RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558300.1

TMOD3-202, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 2

Gene TMOD3, Length 430 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-202ENST00000558300 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
TMOD3-202ENST00000558300 CCDC155Q8N6L0 562 aa8.69□□□□□ -1.02
TMOD3-202ENST00000558300 LILRB3O75022 631 aa8.68□□□□□ -1.02
TMOD3-202ENST00000558300 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP8.68□□□□□ -1.02
TMOD3-202ENST00000558300 ERFEQ4G0M1 354 aa8.66□□□□□ -1.02
TMOD3-202ENST00000558300 ITGA6P23229 1130 aa8.65□□□□□ -1.02
TMOD3-202ENST00000558300 FOXK2Q01167 660 aa8.65□□□□□ -1.02
TMOD3-202ENST00000558300 QPCTQ16769 361 aa8.65□□□□□ -1.02
TMOD3-202ENST00000558300 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
TMOD3-202ENST00000558300 KANK3Q6NY19 840 aa8.65□□□□□ -1.02
TMOD3-202ENST00000558300 WHAMMQ8TF30 809 aa8.65□□□□□ -1.02
TMOD3-202ENST00000558300 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
TMOD3-202ENST00000558300 LIMD1Q9UGP4 676 aa8.65□□□□□ -1.02
TMOD3-202ENST00000558300 SVOPQ8N4V2 548 aa8.64□□□□□ -1.03
TMOD3-202ENST00000558300 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa8.64□□□□□ -1.03
TMOD3-202ENST00000558300 TRIM66O15016 1216 aa8.63□□□□□ -1.03
TMOD3-202ENST00000558300 MYSM1Q5VVJ2 828 aa8.63□□□□□ -1.03
TMOD3-202ENST00000558300 CBLBQ13191 982 aa8.62□□□□□ -1.03
TMOD3-202ENST00000558300 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa8.61□□□□□ -1.03
TMOD3-202ENST00000558300 FIGNL2A6NMB9 653 aa8.61□□□□□ -1.03
TMOD3-202ENST00000558300 SV2AQ7L0J3 742 aa8.61□□□□□ -1.03
TMOD3-202ENST00000558300 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
TMOD3-202ENST00000558300 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa8.6□□□□□ -1.03
TMOD3-202ENST00000558300 IRS1P35568 1242 aa8.6□□□□□ -1.03
TMOD3-202ENST00000558300 PDXDC2PQ6P474 469 aa8.6□□□□□ -1.03
TMOD3-202ENST00000558300 VWA5B2Q8N398 1253 aa8.6□□□□□ -1.03
TMOD3-202ENST00000558300 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
TMOD3-202ENST00000558300 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa8.59□□□□□ -1.03
TMOD3-202ENST00000558300 GPAT2Q6NUI2 795 aa8.59□□□□□ -1.03
TMOD3-202ENST00000558300 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
TMOD3-202ENST00000558300 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
TMOD3-202ENST00000558300 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
TMOD3-202ENST00000558300 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
TMOD3-202ENST00000558300 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
TMOD3-202ENST00000558300 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
TMOD3-202ENST00000558300 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
TMOD3-202ENST00000558300 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
TMOD3-202ENST00000558300 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
TMOD3-202ENST00000558300 RNF217Q8TC41 542 aa8.58□□□□□ -1.04
TMOD3-202ENST00000558300 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
TMOD3-202ENST00000558300 TSC1Q92574 1164 aa8.56□□□□□ -1.04
TMOD3-202ENST00000558300 AK7Q96M32 723 aa8.56□□□□□ -1.04
TMOD3-202ENST00000558300 CARD14Q9BXL6 1004 aa8.56□□□□□ -1.04
TMOD3-202ENST00000558300 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
TMOD3-202ENST00000558300 ADAMTS2O95450 1211 aa8.55□□□□□ -1.04
TMOD3-202ENST00000558300 MARSP56192 900 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
TMOD3-202ENST00000558300 LYPD4Q6UWN0 246 aa8.55□□□□□ -1.04
