RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572078.1

SPNS3-202, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

TSL 3

Gene SPNS3, Length 463 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-202ENST00000572078 NFAT5O94916 1531 aa19.71■□□□□ 0.75
SPNS3-202ENST00000572078 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP19.71■□□□□ 0.75
SPNS3-202ENST00000572078 NBPF14Q5TI25 921 aa19.7■□□□□ 0.74
SPNS3-202ENST00000572078 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa19.7■□□□□ 0.74
SPNS3-202ENST00000572078 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP19.7■□□□□ 0.74
SPNS3-202ENST00000572078 SIN3AQ96ST3 1273 aa19.7■□□□□ 0.74
SPNS3-202ENST00000572078 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa19.7■□□□□ 0.74
SPNS3-202ENST00000572078 WDR17Q8IZU2 1322 aa19.7■□□□□ 0.74
SPNS3-202ENST00000572078 DDB1Q16531 1140 aa19.69■□□□□ 0.74
SPNS3-202ENST00000572078 ARHGEF25Q86VW2 580 aa19.69■□□□□ 0.74
SPNS3-202ENST00000572078 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP19.68■□□□□ 0.74
SPNS3-202ENST00000572078 EVC2Q86UK5 1308 aa19.68■□□□□ 0.74
SPNS3-202ENST00000572078 SOX12O15370 315 aa19.67■□□□□ 0.74
SPNS3-202ENST00000572078 PROM2Q8N271 834 aa19.67■□□□□ 0.74
SPNS3-202ENST00000572078 MON2Q7Z3U7 1717 aa19.67■□□□□ 0.74
SPNS3-202ENST00000572078 PLSCR1O15162 318 aa19.66■□□□□ 0.74
SPNS3-202ENST00000572078 BCL9O00512 1426 aa19.66■□□□□ 0.74
SPNS3-202ENST00000572078 KCNQ2O43526 872 aa19.65■□□□□ 0.74
SPNS3-202ENST00000572078 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP19.65■□□□□ 0.74
SPNS3-202ENST00000572078 SPON1Q9HCB6 807 aa19.64■□□□□ 0.73
SPNS3-202ENST00000572078 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP19.64■□□□□ 0.73
SPNS3-202ENST00000572078 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP19.63■□□□□ 0.73
SPNS3-202ENST00000572078 USP54Q70EL1 1684 aa19.62■□□□□ 0.73
SPNS3-202ENST00000572078 CD163L1Q9NR16 1453 aa19.62■□□□□ 0.73
SPNS3-202ENST00000572078 CARD10Q9BWT7 1032 aa19.62■□□□□ 0.73
SPNS3-202ENST00000572078 MYOM1P52179 1685 aa19.62■□□□□ 0.73
SPNS3-202ENST00000572078 TTC21AQ8NDW8 1320 aa19.61■□□□□ 0.73
SPNS3-202ENST00000572078 ABCC6O95255 1503 aa19.61■□□□□ 0.73
SPNS3-202ENST00000572078 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP19.6■□□□□ 0.73
SPNS3-202ENST00000572078 NINLQ9Y2I6 1382 aa19.6■□□□□ 0.73
SPNS3-202ENST00000572078 KCNH5Q8NCM2 988 aa19.6■□□□□ 0.73
SPNS3-202ENST00000572078 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP19.6■□□□□ 0.73
SPNS3-202ENST00000572078 TNS2Q63HR2 1409 aa19.59■□□□□ 0.73
SPNS3-202ENST00000572078 NEUROD1Q13562 356 aa19.59■□□□□ 0.73
SPNS3-202ENST00000572078 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP19.59■□□□□ 0.73
SPNS3-202ENST00000572078 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP19.59■□□□□ 0.73
SPNS3-202ENST00000572078 LTN1O94822 1766 aa19.59■□□□□ 0.73
SPNS3-202ENST00000572078 NHSQ6T4R5 1651 aa19.59■□□□□ 0.73
SPNS3-202ENST00000572078 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa19.58■□□□□ 0.72
SPNS3-202ENST00000572078 YY1P25490 414 aa19.58■□□□□ 0.72
SPNS3-202ENST00000572078 USP31Q70CQ4 1352 aa19.57■□□□□ 0.72
SPNS3-202ENST00000572078 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa19.57■□□□□ 0.72
SPNS3-202ENST00000572078 PAPPAQ13219 1627 aa19.56■□□□□ 0.72
SPNS3-202ENST00000572078 ZBTB7AO95365 584 aa19.56■□□□□ 0.72
SPNS3-202ENST00000572078 PTGER2P43116 358 aa19.56■□□□□ 0.72
SPNS3-202ENST00000572078 TXNRD1Q16881 649 aa19.56■□□□□ 0.72
SPNS3-202ENST00000572078 NME9Q86XW9 330 aa19.56■□□□□ 0.72
SPNS3-202ENST00000572078 CCDC7Q96M83 1385 aa19.56■□□□□ 0.72
