RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568586.5

RAB40C-211, Transcript of RAB40C, member RAS oncogene family, human

TSL 2

Gene RAB40C, Length 648 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAB40C-211	ENST00000568586	USP35	Q9P2H5	1018 aa		41.18	■■■■■ 4.18
RAB40C-211	ENST00000568586	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		41.17	■■■■■ 4.18
RAB40C-211	ENST00000568586	CDCA8	Q53HL2	280 aa		41.17	■■■■■ 4.18
RAB40C-211	ENST00000568586	ABCC6	O95255	1503 aa		41.17	■■■■■ 4.18
RAB40C-211	ENST00000568586	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		41.16	■■■■■ 4.18
RAB40C-211	ENST00000568586	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		41.15	■■■■■ 4.18
RAB40C-211	ENST00000568586	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		41.15	■■■■■ 4.18
RAB40C-211	ENST00000568586	SOX12	O15370	315 aa		41.13	■■■■■ 4.17
RAB40C-211	ENST00000568586	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		41.13	■■■■■ 4.17
RAB40C-211	ENST00000568586	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	41.05	■■■■■ 4.16
RAB40C-211	ENST00000568586	FAM182B	Q5T319	152 aa		41.05	■■■■■ 4.16
RAB40C-211	ENST00000568586	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		41.05	■■■■■ 4.16
RAB40C-211	ENST00000568586	RGPD5	Q99666	1765 aa		41.02	■■■■■ 4.16
RAB40C-211	ENST00000568586	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	41.02	■■■■■ 4.16
RAB40C-211	ENST00000568586	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		41.02	■■■■■ 4.16
RAB40C-211	ENST00000568586	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		41.02	■■■■■ 4.16
RAB40C-211	ENST00000568586	PDE3B	Q13370	1112 aa		41.01	■■■■■ 4.16
RAB40C-211	ENST00000568586	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		41	■■■■■ 4.15
RAB40C-211	ENST00000568586	COG3	Q96JB2	828 aa		40.97	■■■■■ 4.15
RAB40C-211	ENST00000568586	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	40.96	■■■■■ 4.15
RAB40C-211	ENST00000568586	LTN1	O94822	1766 aa		40.95	■■■■■ 4.15
RAB40C-211	ENST00000568586	FYB1	O15117	783 aa		40.95	■■■■■ 4.15
RAB40C-211	ENST00000568586	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	40.95	■■■■■ 4.15	1e-6	■■■■□ 25.9
RAB40C-211	ENST00000568586	ERBB3	P21860	1342 aa		40.94	■■■■■ 4.15
RAB40C-211	ENST00000568586	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		40.94	■■■■■ 4.14
RAB40C-211	ENST00000568586	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		40.94	■■■■■ 4.14
RAB40C-211	ENST00000568586	DISP2	A7MBM2	1401 aa		40.93	■■■■■ 4.14
RAB40C-211	ENST00000568586	MYOM1	P52179	1685 aa		40.93	■■■■■ 4.14
RAB40C-211	ENST00000568586	CCDC7	Q96M83	1385 aa		40.92	■■■■■ 4.14
RAB40C-211	ENST00000568586	BAG6	P46379	1132 aa		40.92	■■■■■ 4.14
RAB40C-211	ENST00000568586	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	40.9	■■■■■ 4.14
RAB40C-211	ENST00000568586	IP6K1	Q92551	441 aa		40.9	■■■■■ 4.14
RAB40C-211	ENST00000568586	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		40.89	■■■■■ 4.14
RAB40C-211	ENST00000568586	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	40.88	■■■■■ 4.13
RAB40C-211	ENST00000568586	DDB1	Q16531	1140 aa		40.88	■■■■■ 4.13
RAB40C-211	ENST00000568586	LRRC37A3	O60309	1634 aa		40.88	■■■■■ 4.13
RAB40C-211	ENST00000568586	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		40.88	■■■■■ 4.13
RAB40C-211	ENST00000568586	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	40.87	■■■■■ 4.13
RAB40C-211	ENST00000568586	TRIM37	O94972	964 aa		40.85	■■■■■ 4.13
RAB40C-211	ENST00000568586	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		40.85	■■■■■ 4.13
RAB40C-211	ENST00000568586	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		40.84	■■■■■ 4.13
RAB40C-211	ENST00000568586	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		40.84	■■■■■ 4.13
RAB40C-211	ENST00000568586	PEAK1	Q9H792	1746 aa		40.83	■■■■■ 4.13
RAB40C-211	ENST00000568586	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		40.8	■■■■■ 4.12
RAB40C-211	ENST00000568586	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	40.8	■■■■■ 4.12
RAB40C-211	ENST00000568586	BCL9	O00512	1426 aa		40.79	■■■■■ 4.12
RAB40C-211	ENST00000568586	FBLN1	P23142	703 aa		40.79	■■■■■ 4.12
RAB40C-211	ENST00000568586	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		40.79	■■■■■ 4.12
RAB40C-211	ENST00000568586	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		40.79	■■■■■ 4.12
