RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557477.1

PRPF39-212, Transcript of pre-mRNA processing factor 39, humanhuman

TSL 5

Gene PRPF39, Length 724 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF39-212ENST00000557477 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa8.52□□□□□ -1.05
PRPF39-212ENST00000557477 PLPP7Q8NBV4 271 aa8.52□□□□□ -1.05
PRPF39-212ENST00000557477 A0A0G2JS52 829 aa8.51□□□□□ -1.05
PRPF39-212ENST00000557477 CARNS1A5YM72 827 aa8.51□□□□□ -1.05
PRPF39-212ENST00000557477 ATG7O95352 703 aa8.51□□□□□ -1.05
PRPF39-212ENST00000557477 SKOR1P84550 965 aa8.51□□□□□ -1.05
PRPF39-212ENST00000557477 NCOA4Q13772 614 aa8.51□□□□□ -1.05
PRPF39-212ENST00000557477 TSGA10IPQ3SY00 556 aa8.51□□□□□ -1.05
PRPF39-212ENST00000557477 SLC10A4Q96EP9 437 aa8.51□□□□□ -1.05
PRPF39-212ENST00000557477 CHIC2Q9UKJ5 165 aa8.51□□□□□ -1.05
PRPF39-212ENST00000557477 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
PRPF39-212ENST00000557477 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
PRPF39-212ENST00000557477 VRTNQ9H8Y1 702 aa8.5□□□□□ -1.05
PRPF39-212ENST00000557477 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa8.49□□□□□ -1.05
PRPF39-212ENST00000557477 TRAF7Q6Q0C0 670 aa8.49□□□□□ -1.05
PRPF39-212ENST00000557477 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PRPF39-212ENST00000557477 WNT7BP56706 349 aa8.47□□□□□ -1.05
PRPF39-212ENST00000557477 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
PRPF39-212ENST00000557477 PODXL2Q9NZ53 605 aa8.47□□□□□ -1.05
PRPF39-212ENST00000557477 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PRPF39-212ENST00000557477 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa8.47□□□□□ -1.05
PRPF39-212ENST00000557477 USTQ9Y2C2 406 aa8.47□□□□□ -1.05
PRPF39-212ENST00000557477 RPIAP49247 311 aa8.46□□□□□ -1.06
PRPF39-212ENST00000557477 NBPF20Q3BBV1 942 aa8.46□□□□□ -1.06
PRPF39-212ENST00000557477 MAP7D1Q3KQU3 841 aa8.46□□□□□ -1.06
PRPF39-212ENST00000557477 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
PRPF39-212ENST00000557477 DOLKQ9UPQ8 538 aa8.46□□□□□ -1.06
PRPF39-212ENST00000557477 TMEM88BA6NKF7 163 aa8.45□□□□□ -1.06
PRPF39-212ENST00000557477 ESPNB1AK53 854 aa8.45□□□□□ -1.06
PRPF39-212ENST00000557477 USP17L15C9J2P7 530 aa8.45□□□□□ -1.06
PRPF39-212ENST00000557477 USP17L10C9JJH3 530 aa8.45□□□□□ -1.06
PRPF39-212ENST00000557477 USP17L13C9JLJ4 530 aa8.45□□□□□ -1.06
PRPF39-212ENST00000557477 USP17L12C9JPN9 530 aa8.45□□□□□ -1.06
PRPF39-212ENST00000557477 USP17L11C9JVI0 530 aa8.45□□□□□ -1.06
PRPF39-212ENST00000557477 USP17L21D6R901 530 aa8.45□□□□□ -1.06
PRPF39-212ENST00000557477 USP17L18D6R9N7 530 aa8.45□□□□□ -1.06
PRPF39-212ENST00000557477 USP17L22D6RA61 530 aa8.45□□□□□ -1.06
PRPF39-212ENST00000557477 USP17L17D6RBQ6 530 aa8.45□□□□□ -1.06
PRPF39-212ENST00000557477 USP17L19D6RCP7 530 aa8.45□□□□□ -1.06
PRPF39-212ENST00000557477 USP17L20D6RJB6 530 aa8.45□□□□□ -1.06
PRPF39-212ENST00000557477 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
PRPF39-212ENST00000557477 USP17L24Q0WX57 530 aa8.45□□□□□ -1.06
PRPF39-212ENST00000557477 EML3Q32P44 896 aa8.45□□□□□ -1.06
PRPF39-212ENST00000557477 LIAT1Q6ZQX7 453 aa8.45□□□□□ -1.06
PRPF39-212ENST00000557477 STK32AQ8WU08 396 aa8.45□□□□□ -1.06
PRPF39-212ENST00000557477 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
PRPF39-212ENST00000557477 VARSP26640 1264 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
PRPF39-212ENST00000557477 SLC19A1P41440 591 aa8.44□□□□□ -1.06
PRPF39-212ENST00000557477 RAB15P59190 212 aa8.44□□□□□ -1.06