SPNS3-202ENST00000572078 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP19.55■□□□□ 0.72
SPNS3-202ENST00000572078 ERBB3P21860 1342 aa19.54■□□□□ 0.72
SPNS3-202ENST00000572078 EXOC5O00471 708 aa19.53■□□□□ 0.72
SPNS3-202ENST00000572078 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP19.52■□□□□ 0.72
SPNS3-202ENST00000572078 BTAF1O14981 1849 aa19.52■□□□□ 0.72
SPNS3-202ENST00000572078 SLC15A2Q16348 729 aa19.51■□□□□ 0.71
SPNS3-202ENST00000572078 ACSBG1Q96GR2 724 aa19.51■□□□□ 0.71
SPNS3-202ENST00000572078 SGIP1Q9BQI5 828 aa19.49■□□□□ 0.71
SPNS3-202ENST00000572078 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa19.49■□□□□ 0.71
SPNS3-202ENST00000572078 STK32BQ9NY57 414 aa19.49■□□□□ 0.71
SPNS3-202ENST00000572078 UTRNP46939 3433 aa19.49■□□□□ 0.71
SPNS3-202ENST00000572078 A0A1W2PP64 1363 aa19.48■□□□□ 0.71
SPNS3-202ENST00000572078 NLRP2Q9NX02 1062 aa19.48■□□□□ 0.71
SPNS3-202ENST00000572078 ANKRD24Q8TF21 1146 aa19.47■□□□□ 0.71
SPNS3-202ENST00000572078 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP19.46■□□□□ 0.71
SPNS3-202ENST00000572078 IL2RBP14784 551 aa19.46■□□□□ 0.71
SPNS3-202ENST00000572078 TMC1Q8TDI8 760 aa19.46■□□□□ 0.71
SPNS3-202ENST00000572078 CARD11Q9BXL7 1154 aa19.46■□□□□ 0.71
SPNS3-202ENST00000572078 ZNF827Q17R98 1081 aa19.45■□□□□ 0.7
SPNS3-202ENST00000572078 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP19.45■□□□□ 0.7
SPNS3-202ENST00000572078 LRRC4BQ9NT99 713 aa19.44■□□□□ 0.7
SPNS3-202ENST00000572078 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP19.43■□□□□ 0.7
SPNS3-202ENST00000572078 SYT17Q9BSW7 474 aa19.43■□□□□ 0.7
SPNS3-202ENST00000572078 MTFR1LQ9H019 292 aa19.43■□□□□ 0.7
SPNS3-202ENST00000572078 SHANK3Q9BYB0 1731 aa19.42■□□□□ 0.7
SPNS3-202ENST00000572078 RGPD2P0DJD1 1756 aa19.42■□□□□ 0.7
SPNS3-202ENST00000572078 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP19.41■□□□□ 0.7
SPNS3-202ENST00000572078 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa19.41■□□□□ 0.7
SPNS3-202ENST00000572078 DCAF8L1A6NGE4 600 aa19.4■□□□□ 0.7
SPNS3-202ENST00000572078 FBLN1P23142 703 aa19.4■□□□□ 0.7
SPNS3-202ENST00000572078 DOT1LQ8TEK3 1739 aa19.39■□□□□ 0.7
SPNS3-202ENST00000572078 TESK2Q96S53 571 aa19.39■□□□□ 0.69
SPNS3-202ENST00000572078 COL24A1Q17RW2 1714 aa19.38■□□□□ 0.69
SPNS3-202ENST00000572078 QSER1Q2KHR3 1735 aa19.38■□□□□ 0.69
SPNS3-202ENST00000572078 KAT6BQ8WYB5 2073 aa19.38■□□□□ 0.69
SPNS3-202ENST00000572078 IP6K1Q92551 441 aa19.38■□□□□ 0.69
SPNS3-202ENST00000572078 NSD2O96028 1365 aa19.37■□□□□ 0.69
SPNS3-202ENST00000572078 AKT1S1Q96B36 256 aa19.37■□□□□ 0.69
SPNS3-202ENST00000572078 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP19.37■□□□□ 0.69
SPNS3-202ENST00000572078 TERF2IPQ9NYB0 399 aa19.37■□□□□ 0.69
SPNS3-202ENST00000572078 MEGF6O75095 1541 aa19.36■□□□□ 0.69
SPNS3-202ENST00000572078 MAP3K19Q56UN5 1328 aa19.36■□□□□ 0.69
SPNS3-202ENST00000572078 KCNQ4P56696 695 aa19.36■□□□□ 0.69
SPNS3-202ENST00000572078 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP19.36■□□□□ 0.69
SPNS3-202ENST00000572078 LY75O60449 1722 aa19.36■□□□□ 0.69
SPNS3-202ENST00000572078 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP19.35■□□□□ 0.69
SPNS3-202ENST00000572078 ARXQ96QS3 562 aa19.35■□□□□ 0.69
SPNS3-202ENST00000572078 MAP3K5Q99683 1374 aa19.34■□□□□ 0.69
SPNS3-202ENST00000572078 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP19.34■□□□□ 0.69
SPNS3-202ENST00000572078 CHD4Q14839 1912 aa19.33■□□□□ 0.69
SPNS3-202ENST00000572078 TONSLQ96HA7 1378 aa19.33■□□□□ 0.69
SPNS3-202ENST00000572078 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa19.33■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.4 ms