RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558168.1

CYCSP2-201, Transcript of cytochrome c, somatic pseudogene 2, humanhuman

BASIC

Gene CYCSP2, Length 301 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYCSP2-201ENST00000558168 USP17L4A6NCW7 530 aa7.42□□□□□ -1.22
CYCSP2-201ENST00000558168 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
CYCSP2-201ENST00000558168 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
CYCSP2-201ENST00000558168 ARID5BQ14865 1188 aa7.42□□□□□ -1.22
CYCSP2-201ENST00000558168 USP17L2Q6R6M4 530 aa7.42□□□□□ -1.22
CYCSP2-201ENST00000558168 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
CYCSP2-201ENST00000558168 USP17L1Q7RTZ2 530 aa7.42□□□□□ -1.22
CYCSP2-201ENST00000558168 PLPP7Q8NBV4 271 aa7.42□□□□□ -1.22
CYCSP2-201ENST00000558168 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
CYCSP2-201ENST00000558168 RAB15P59190 212 aa7.41□□□□□ -1.22
CYCSP2-201ENST00000558168 RNF20Q5VTR2 975 aa7.41□□□□□ -1.22
CYCSP2-201ENST00000558168 DEPDC4Q8N2C3 294 aa7.41□□□□□ -1.22
CYCSP2-201ENST00000558168 DOLKQ9UPQ8 538 aa7.41□□□□□ -1.22
CYCSP2-201ENST00000558168 TLL2Q9Y6L7 1015 aa7.41□□□□□ -1.22
CYCSP2-201ENST00000558168 NCOA4Q13772 614 aa7.4□□□□□ -1.22
CYCSP2-201ENST00000558168 SPRYD7Q5W111 196 aa7.4□□□□□ -1.22
CYCSP2-201ENST00000558168 PHTF2Q8N3S3 785 aa7.4□□□□□ -1.22
CYCSP2-201ENST00000558168 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
CYCSP2-201ENST00000558168 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa7.4□□□□□ -1.22
CYCSP2-201ENST00000558168 WNT7AO00755 349 aa7.39□□□□□ -1.23
CYCSP2-201ENST00000558168 FSHRP23945 695 aa7.39□□□□□ -1.23
CYCSP2-201ENST00000558168 EML3Q32P44 896 aa7.39□□□□□ -1.23
CYCSP2-201ENST00000558168 MAP7D1Q3KQU3 841 aa7.39□□□□□ -1.23
CYCSP2-201ENST00000558168 CDCA8Q53HL2 280 aa7.39□□□□□ -1.23
CYCSP2-201ENST00000558168 ZNF697Q5TEC3 545 aa7.39□□□□□ -1.23
CYCSP2-201ENST00000558168 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa7.39□□□□□ -1.23
CYCSP2-201ENST00000558168 SEPT12Q8IYM1 358 aa7.39□□□□□ -1.23
CYCSP2-201ENST00000558168 PRKD2Q9BZL6 878 aa7.39□□□□□ -1.23
CYCSP2-201ENST00000558168 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
CYCSP2-201ENST00000558168 ESPNB1AK53 854 aa7.38□□□□□ -1.23
CYCSP2-201ENST00000558168 OXLD1Q5BKU9 147 aa7.38□□□□□ -1.23
CYCSP2-201ENST00000558168 MRGPRX2Q96LB1 330 aa7.38□□□□□ -1.23
CYCSP2-201ENST00000558168 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
CYCSP2-201ENST00000558168 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa7.38□□□□□ -1.23
CYCSP2-201ENST00000558168 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
CYCSP2-201ENST00000558168 RETREG2Q8NC44 543 aa7.37□□□□□ -1.23
CYCSP2-201ENST00000558168 VRTNQ9H8Y1 702 aa7.37□□□□□ -1.23
CYCSP2-201ENST00000558168 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
CYCSP2-201ENST00000558168 FOXC1Q12948 553 aa7.36□□□□□ -1.23
CYCSP2-201ENST00000558168 TSGA10IPQ3SY00 556 aa7.36□□□□□ -1.23
CYCSP2-201ENST00000558168 TRAF7Q6Q0C0 670 aa7.36□□□□□ -1.23
CYCSP2-201ENST00000558168 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
CYCSP2-201ENST00000558168 CDK15Q96Q40 435 aa7.36□□□□□ -1.23
CYCSP2-201ENST00000558168 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
CYCSP2-201ENST00000558168 CHIC2Q9UKJ5 165 aa7.36□□□□□ -1.23
CYCSP2-201ENST00000558168 V9GY48 417 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
CYCSP2-201ENST00000558168 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa7.35□□□□□ -1.23
CYCSP2-201ENST00000558168 SIAH2O43255 324 aa7.35□□□□□ -1.23
