RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563028.1

KIFC3-213, Transcript of kinesin family member C3, human

TSL 4

Gene KIFC3, Length 681 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KIFC3-213	ENST00000563028	COL18A1	P39060	1754 aa		32.86	■■■□□ 2.85
KIFC3-213	ENST00000563028	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	32.85	■■■□□ 2.85
KIFC3-213	ENST00000563028	CRB1	P82279	1406 aa		32.85	■■■□□ 2.85
KIFC3-213	ENST00000563028	NFAT5	O94916	1531 aa		32.84	■■■□□ 2.85
KIFC3-213	ENST00000563028	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		32.82	■■■□□ 2.84
KIFC3-213	ENST00000563028	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		32.8	■■■□□ 2.84
KIFC3-213	ENST00000563028	USP54	Q70EL1	1684 aa		32.8	■■■□□ 2.84
KIFC3-213	ENST00000563028	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		32.78	■■■□□ 2.84
KIFC3-213	ENST00000563028	PDE3B	Q13370	1112 aa		32.78	■■■□□ 2.84
KIFC3-213	ENST00000563028	CDCA8	Q53HL2	280 aa		32.77	■■■□□ 2.84
KIFC3-213	ENST00000563028	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		32.75	■■■□□ 2.83
KIFC3-213	ENST00000563028	RGPD5	Q99666	1765 aa		32.75	■■■□□ 2.83
KIFC3-213	ENST00000563028	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		32.74	■■■□□ 2.83
KIFC3-213	ENST00000563028	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		32.74	■■■□□ 2.83
KIFC3-213	ENST00000563028	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		32.73	■■■□□ 2.83
KIFC3-213	ENST00000563028	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		32.73	■■■□□ 2.83
KIFC3-213	ENST00000563028	BAG6	P46379	1132 aa		32.72	■■■□□ 2.83
KIFC3-213	ENST00000563028	ABCC6	O95255	1503 aa		32.71	■■■□□ 2.83
KIFC3-213	ENST00000563028	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		32.69	■■■□□ 2.82
KIFC3-213	ENST00000563028	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	32.69	■■■□□ 2.82
KIFC3-213	ENST00000563028	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		32.69	■■■□□ 2.82
KIFC3-213	ENST00000563028	COG3	Q96JB2	828 aa		32.68	■■■□□ 2.82
KIFC3-213	ENST00000563028	TRIM37	O94972	964 aa		32.67	■■■□□ 2.82
KIFC3-213	ENST00000563028	LTN1	O94822	1766 aa		32.66	■■■□□ 2.82
KIFC3-213	ENST00000563028	DDB1	Q16531	1140 aa		32.64	■■■□□ 2.82
KIFC3-213	ENST00000563028	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	32.63	■■■□□ 2.81
KIFC3-213	ENST00000563028	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	32.63	■■■□□ 2.81
KIFC3-213	ENST00000563028	ERBB3	P21860	1342 aa		32.62	■■■□□ 2.81
KIFC3-213	ENST00000563028	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	32.61	■■■□□ 2.81
KIFC3-213	ENST00000563028	LRRC37A3	O60309	1634 aa		32.61	■■■□□ 2.81
KIFC3-213	ENST00000563028	CCDC7	Q96M83	1385 aa		32.6	■■■□□ 2.81
KIFC3-213	ENST00000563028	FYB1	O15117	783 aa		32.6	■■■□□ 2.81
KIFC3-213	ENST00000563028	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		32.6	■■■□□ 2.81
KIFC3-213	ENST00000563028	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	32.59	■■■□□ 2.81
KIFC3-213	ENST00000563028	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		32.59	■■■□□ 2.81
KIFC3-213	ENST00000563028	DISP2	A7MBM2	1401 aa		32.59	■■■□□ 2.81
KIFC3-213	ENST00000563028	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		32.58	■■■□□ 2.81
KIFC3-213	ENST00000563028	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		32.58	■■■□□ 2.81
KIFC3-213	ENST00000563028	APBA3	O96018	575 aa		32.57	■■■□□ 2.8
KIFC3-213	ENST00000563028	IP6K1	Q92551	441 aa		32.57	■■■□□ 2.8
KIFC3-213	ENST00000563028	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	32.56	■■■□□ 2.8
KIFC3-213	ENST00000563028	FBLN1	P23142	703 aa		32.56	■■■□□ 2.8
KIFC3-213	ENST00000563028	MYOM1	P52179	1685 aa		32.56	■■■□□ 2.8
KIFC3-213	ENST00000563028	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		32.55	■■■□□ 2.8
KIFC3-213	ENST00000563028	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	32.55	■■■□□ 2.8
KIFC3-213	ENST00000563028	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		32.54	■■■□□ 2.8
KIFC3-213	ENST00000563028	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		32.54	■■■□□ 2.8
KIFC3-213	ENST00000563028	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	32.53	■■■□□ 2.8
KIFC3-213	ENST00000563028	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		32.53	■■■□□ 2.8
KIFC3-213	ENST00000563028	EXOC5	O00471	708 aa		32.52	■■■□□ 2.8
KIFC3-213	ENST00000563028	AMPH	P49418	695 aa		32.52	■■■□□ 2.8
KIFC3-213	ENST00000563028	PEAK1	Q9H792	1746 aa		32.51	■■■□□ 2.8
KIFC3-213	ENST00000563028	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	32.51	■■■□□ 2.79
KIFC3-213	ENST00000563028	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	32.51	■■■□□ 2.79
KIFC3-213	ENST00000563028	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		32.51	■■■□□ 2.79
KIFC3-213	ENST00000563028	HOXC9	P31274	260 aa		32.5	■■■□□ 2.79
KIFC3-213	ENST00000563028	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		32.5	■■■□□ 2.79
KIFC3-213	ENST00000563028	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		32.47	■■■□□ 2.79
KIFC3-213	ENST00000563028	IL2RB	P14784	551 aa		32.47	■■■□□ 2.79
KIFC3-213	ENST00000563028	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	32.47	■■■□□ 2.79
KIFC3-213	ENST00000563028	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		32.45	■■■□□ 2.78
KIFC3-213	ENST00000563028	TNS2	Q63HR2	1409 aa		32.44	■■■□□ 2.78
KIFC3-213	ENST00000563028	RTL1	A6NKG5	1358 aa		32.43	■■■□□ 2.78
KIFC3-213	ENST00000563028	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	32.42	■■■□□ 2.78
KIFC3-213	ENST00000563028	BCL9	O00512	1426 aa		32.42	■■■□□ 2.78
KIFC3-213	ENST00000563028	SBF2	Q86WG5	1849 aa		32.41	■■■□□ 2.78
KIFC3-213	ENST00000563028	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	32.4	■■■□□ 2.78
KIFC3-213	ENST00000563028	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	32.4	■■■□□ 2.78
KIFC3-213	ENST00000563028	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		32.38	■■■□□ 2.77
KIFC3-213	ENST00000563028	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		32.37	■■■□□ 2.77
KIFC3-213	ENST00000563028	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	32.36	■■■□□ 2.77
KIFC3-213	ENST00000563028	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		32.35	■■■□□ 2.77
KIFC3-213	ENST00000563028	RREB1	Q92766	1687 aa		32.34	■■■□□ 2.77
KIFC3-213	ENST00000563028	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		32.33	■■■□□ 2.77
KIFC3-213	ENST00000563028	PLSCR1	O15162	318 aa		32.32	■■■□□ 2.76
KIFC3-213	ENST00000563028	PANK3	Q9H999	370 aa		32.32	■■■□□ 2.76
KIFC3-213	ENST00000563028	FLT4	P35916	1363 aa		32.32	■■■□□ 2.76
KIFC3-213	ENST00000563028	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		32.32	■■■□□ 2.76
KIFC3-213	ENST00000563028	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		32.31	■■■□□ 2.76
KIFC3-213	ENST00000563028	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	32.31	■■■□□ 2.76
KIFC3-213	ENST00000563028	INSR	P06213	1382 aa		32.31	■■■□□ 2.76
KIFC3-213	ENST00000563028	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		32.3	■■■□□ 2.76
KIFC3-213	ENST00000563028	NBPF4	Q96M43	638 aa		32.3	■■■□□ 2.76
KIFC3-213	ENST00000563028	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		32.3	■■■□□ 2.76
KIFC3-213	ENST00000563028	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		32.29	■■■□□ 2.76
KIFC3-213	ENST00000563028	KCNQ2	O43526	872 aa		32.28	■■■□□ 2.76
KIFC3-213	ENST00000563028	NBPF14	Q5TI25	921 aa		32.28	■■■□□ 2.76
KIFC3-213	ENST00000563028	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		32.28	■■■□□ 2.76
KIFC3-213	ENST00000563028	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	32.27	■■■□□ 2.76
KIFC3-213	ENST00000563028	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	32.26	■■■□□ 2.75
KIFC3-213	ENST00000563028	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		32.26	■■■□□ 2.75
KIFC3-213	ENST00000563028	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	32.26	■■■□□ 2.75
KIFC3-213	ENST00000563028	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		32.26	■■■□□ 2.75
KIFC3-213	ENST00000563028	MEGF6	O75095	1541 aa		32.23	■■■□□ 2.75
KIFC3-213	ENST00000563028	NHS	Q6T4R5	1651 aa		32.22	■■■□□ 2.75
KIFC3-213	ENST00000563028	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	32.22	■■■□□ 2.75
KIFC3-213	ENST00000563028	PROM2	Q8N271	834 aa		32.21	■■■□□ 2.75
KIFC3-213	ENST00000563028	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	32.2	■■■□□ 2.75
KIFC3-213	ENST00000563028	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		32.2	■■■□□ 2.75
KIFC3-213	ENST00000563028	POLK	Q9UBT6	870 aa		32.19	■■■□□ 2.74

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