RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553843.5

RHOXF1-AS1-201, RHOXF1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RHOXF1-AS1, Length 2,102 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 EVA1CP58658 441 aa11.17□□□□□ -0.62
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 PANK3Q9H999 370 aa11.17□□□□□ -0.62
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 AATKQ6ZMQ8 1374 aa11.16□□□□□ -0.62
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 FYB1O15117 783 aa11.16□□□□□ -0.62
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 ARHGEF25Q86VW2 580 aa11.16□□□□□ -0.62
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 SOCS7O14512 581 aa11.15□□□□□ -0.62
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 WNK3Q9BYP7 1800 aa11.15□□□□□ -0.62
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 CCDC7Q96M83 1385 aa11.15□□□□□ -0.62
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 A0A0G2JS52 829 aa11.15□□□□□ -0.62
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 MYT1Q01538 1121 aa11.15□□□□□ -0.62
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.63
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa11.14□□□□□ -0.63
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa11.14□□□□□ -0.63
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 FBLN1P23142 703 aa11.14□□□□□ -0.63
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 USP35Q9P2H5 1018 aa11.14□□□□□ -0.63
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 AXIN2Q9Y2T1 843 aa11.14□□□□□ -0.63
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 ABCC6O95255 1503 aa11.14□□□□□ -0.63
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 CGNL1Q0VF96 1302 aa11.14□□□□□ -0.63
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 WASHC2AQ641Q2 1341 aa11.14□□□□□ -0.63
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 RGPD2P0DJD1 1756 aa11.13□□□□□ -0.63
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa11.13□□□□□ -0.63
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa11.13□□□□□ -0.63
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa11.12□□□□□ -0.63
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 PEAK1Q9H792 1746 aa11.12□□□□□ -0.63
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 CRB1P82279 1406 aa11.12□□□□□ -0.63
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 SEPT12Q8IYM1 358 aa11.12□□□□□ -0.63
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 MAP3K19Q56UN5 1328 aa11.11□□□□□ -0.63
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa11.11□□□□□ -0.63
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 AMPHP49418 695 aa11.11□□□□□ -0.63
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 WDR17Q8IZU2 1322 aa11.1□□□□□ -0.63
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 KNSTRNQ9Y448 316 aa11.1□□□□□ -0.63
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 TCP11L2Q8N4U5 519 aa11.09□□□□□ -0.63
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 ANKRD24Q8TF21 1146 aa11.09□□□□□ -0.63
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 IP6K1Q92551 441 aa11.09□□□□□ -0.63
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 HOXC9P31274 260 aa11.08□□□□□ -0.64
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 LRRC37A3O60309 1634 aa11.08□□□□□ -0.64
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 ERBB3P21860 1342 aa11.08□□□□□ -0.64
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 RTL1A6NKG5 1358 aa11.08□□□□□ -0.64
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 NSD2O96028 1365 aa11.08□□□□□ -0.64
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 KRT27Q7Z3Y8 459 aa11.07□□□□□ -0.64
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 NLRP2Q9NX02 1062 aa11.07□□□□□ -0.64
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa11.07□□□□□ -0.64
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 BARGINQ6ZT62 677 aa11.06□□□□□ -0.64
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 MORC1Q86VD1 984 aa11.06□□□□□ -0.64
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 FLT4P35916 1363 aa11.06□□□□□ -0.64
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 CARD10Q9BWT7 1032 aa11.06□□□□□ -0.64
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 FAM182BQ5T319 152 aa11.05□□□□□ -0.64
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP11.05□□□□□ -0.64
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa11.04□□□□□ -0.64
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 KIF24Q5T7B8 1368 aa11.04□□□□□ -0.64
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 POLKQ9UBT6 870 aa11.03□□□□□ -0.64
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 INSRP06213 1382 aa11.03□□□□□ -0.64
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 PDE3BQ13370 1112 aa11.03□□□□□ -0.64
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 DISP2A7MBM2 1401 aa11.03□□□□□ -0.64
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 RGPD1P0DJD0 1748 aa11.02□□□□□ -0.64
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 USHBP1Q8N6Y0 703 aa11.02□□□□□ -0.64
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 ANP32CO43423 234 aa11.02□□□□□ -0.65
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 DDB1Q16531 1140 aa11.02□□□□□ -0.65
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 SBF2Q86WG5 1849 aa11.02□□□□□ -0.65
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa11.02□□□□□ -0.65
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 SHANK3Q9BYB0 1731 aa11.01□□□□□ -0.65
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 IL2RBP14784 551 aa11□□□□□ -0.65
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 NBPF6Q5VWK0 638 aa11□□□□□ -0.65
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 NBPF4Q96M43 638 aa11□□□□□ -0.65
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 EP400Q96L91 3159 aa11□□□□□ -0.65
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 KAT6BQ8WYB5 2073 aa11□□□□□ -0.65
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 TNS2Q63HR2 1409 aa11□□□□□ -0.65
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 CCER2I3L3R5 266 aa11□□□□□ -0.65
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa10.99□□□□□ -0.65
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 MEGF6O75095 1541 aa10.99□□□□□ -0.65
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 EXOC5O00471 708 aa10.99□□□□□ -0.65
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa10.98□□□□□ -0.65
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 FAM196AQ6ZSG2 479 aa10.97□□□□□ -0.65
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP10.97□□□□□ -0.65
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 PKD1L3Q7Z443 1732 aa10.96□□□□□ -0.65
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 TRIM37O94972 964 aa10.96□□□□□ -0.65
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 MTHFSP49914 203 aa10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms