RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551441.5

CS-227, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-227ENST00000551441 SLIT3O75094 1523 aa23.27■■□□□ 1.32
CS-227ENST00000551441 COL18A1P39060 1754 aa23.27■■□□□ 1.32
CS-227ENST00000551441 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
CS-227ENST00000551441 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
CS-227ENST00000551441 WNK3Q9BYP7 1800 aa23.24■■□□□ 1.31
CS-227ENST00000551441 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa23.24■■□□□ 1.31
CS-227ENST00000551441 PLSCR1O15162 318 aa23.23■■□□□ 1.31
CS-227ENST00000551441 ZBTB7AO95365 584 aa23.23■■□□□ 1.31
CS-227ENST00000551441 PROM2Q8N271 834 aa23.23■■□□□ 1.31
CS-227ENST00000551441 WDR17Q8IZU2 1322 aa23.23■■□□□ 1.31
CS-227ENST00000551441 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
CS-227ENST00000551441 L3MBTL2Q969R5 705 aa23.21■■□□□ 1.31
CS-227ENST00000551441 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
CS-227ENST00000551441 AKAP12Q02952 1782 aa23.21■■□□□ 1.31
CS-227ENST00000551441 CASZ1Q86V15 1759 aa23.2■■□□□ 1.3
CS-227ENST00000551441 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
CS-227ENST00000551441 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa23.2■■□□□ 1.3
CS-227ENST00000551441 DCAF8L1A6NGE4 600 aa23.2■■□□□ 1.3
CS-227ENST00000551441 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
CS-227ENST00000551441 EVC2Q86UK5 1308 aa23.19■■□□□ 1.3
CS-227ENST00000551441 ARHGEF25Q86VW2 580 aa23.19■■□□□ 1.3
CS-227ENST00000551441 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
CS-227ENST00000551441 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa23.19■■□□□ 1.3
CS-227ENST00000551441 SIN3AQ96ST3 1273 aa23.18■■□□□ 1.3
CS-227ENST00000551441 NINLQ9Y2I6 1382 aa23.17■■□□□ 1.3
CS-227ENST00000551441 TXNRD1Q16881 649 aa23.15■■□□□ 1.3
CS-227ENST00000551441 ACSBG1Q96GR2 724 aa23.15■■□□□ 1.3
CS-227ENST00000551441 CARD10Q9BWT7 1032 aa23.15■■□□□ 1.3
CS-227ENST00000551441 MYOM1P52179 1685 aa23.15■■□□□ 1.3
CS-227ENST00000551441 EXOC5O00471 708 aa23.14■■□□□ 1.29
CS-227ENST00000551441 NEUROD1Q13562 356 aa23.14■■□□□ 1.29
CS-227ENST00000551441 KCNH5Q8NCM2 988 aa23.14■■□□□ 1.29
CS-227ENST00000551441 STK32BQ9NY57 414 aa23.14■■□□□ 1.29
CS-227ENST00000551441 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa23.14■■□□□ 1.29
CS-227ENST00000551441 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
CS-227ENST00000551441 PTGER2P43116 358 aa23.12■■□□□ 1.29
CS-227ENST00000551441 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP23.12■■□□□ 1.29
CS-227ENST00000551441 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
CS-227ENST00000551441 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
CS-227ENST00000551441 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
CS-227ENST00000551441 NFAT5O94916 1531 aa23.1■■□□□ 1.29
CS-227ENST00000551441 SLC15A2Q16348 729 aa23.1■■□□□ 1.29
CS-227ENST00000551441 TTC21AQ8NDW8 1320 aa23.08■■□□□ 1.29
CS-227ENST00000551441 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
CS-227ENST00000551441 NLRP2Q9NX02 1062 aa23.07■■□□□ 1.28
CS-227ENST00000551441 BCL9O00512 1426 aa23.07■■□□□ 1.28
CS-227ENST00000551441 KAT6BQ8WYB5 2073 aa23.06■■□□□ 1.28
CS-227ENST00000551441 NME9Q86XW9 330 aa23.06■■□□□ 1.28
CS-227ENST00000551441 CCDC7Q96M83 1385 aa23.05■■□□□ 1.28
CS-227ENST00000551441 TNS2Q63HR2 1409 aa23.05■■□□□ 1.28
CS-227ENST00000551441 UTRNP46939 3433 aa23.04■■□□□ 1.28
CS-227ENST00000551441 MON2Q7Z3U7 1717 aa23.03■■□□□ 1.28
CS-227ENST00000551441 TMC1Q8TDI8 760 aa23.03■■□□□ 1.28
CS-227ENST00000551441 SYT17Q9BSW7 474 aa23.03■■□□□ 1.28
CS-227ENST00000551441 NHSQ6T4R5 1651 aa23.03■■□□□ 1.28
CS-227ENST00000551441 LTN1O94822 1766 aa23.02■■□□□ 1.28
CS-227ENST00000551441 MTFR1LQ9H019 292 aa23.01■■□□□ 1.27
CS-227ENST00000551441 BTAF1O14981 1849 aa22.99■■□□□ 1.27
CS-227ENST00000551441 IL2RBP14784 551 aa22.99■■□□□ 1.27
CS-227ENST00000551441 ZNF827Q17R98 1081 aa22.99■■□□□ 1.27
CS-227ENST00000551441 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
CS-227ENST00000551441 ANKRD24Q8TF21 1146 aa22.99■■□□□ 1.27
CS-227ENST00000551441 ERBB3P21860 1342 aa22.99■■□□□ 1.27
CS-227ENST00000551441 SGIP1Q9BQI5 828 aa22.98■■□□□ 1.27
CS-227ENST00000551441 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
CS-227ENST00000551441 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa22.97■■□□□ 1.27
CS-227ENST00000551441 CD163L1Q9NR16 1453 aa22.97■■□□□ 1.27
CS-227ENST00000551441 KLHL34Q8N239 644 aa22.96■■□□□ 1.27
CS-227ENST00000551441 ARXQ96QS3 562 aa22.96■■□□□ 1.27
CS-227ENST00000551441 LRRC4BQ9NT99 713 aa22.96■■□□□ 1.27
CS-227ENST00000551441 USP31Q70CQ4 1352 aa22.96■■□□□ 1.27
CS-227ENST00000551441 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa22.96■■□□□ 1.27
CS-227ENST00000551441 ABCC6O95255 1503 aa22.96■■□□□ 1.27
CS-227ENST00000551441 PAPPAQ13219 1627 aa22.94■■□□□ 1.26
CS-227ENST00000551441 KCNQ4P56696 695 aa22.94■■□□□ 1.26
CS-227ENST00000551441 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
CS-227ENST00000551441 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
CS-227ENST00000551441 CARD11Q9BXL7 1154 aa22.93■■□□□ 1.26
CS-227ENST00000551441 USP54Q70EL1 1684 aa22.91■■□□□ 1.26
CS-227ENST00000551441 CHD4Q14839 1912 aa22.9■■□□□ 1.26
CS-227ENST00000551441 FBLN1P23142 703 aa22.9■■□□□ 1.26
CS-227ENST00000551441 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
CS-227ENST00000551441 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
CS-227ENST00000551441 A0A1W2PP64 1363 aa22.88■■□□□ 1.25
CS-227ENST00000551441 GPR162Q16538 588 aa22.87■■□□□ 1.25
CS-227ENST00000551441 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
CS-227ENST00000551441 AKT1S1Q96B36 256 aa22.86■■□□□ 1.25
CS-227ENST00000551441 IP6K1Q92551 441 aa22.85■■□□□ 1.25
CS-227ENST00000551441 RGPD2P0DJD1 1756 aa22.84■■□□□ 1.25
CS-227ENST00000551441 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa22.84■■□□□ 1.25
CS-227ENST00000551441 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
CS-227ENST00000551441 TERF2IPQ9NYB0 399 aa22.84■■□□□ 1.25
CS-227ENST00000551441 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa22.84■■□□□ 1.25
CS-227ENST00000551441 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa22.83■■□□□ 1.25
CS-227ENST00000551441 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa22.82■■□□□ 1.24
CS-227ENST00000551441 DOT1LQ8TEK3 1739 aa22.82■■□□□ 1.24
CS-227ENST00000551441 ADRA2BP18089 450 aa22.81■■□□□ 1.24
CS-227ENST00000551441 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
CS-227ENST00000551441 POLD1P28340 1107 aa22.8■■□□□ 1.24
CS-227ENST00000551441 NLGN2Q8NFZ4 835 aa22.8■■□□□ 1.24
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