RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	DCAF5	Q96JK2	942 aa		7	□□□□□ -1.29
AKAP13-223	ENST00000560957	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		7	□□□□□ -1.29
AKAP13-223	ENST00000560957	ITGB2	P05107	769 aa		6.99	□□□□□ -1.29
AKAP13-223	ENST00000560957	CELA2B	P08218	269 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
AKAP13-223	ENST00000560957	HRC	P23327	699 aa		6.99	□□□□□ -1.29
AKAP13-223	ENST00000560957	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		6.99	□□□□□ -1.29
AKAP13-223	ENST00000560957	NBPF14	Q5TI25	921 aa		6.99	□□□□□ -1.29
AKAP13-223	ENST00000560957	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		6.99	□□□□□ -1.29
AKAP13-223	ENST00000560957	ENAM	Q9NRM1	1142 aa		6.99	□□□□□ -1.29
AKAP13-223	ENST00000560957	PGPEP1	Q9NXJ5	209 aa		6.99	□□□□□ -1.29
AKAP13-223	ENST00000560957	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		6.98	□□□□□ -1.29
AKAP13-223	ENST00000560957	PROC	P04070	461 aa		6.98	□□□□□ -1.29
AKAP13-223	ENST00000560957	CBLB	Q13191	982 aa		6.98	□□□□□ -1.29
AKAP13-223	ENST00000560957	PPP1R26	Q5T8A7	1209 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
AKAP13-223	ENST00000560957	PRPF38B	Q5VTL8	546 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
AKAP13-223	ENST00000560957	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		6.98	□□□□□ -1.29
AKAP13-223	ENST00000560957	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		6.97	□□□□□ -1.29
AKAP13-223	ENST00000560957	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
AKAP13-223	ENST00000560957	TBC1D2	Q9BYX2	928 aa		6.97	□□□□□ -1.29
AKAP13-223	ENST00000560957	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
AKAP13-223	ENST00000560957	GAS6	Q14393	721 aa		6.96	□□□□□ -1.3
AKAP13-223	ENST00000560957	AMHR2	Q16671	573 aa		6.96	□□□□□ -1.3
AKAP13-223	ENST00000560957	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		6.96	□□□□□ -1.3
AKAP13-223	ENST00000560957	CTSO	P43234	321 aa	Predicted RBP	6.95	□□□□□ -1.3
AKAP13-223	ENST00000560957	MAGEB6P1	A0A0J9YX57	407 aa		6.94	□□□□□ -1.3
AKAP13-223	ENST00000560957	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	6.94	□□□□□ -1.3
AKAP13-223	ENST00000560957	BEND7	Q8N7W2	519 aa	Predicted RBP	6.94	□□□□□ -1.3
AKAP13-223	ENST00000560957	RNF217	Q8TC41	542 aa		6.94	□□□□□ -1.3
AKAP13-223	ENST00000560957	GPKOW	Q92917	476 aa	Predicted RBP eCLIP	6.94	□□□□□ -1.3
AKAP13-223	ENST00000560957		K7ELQ4	463 aa	Predicted RBP	6.93	□□□□□ -1.3
AKAP13-223	ENST00000560957	PLCB2	Q00722	1185 aa		6.93	□□□□□ -1.3
AKAP13-223	ENST00000560957	ERFE	Q4G0M1	354 aa		6.93	□□□□□ -1.3
AKAP13-223	ENST00000560957	GALNT6	Q8NCL4	622 aa		6.93	□□□□□ -1.3
AKAP13-223	ENST00000560957	INSM2	Q96T92	566 aa	Predicted RBP	6.93	□□□□□ -1.3
AKAP13-223	ENST00000560957	CNTNAP5	Q8WYK1	1306 aa		6.93	□□□□□ -1.3
AKAP13-223	ENST00000560957	KRTAP9-1	A8MXZ3	250 aa	Predicted RBP	6.92	□□□□□ -1.3
AKAP13-223	ENST00000560957	DHX9	Q08211	1270 aa	Known RBP	6.92	□□□□□ -1.3
AKAP13-223	ENST00000560957	PODN	Q7Z5L7	613 aa		6.92	□□□□□ -1.3
AKAP13-223	ENST00000560957	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		6.92	□□□□□ -1.3
AKAP13-223	ENST00000560957	PSMG3-AS1	Q96PY0	264 aa		6.92	□□□□□ -1.3
AKAP13-223	ENST00000560957	KRTAP9-2	Q9BYQ4	174 aa		6.92	□□□□□ -1.3
AKAP13-223	ENST00000560957	CDV3	Q9UKY7	258 aa	Known RBP	6.92	□□□□□ -1.3
AKAP13-223	ENST00000560957		Q8N3U1	123 aa		6.91	□□□□□ -1.3
AKAP13-223	ENST00000560957	AGBL1	Q96MI9	1066 aa		6.91	□□□□□ -1.3
AKAP13-223	ENST00000560957	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		6.91	□□□□□ -1.3
AKAP13-223	ENST00000560957	RELB	Q01201	579 aa		6.9	□□□□□ -1.3
AKAP13-223	ENST00000560957	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		6.9	□□□□□ -1.3
AKAP13-223	ENST00000560957	POLM	Q9NP87	494 aa	Predicted RBP	6.9	□□□□□ -1.3
AKAP13-223	ENST00000560957	MBIP	Q9NS73	344 aa		6.9	□□□□□ -1.3
AKAP13-223	ENST00000560957	CUEDC1	Q9NWM3	386 aa	Predicted RBP	6.9	□□□□□ -1.3
