□ 2.84
MTMR4-209	ENST00000583656	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		32.8	■■■□□ 2.84
MTMR4-209	ENST00000583656	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	32.8	■■■□□ 2.84
MTMR4-209	ENST00000583656	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		32.79	■■■□□ 2.84
MTMR4-209	ENST00000583656	BAG6	P46379	1132 aa		32.77	■■■□□ 2.84
MTMR4-209	ENST00000583656	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	32.77	■■■□□ 2.84
MTMR4-209	ENST00000583656	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		32.77	■■■□□ 2.84
MTMR4-209	ENST00000583656	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	32.76	■■■□□ 2.83
MTMR4-209	ENST00000583656	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	32.76	■■■□□ 2.83
MTMR4-209	ENST00000583656	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	32.75	■■■□□ 2.83
MTMR4-209	ENST00000583656	TNS2	Q63HR2	1409 aa		32.74	■■■□□ 2.83
MTMR4-209	ENST00000583656	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		32.73	■■■□□ 2.83
MTMR4-209	ENST00000583656	APBA3	O96018	575 aa		32.72	■■■□□ 2.83
MTMR4-209	ENST00000583656	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	32.72	■■■□□ 2.83
MTMR4-209	ENST00000583656	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		32.71	■■■□□ 2.83
MTMR4-209	ENST00000583656	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	32.68	■■■□□ 2.82
MTMR4-209	ENST00000583656	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		32.68	■■■□□ 2.82
MTMR4-209	ENST00000583656	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	32.66	■■■□□ 2.82
MTMR4-209	ENST00000583656	MEGF6	O75095	1541 aa		32.66	■■■□□ 2.82
MTMR4-209	ENST00000583656	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	32.65	■■■□□ 2.82
MTMR4-209	ENST00000583656	EYA1	Q99502	592 aa		32.65	■■■□□ 2.82
MTMR4-209	ENST00000583656	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	32.64	■■■□□ 2.82
MTMR4-209	ENST00000583656	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	32.64	■■■□□ 2.82
MTMR4-209	ENST00000583656	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	32.63	■■■□□ 2.81
MTMR4-209	ENST00000583656	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	32.63	■■■□□ 2.81
MTMR4-209	ENST00000583656	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		32.63	■■■□□ 2.81
MTMR4-209	ENST00000583656	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		32.62	■■■□□ 2.81
MTMR4-209	ENST00000583656	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	32.62	■■■□□ 2.81
MTMR4-209	ENST00000583656	BCL9	O00512	1426 aa		32.61	■■■□□ 2.81

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.5 ms