PRPF39-212ENST00000557477 OXLD1Q5BKU9 147 aa8.44□□□□□ -1.06
PRPF39-212ENST00000557477 AEBP1Q8IUX7 1158 aa8.44□□□□□ -1.06
PRPF39-212ENST00000557477 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
PRPF39-212ENST00000557477 FAM196BA6NMK8 535 aa8.43□□□□□ -1.06
PRPF39-212ENST00000557477 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa8.43□□□□□ -1.06
PRPF39-212ENST00000557477 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
PRPF39-212ENST00000557477 RASA1P20936 1047 aa8.43□□□□□ -1.06
PRPF39-212ENST00000557477 CLDN10P78369 228 aa8.43□□□□□ -1.06
PRPF39-212ENST00000557477 PTK7Q13308 1070 aa8.43□□□□□ -1.06
PRPF39-212ENST00000557477 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
PRPF39-212ENST00000557477 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
PRPF39-212ENST00000557477 TMEM164Q5U3C3 297 aa8.43□□□□□ -1.06
PRPF39-212ENST00000557477 EHBP1Q8NDI1 1231 aa8.43□□□□□ -1.06
PRPF39-212ENST00000557477 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
PRPF39-212ENST00000557477 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
PRPF39-212ENST00000557477 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa8.43□□□□□ -1.06
PRPF39-212ENST00000557477 PDE4CQ08493 712 aa8.42□□□□□ -1.06
PRPF39-212ENST00000557477 RNF20Q5VTR2 975 aa8.42□□□□□ -1.06
PRPF39-212ENST00000557477 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
PRPF39-212ENST00000557477 OGFOD1Q8N543 542 aa8.42□□□□□ -1.06
PRPF39-212ENST00000557477 KCTD17Q8N5Z5 321 aa8.42□□□□□ -1.06
PRPF39-212ENST00000557477 TLL2Q9Y6L7 1015 aa8.42□□□□□ -1.06
PRPF39-212ENST00000557477 ZBTB7CA1YPR0 619 aa8.41□□□□□ -1.06
PRPF39-212ENST00000557477 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
PRPF39-212ENST00000557477 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
PRPF39-212ENST00000557477 SEPT12Q8IYM1 358 aa8.41□□□□□ -1.06
PRPF39-212ENST00000557477 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
PRPF39-212ENST00000557477 KIAA1024Q9UPX6 916 aa8.41□□□□□ -1.06
PRPF39-212ENST00000557477 NOD1Q9Y239 953 aa8.41□□□□□ -1.06
PRPF39-212ENST00000557477 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa8.41□□□□□ -1.06
PRPF39-212ENST00000557477 ARID5BQ14865 1188 aa8.4□□□□□ -1.06
PRPF39-212ENST00000557477 PRKD2Q9BZL6 878 aa8.4□□□□□ -1.06
PRPF39-212ENST00000557477 TRIM50Q86XT4 487 aa8.39□□□□□ -1.07
PRPF39-212ENST00000557477 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
PRPF39-212ENST00000557477 ERVH48-1M5A8F1 160 aa8.38□□□□□ -1.07
PRPF39-212ENST00000557477 FSHRP23945 695 aa8.38□□□□□ -1.07
PRPF39-212ENST00000557477 SCTRP47872 440 aa8.38□□□□□ -1.07
PRPF39-212ENST00000557477 GTF2IP78347 998 aa8.38□□□□□ -1.07
PRPF39-212ENST00000557477 DPYDQ12882 1025 aa8.38□□□□□ -1.07
PRPF39-212ENST00000557477 SPRYD7Q5W111 196 aa8.38□□□□□ -1.07
PRPF39-212ENST00000557477 ANKMY2Q8IV38 441 aa8.38□□□□□ -1.07
PRPF39-212ENST00000557477 CDK15Q96Q40 435 aa8.38□□□□□ -1.07
PRPF39-212ENST00000557477 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
PRPF39-212ENST00000557477 SIAH2O43255 324 aa8.37□□□□□ -1.07
PRPF39-212ENST00000557477 DKK1O94907 266 aa8.37□□□□□ -1.07
PRPF39-212ENST00000557477 BRD1O95696 1058 aa8.37□□□□□ -1.07
PRPF39-212ENST00000557477 GRM5P41594 1212 aa8.37□□□□□ -1.07
PRPF39-212ENST00000557477 ATP1A2P50993 1020 aa8.37□□□□□ -1.07
PRPF39-212ENST00000557477 FAM69CQ0P6D2 419 aa8.37□□□□□ -1.07
PRPF39-212ENST00000557477 ZNF697Q5TEC3 545 aa8.37□□□□□ -1.07
PRPF39-212ENST00000557477 FAM200AQ8TCP9 573 aa8.37□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.7 ms