AKAP13-223	ENST00000560957	BCR	P11274	1271 aa		6.89	□□□□□ -1.31
AKAP13-223	ENST00000560957	GMCL1	Q96IK5	515 aa		6.89	□□□□□ -1.31
AKAP13-223	ENST00000560957	KCTD15	Q96SI1	283 aa	Predicted RBP	6.89	□□□□□ -1.31
AKAP13-223	ENST00000560957	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		6.89	□□□□□ -1.31
AKAP13-223	ENST00000560957	TUSC1	Q2TAM9	212 aa		6.88	□□□□□ -1.31
AKAP13-223	ENST00000560957	TSC1	Q92574	1164 aa		6.88	□□□□□ -1.31
AKAP13-223	ENST00000560957	IGF1R	P08069	1367 aa		6.87	□□□□□ -1.31
AKAP13-223	ENST00000560957	KRTAP9-6	A0A140TA67	174 aa		6.87	□□□□□ -1.31
AKAP13-223	ENST00000560957	FOXD4L5	Q5VV16	416 aa	Predicted RBP	6.87	□□□□□ -1.31
AKAP13-223	ENST00000560957	NEDD1	Q8NHV4	660 aa		6.87	□□□□□ -1.31
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		6.87	□□□□□ -1.31
AKAP13-223	ENST00000560957	BAG6	P46379	1132 aa		6.86	□□□□□ -1.31
AKAP13-223	ENST00000560957	INTS6L	Q5JSJ4	861 aa	Known RBP	6.86	□□□□□ -1.31
AKAP13-223	ENST00000560957	PDXDC2P	Q6P474	469 aa		6.86	□□□□□ -1.31
AKAP13-223	ENST00000560957	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	6.86	□□□□□ -1.31
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF837	Q96EG3	531 aa	Predicted RBP	6.86	□□□□□ -1.31
AKAP13-223	ENST00000560957	LILRB3	O75022	631 aa		6.85	□□□□□ -1.31
AKAP13-223	ENST00000560957	QPCT	Q16769	361 aa		6.85	□□□□□ -1.31
AKAP13-223	ENST00000560957	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		6.85	□□□□□ -1.31
AKAP13-223	ENST00000560957	LYSMD3	Q7Z3D4	306 aa		6.85	□□□□□ -1.31
AKAP13-223	ENST00000560957	TRIM22	Q8IYM9	498 aa		6.85	□□□□□ -1.31
AKAP13-223	ENST00000560957	ARHGAP9	Q9BRR9	750 aa		6.85	□□□□□ -1.31
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF395	Q9H8N7	513 aa	Predicted RBP	6.85	□□□□□ -1.31
AKAP13-223	ENST00000560957	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	6.84	□□□□□ -1.31
AKAP13-223	ENST00000560957	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	6.84	□□□□□ -1.31
AKAP13-223	ENST00000560957	ADH1A	P07327	375 aa		6.84	□□□□□ -1.31
AKAP13-223	ENST00000560957	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	6.84	□□□□□ -1.31
AKAP13-223	ENST00000560957	FOXR1	Q6PIV2	292 aa		6.84	□□□□□ -1.31
AKAP13-223	ENST00000560957	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		6.84	□□□□□ -1.31
AKAP13-223	ENST00000560957	ALYREF	Q86V81	257 aa	Known RBP	6.84	□□□□□ -1.31
AKAP13-223	ENST00000560957	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	6.84	□□□□□ -1.31
AKAP13-223	ENST00000560957	ACD	Q96AP0	544 aa		6.84	□□□□□ -1.31
AKAP13-223	ENST00000560957	PARP9	Q8IXQ6	854 aa		6.83	□□□□□ -1.32
AKAP13-223	ENST00000560957	LIMD1	Q9UGP4	676 aa		6.83	□□□□□ -1.32
AKAP13-223	ENST00000560957	KRBA1	A5PL33	1030 aa		6.82	□□□□□ -1.32
AKAP13-223	ENST00000560957	PTGIR	P43119	386 aa		6.82	□□□□□ -1.32
AKAP13-223	ENST00000560957	KDF1	Q8NAX2	398 aa	Predicted RBP	6.82	□□□□□ -1.32
AKAP13-223	ENST00000560957	GPR25	O00155	361 aa		6.81	□□□□□ -1.32
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	6.81	□□□□□ -1.32
AKAP13-223	ENST00000560957	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	6.8	□□□□□ -1.32
AKAP13-223	ENST00000560957	OIP5	O43482	229 aa		6.8	□□□□□ -1.32
AKAP13-223	ENST00000560957	LILRA1	O75019	489 aa		6.8	□□□□□ -1.32
AKAP13-223	ENST00000560957	ZMYND10	O75800	440 aa		6.8	□□□□□ -1.32
AKAP13-223	ENST00000560957	FURIN	P09958	794 aa		6.8	□□□□□ -1.32
AKAP13-223	ENST00000560957	RNF144A	P50876	292 aa	Predicted RBP	6.8	□□□□□ -1.32
AKAP13-223	ENST00000560957	MYSM1	Q5VVJ2	828 aa		6.8	□□□□□ -1.32
AKAP13-223	ENST00000560957	DHX30	Q7L2E3	1194 aa	Known RBP eCLIP	6.8	□□□□□ -1.32
AKAP13-223	ENST00000560957	ZBTB33	Q86T24	672 aa		6.8	□□□□□ -1.32
AKAP13-223	ENST00000560957	FKBPL	Q9UIM3	349 aa		6.8	□□□□□ -1.32
AKAP13-223	ENST00000560957	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		6.8	□□□□□ -1.32

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