RAB40C-211	ENST00000568586	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		40.77	■■■■■ 4.12
RAB40C-211	ENST00000568586	HOXC9	P31274	260 aa		40.77	■■■■■ 4.12
RAB40C-211	ENST00000568586	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	40.76	■■■■■ 4.12
RAB40C-211	ENST00000568586	RTL1	A6NKG5	1358 aa		40.75	■■■■■ 4.11
RAB40C-211	ENST00000568586	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		40.75	■■■■■ 4.11
RAB40C-211	ENST00000568586	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		40.74	■■■■■ 4.11
RAB40C-211	ENST00000568586	EXOC5	O00471	708 aa		40.74	■■■■■ 4.11
RAB40C-211	ENST00000568586	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		40.73	■■■■■ 4.11
RAB40C-211	ENST00000568586	APBA3	O96018	575 aa		40.72	■■■■■ 4.11
RAB40C-211	ENST00000568586	AMPH	P49418	695 aa		40.72	■■■■■ 4.11
RAB40C-211	ENST00000568586	TNS2	Q63HR2	1409 aa		40.7	■■■■■ 4.11
RAB40C-211	ENST00000568586	IL2RB	P14784	551 aa		40.7	■■■■■ 4.11
RAB40C-211	ENST00000568586	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	40.69	■■■■■ 4.1
RAB40C-211	ENST00000568586	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	40.69	■■■■■ 4.1
RAB40C-211	ENST00000568586	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		40.69	■■■■■ 4.1
RAB40C-211	ENST00000568586	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	40.68	■■■■■ 4.1
RAB40C-211	ENST00000568586	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		40.67	■■■■■ 4.1
RAB40C-211	ENST00000568586	SBF2	Q86WG5	1849 aa		40.65	■■■■■ 4.1
RAB40C-211	ENST00000568586	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	40.64	■■■■■ 4.1
RAB40C-211	ENST00000568586	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		40.63	■■■■■ 4.09
RAB40C-211	ENST00000568586	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	40.63	■■■■■ 4.09
RAB40C-211	ENST00000568586	INSR	P06213	1382 aa		40.6	■■■■■ 4.09
RAB40C-211	ENST00000568586	FLT4	P35916	1363 aa		40.58	■■■■■ 4.09
RAB40C-211	ENST00000568586	PLSCR1	O15162	318 aa		40.57	■■■■■ 4.09
RAB40C-211	ENST00000568586	PANK3	Q9H999	370 aa		40.57	■■■■■ 4.09
RAB40C-211	ENST00000568586	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		40.55	■■■■■ 4.08
RAB40C-211	ENST00000568586	RREB1	Q92766	1687 aa		40.54	■■■■■ 4.08
RAB40C-211	ENST00000568586	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		40.54	■■■■■ 4.08
RAB40C-211	ENST00000568586	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		40.53	■■■■■ 4.08
RAB40C-211	ENST00000568586	NBPF4	Q96M43	638 aa		40.53	■■■■■ 4.08
RAB40C-211	ENST00000568586	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	40.51	■■■■■ 4.08
RAB40C-211	ENST00000568586	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		40.51	■■■■■ 4.08
RAB40C-211	ENST00000568586	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		40.51	■■■■■ 4.08
RAB40C-211	ENST00000568586	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	40.5	■■■■■ 4.07
RAB40C-211	ENST00000568586	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		40.48	■■■■■ 4.07
RAB40C-211	ENST00000568586	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		40.48	■■■■■ 4.07
RAB40C-211	ENST00000568586	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		40.45	■■■■■ 4.07
RAB40C-211	ENST00000568586	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	40.45	■■■■■ 4.07
RAB40C-211	ENST00000568586	NSD2	O96028	1365 aa		40.45	■■■■■ 4.07
RAB40C-211	ENST00000568586	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		40.45	■■■■■ 4.07
RAB40C-211	ENST00000568586	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		40.44	■■■■■ 4.06
RAB40C-211	ENST00000568586	POLK	Q9UBT6	870 aa		40.44	■■■■■ 4.06
RAB40C-211	ENST00000568586	MEGF6	O75095	1541 aa		40.43	■■■■■ 4.06
RAB40C-211	ENST00000568586	KCNQ2	O43526	872 aa		40.42	■■■■■ 4.06
RAB40C-211	ENST00000568586	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	40.42	■■■■■ 4.06
RAB40C-211	ENST00000568586	NHS	Q6T4R5	1651 aa		40.41	■■■■■ 4.06
RAB40C-211	ENST00000568586	PROM2	Q8N271	834 aa		40.39	■■■■■ 4.06
RAB40C-211	ENST00000568586	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	40.39	■■■■■ 4.06
RAB40C-211	ENST00000568586	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	40.39	■■■■■ 4.06
RAB40C-211	ENST00000568586	NCAPD2	Q15021	1401 aa		40.38	■■■■■ 4.05
RAB40C-211	ENST00000568586	NBPF14	Q5TI25	921 aa		40.37	■■■■■ 4.05

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