CYCSP2-201ENST00000558168 ADH1CP00326 375 aa7.35□□□□□ -1.23
CYCSP2-201ENST00000558168 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa7.35□□□□□ -1.23
CYCSP2-201ENST00000558168 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CYCSP2-201ENST00000558168 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
CYCSP2-201ENST00000558168 CCDC125Q86Z20 511 aa7.35□□□□□ -1.23
CYCSP2-201ENST00000558168 ERVH48-1M5A8F1 160 aa7.34□□□□□ -1.23
CYCSP2-201ENST00000558168 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
CYCSP2-201ENST00000558168 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
CYCSP2-201ENST00000558168 NOD1Q9Y239 953 aa7.34□□□□□ -1.23
CYCSP2-201ENST00000558168 ATG7O95352 703 aa7.33□□□□□ -1.24
CYCSP2-201ENST00000558168 ALDH1A1P00352 501 aa7.33□□□□□ -1.24
CYCSP2-201ENST00000558168 MYCP01106 439 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
CYCSP2-201ENST00000558168 RASA1P20936 1047 aa7.33□□□□□ -1.24
CYCSP2-201ENST00000558168 GRM5P41594 1212 aa7.33□□□□□ -1.24
CYCSP2-201ENST00000558168 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
CYCSP2-201ENST00000558168 TRIM50Q86XT4 487 aa7.33□□□□□ -1.24
CYCSP2-201ENST00000558168 MPNDQ8N594 471 aa7.33□□□□□ -1.24
CYCSP2-201ENST00000558168 SIRT1Q96EB6 747 aa7.33□□□□□ -1.24
CYCSP2-201ENST00000558168 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
CYCSP2-201ENST00000558168 USP17L15C9J2P7 530 aa7.32□□□□□ -1.24
CYCSP2-201ENST00000558168 USP17L10C9JJH3 530 aa7.32□□□□□ -1.24
CYCSP2-201ENST00000558168 USP17L13C9JLJ4 530 aa7.32□□□□□ -1.24
CYCSP2-201ENST00000558168 USP17L12C9JPN9 530 aa7.32□□□□□ -1.24
CYCSP2-201ENST00000558168 USP17L11C9JVI0 530 aa7.32□□□□□ -1.24
CYCSP2-201ENST00000558168 USP17L21D6R901 530 aa7.32□□□□□ -1.24
CYCSP2-201ENST00000558168 USP17L18D6R9N7 530 aa7.32□□□□□ -1.24
CYCSP2-201ENST00000558168 USP17L22D6RA61 530 aa7.32□□□□□ -1.24
CYCSP2-201ENST00000558168 USP17L17D6RBQ6 530 aa7.32□□□□□ -1.24
CYCSP2-201ENST00000558168 USP17L19D6RCP7 530 aa7.32□□□□□ -1.24
CYCSP2-201ENST00000558168 USP17L20D6RJB6 530 aa7.32□□□□□ -1.24
CYCSP2-201ENST00000558168 ATP1A2P50993 1020 aa7.32□□□□□ -1.24
CYCSP2-201ENST00000558168 USP17L24Q0WX57 530 aa7.32□□□□□ -1.24
CYCSP2-201ENST00000558168 USP4Q13107 963 aa7.32□□□□□ -1.24
CYCSP2-201ENST00000558168 NR5A1Q13285 461 aa7.32□□□□□ -1.24
CYCSP2-201ENST00000558168 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CYCSP2-201ENST00000558168 CCDC116Q8IYX3 515 aa7.32□□□□□ -1.24
CYCSP2-201ENST00000558168 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CYCSP2-201ENST00000558168 PKD2L1Q9P0L9 805 aa7.32□□□□□ -1.24
CYCSP2-201ENST00000558168 WASF2Q9Y6W5 498 aa7.32□□□□□ -1.24
CYCSP2-201ENST00000558168 FAM196BA6NMK8 535 aa7.31□□□□□ -1.24
CYCSP2-201ENST00000558168 TNFRSF10AO00220 468 aa7.31□□□□□ -1.24
CYCSP2-201ENST00000558168 GTF2IP78347 998 aa7.31□□□□□ -1.24
CYCSP2-201ENST00000558168 PSME1Q06323 249 aa7.31□□□□□ -1.24
CYCSP2-201ENST00000558168 OGFOD1Q8N543 542 aa7.31□□□□□ -1.24
CYCSP2-201ENST00000558168 TRIM52Q96A61 297 aa7.31□□□□□ -1.24
CYCSP2-201ENST00000558168 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CYCSP2-201ENST00000558168 CYLDQ9NQC7 956 aa7.31□□□□□ -1.24
CYCSP2-201ENST00000558168 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CYCSP2-201ENST00000558168 USTQ9Y2C2 406 aa7.31□□□□□ -1.24
CYCSP2-201ENST00000558168 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CYCSP2-201ENST00000558168 CLDN10P78369 228 aa7.3□□□□□ -1.24
CYCSP2-201ENST00000558168 PDE4CQ08493 712 aa7.3□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.1 ms