TMOD3-202ENST00000558300 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
TMOD3-202ENST00000558300 GAS6Q14393 721 aa8.54□□□□□ -1.04
TMOD3-202ENST00000558300 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
TMOD3-202ENST00000558300 OCSTAMPQ9BR26 566 aa8.54□□□□□ -1.04
TMOD3-202ENST00000558300 FKBPLQ9UIM3 349 aa8.54□□□□□ -1.04
TMOD3-202ENST00000558300 CDC14CA4D256 554 aa8.53□□□□□ -1.04
TMOD3-202ENST00000558300 SLC10A4Q96EP9 437 aa8.53□□□□□ -1.04
TMOD3-202ENST00000558300 AGBL1Q96MI9 1066 aa8.53□□□□□ -1.04
TMOD3-202ENST00000558300 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa8.53□□□□□ -1.04
TMOD3-202ENST00000558300 GPSM3Q9Y4H4 160 aa8.53□□□□□ -1.04
TMOD3-202ENST00000558300 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
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TMOD3-202ENST00000558300 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
TMOD3-202ENST00000558300 ITGB2P05107 769 aa8.5□□□□□ -1.05
TMOD3-202ENST00000558300 RELBQ01201 579 aa8.5□□□□□ -1.05
TMOD3-202ENST00000558300 CTDSPL2Q05D32 466 aa8.5□□□□□ -1.05
TMOD3-202ENST00000558300 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
TMOD3-202ENST00000558300 LILRA1O75019 489 aa8.49□□□□□ -1.05
TMOD3-202ENST00000558300 ADH1AP07327 375 aa8.49□□□□□ -1.05
TMOD3-202ENST00000558300 PDE4DQ08499 809 aa8.49□□□□□ -1.05
TMOD3-202ENST00000558300 GMCL1Q96IK5 515 aa8.49□□□□□ -1.05
TMOD3-202ENST00000558300 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
TMOD3-202ENST00000558300 ADAM23O75077 832 aa8.48□□□□□ -1.05
TMOD3-202ENST00000558300 MAP3K10Q02779 954 aa8.48□□□□□ -1.05
TMOD3-202ENST00000558300 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa8.48□□□□□ -1.05
TMOD3-202ENST00000558300 XP32Q5T750 250 aa8.48□□□□□ -1.05
TMOD3-202ENST00000558300 PTGIRP43119 386 aa8.47□□□□□ -1.05
TMOD3-202ENST00000558300 ZBTB33Q86T24 672 aa8.47□□□□□ -1.05
TMOD3-202ENST00000558300 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
TMOD3-202ENST00000558300 DCAF5Q96JK2 942 aa8.47□□□□□ -1.05
TMOD3-202ENST00000558300 RSPH6AQ9H0K4 717 aa8.47□□□□□ -1.05
TMOD3-202ENST00000558300 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
TMOD3-202ENST00000558300 ENAMQ9NRM1 1142 aa8.47□□□□□ -1.05
TMOD3-202ENST00000558300 LRRC4BQ9NT99 713 aa8.47□□□□□ -1.05
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TMOD3-202ENST00000558300 ADD1P35611 737 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
TMOD3-202ENST00000558300 PTK2Q05397 1052 aa8.46□□□□□ -1.06
TMOD3-202ENST00000558300 NBPF20Q3BBV1 942 aa8.46□□□□□ -1.06
TMOD3-202ENST00000558300 SPOCK3Q9BQ16 436 aa8.46□□□□□ -1.06
TMOD3-202ENST00000558300 MBIPQ9NS73 344 aa8.46□□□□□ -1.06
TMOD3-202ENST00000558300 ESPNB1AK53 854 aa8.45□□□□□ -1.06
TMOD3-202ENST00000558300 PROCP04070 461 aa8.45□□□□□ -1.06
TMOD3-202ENST00000558300 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
TMOD3-202ENST00000558300 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa8.45□□□□□ -1.06
TMOD3-202ENST00000558300 TRIM22Q8IYM9 498 aa8.45□□□□□ -1.06
TMOD3-202ENST00000558300 ADAM32Q8TC27 787 aa8.45□□□□□ -1.06
TMOD3-202ENST00000558300 LRRN4Q8WUT4 740 aa8.45□□□□□ -1.06
TMOD3-202ENST00000558300 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa8.45□□□□□ -1.06
TMOD3-202ENST00000558300 PHF20L1A8MW92 1017 aa8.44□□□□□ -1.06
TMOD3-202ENST00000558300 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
TMOD3-202ENST00000558300 NR6A1Q15406 480 aa8.43□□□□□ -1.06
TMOD3-202ENST00000558300 PPP2R2DQ66LE6 453 aa8.43□□□□□ -1.06
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