RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550632.5

USP15-216, Transcript of ubiquitin specific peptidase 15, humanhuman

TSL 3

Gene USP15, Length 728 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15-216ENST00000550632 USP19O94966 1318 aa22.01■■□□□ 1.11
USP15-216ENST00000550632 GCP02774 474 aa22■■□□□ 1.11
USP15-216ENST00000550632 KLHL34Q8N239 644 aa21.99■■□□□ 1.11
USP15-216ENST00000550632 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
USP15-216ENST00000550632 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa21.97■■□□□ 1.11
USP15-216ENST00000550632 CDK19Q9BWU1 502 aa21.97■■□□□ 1.11
USP15-216ENST00000550632 SHANK3Q9BYB0 1731 aa21.96■■□□□ 1.11
USP15-216ENST00000550632 NLRP13Q86W25 1043 aa21.95■■□□□ 1.1
USP15-216ENST00000550632 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa21.95■■□□□ 1.1
USP15-216ENST00000550632 MAP3K5Q99683 1374 aa21.95■■□□□ 1.1
USP15-216ENST00000550632 AKAP12Q02952 1782 aa21.92■■□□□ 1.1
USP15-216ENST00000550632 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa21.92■■□□□ 1.1
USP15-216ENST00000550632 CCDC61Q9Y6R9 512 aa21.91■■□□□ 1.1
USP15-216ENST00000550632 BCL9O00512 1426 aa21.9■■□□□ 1.1
USP15-216ENST00000550632 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
USP15-216ENST00000550632 PLEKHG3A1L390 1219 aa21.9■■□□□ 1.1
USP15-216ENST00000550632 WNK3Q9BYP7 1800 aa21.9■■□□□ 1.1
USP15-216ENST00000550632 AATKQ6ZMQ8 1374 aa21.89■■□□□ 1.1
USP15-216ENST00000550632 ZNF827Q17R98 1081 aa21.89■■□□□ 1.09
USP15-216ENST00000550632 AXIN2Q9Y2T1 843 aa21.89■■□□□ 1.09
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USP15-216ENST00000550632 NLGN2Q8NFZ4 835 aa21.87■■□□□ 1.09
USP15-216ENST00000550632 ACSBG1Q96GR2 724 aa21.87■■□□□ 1.09
USP15-216ENST00000550632 WDR17Q8IZU2 1322 aa21.86■■□□□ 1.09
USP15-216ENST00000550632 DCAF11Q8TEB1 546 aa21.86■■□□□ 1.09
USP15-216ENST00000550632 NLRP6P59044 892 aa21.85■■□□□ 1.09
USP15-216ENST00000550632 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
USP15-216ENST00000550632 PAPPAQ13219 1627 aa21.84■■□□□ 1.09
USP15-216ENST00000550632 EXOC5O00471 708 aa21.84■■□□□ 1.09
USP15-216ENST00000550632 COL18A1P39060 1754 aa21.84■■□□□ 1.09
USP15-216ENST00000550632 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP21.83■■□□□ 1.094e-10■□□□□ 9
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USP15-216ENST00000550632 ATP10DQ9P241 1426 aa21.81■■□□□ 1.08
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USP15-216ENST00000550632 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa21.8■■□□□ 1.08
USP15-216ENST00000550632 HSPA6P17066 643 aa21.8■■□□□ 1.08
USP15-216ENST00000550632 POLD1P28340 1107 aa21.8■■□□□ 1.08
USP15-216ENST00000550632 SLIT3O75094 1523 aa21.8■■□□□ 1.08
USP15-216ENST00000550632 NHSQ6T4R5 1651 aa21.79■■□□□ 1.08
USP15-216ENST00000550632 CARD10Q9BWT7 1032 aa21.79■■□□□ 1.08
USP15-216ENST00000550632 SOX12O15370 315 aa21.78■■□□□ 1.08
USP15-216ENST00000550632 RGPD5Q99666 1765 aa21.78■■□□□ 1.08
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USP15-216ENST00000550632 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
USP15-216ENST00000550632 CABP2Q9NPB3 220 aa21.76■■□□□ 1.07
USP15-216ENST00000550632 USP6P35125 1406 aa21.75■■□□□ 1.07
USP15-216ENST00000550632 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
USP15-216ENST00000550632 TNS2Q63HR2 1409 aa21.75■■□□□ 1.07
USP15-216ENST00000550632 GRIN3BO60391 1043 aa21.75■■□□□ 1.07
USP15-216ENST00000550632 AKT1S1Q96B36 256 aa21.75■■□□□ 1.07
USP15-216ENST00000550632 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa21.75■■□□□ 1.07
USP15-216ENST00000550632 BTAF1O14981 1849 aa21.74■■□□□ 1.07
USP15-216ENST00000550632 SLC16A10Q8TF71 515 aa21.74■■□□□ 1.07
USP15-216ENST00000550632 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
USP15-216ENST00000550632 ARHGEF25Q86VW2 580 aa21.73■■□□□ 1.07
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USP15-216ENST00000550632 CABP1Q9NZU7 370 aa21.72■■□□□ 1.07
USP15-216ENST00000550632 PIK3C2AO00443 1686 aa21.71■■□□□ 1.07
USP15-216ENST00000550632 COL24A1Q17RW2 1714 aa21.7■■□□□ 1.06
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USP15-216ENST00000550632 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa21.69■■□□□ 1.06
USP15-216ENST00000550632 CCDC7Q96M83 1385 aa21.69■■□□□ 1.06
USP15-216ENST00000550632 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa21.68■■□□□ 1.06
USP15-216ENST00000550632 ABCC6O95255 1503 aa21.67■■□□□ 1.06
USP15-216ENST00000550632 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa21.66■■□□□ 1.06
USP15-216ENST00000550632 QSER1Q2KHR3 1735 aa21.66■■□□□ 1.06
USP15-216ENST00000550632 NLRP2Q9NX02 1062 aa21.64■■□□□ 1.05
USP15-216ENST00000550632 ADCY9O60503 1353 aa21.63■■□□□ 1.05
USP15-216ENST00000550632 MSH5O43196 834 aa21.63■■□□□ 1.05
USP15-216ENST00000550632 MSL1Q68DK7 614 aa21.63■■□□□ 1.05
USP15-216ENST00000550632 KCNH5Q8NCM2 988 aa21.63■■□□□ 1.05
USP15-216ENST00000550632 CAPN15O75808 1086 aa21.62■■□□□ 1.05
USP15-216ENST00000550632 NBPF1Q3BBV0 1214 aa21.62■■□□□ 1.05
USP15-216ENST00000550632 SLC27A3Q5K4L6 730 aa21.62■■□□□ 1.05
USP15-216ENST00000550632 STAC3Q96MF2 364 aa21.62■■□□□ 1.05
USP15-216ENST00000550632 IL2RBP14784 551 aa21.61■■□□□ 1.05
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USP15-216ENST00000550632 WWC3Q9ULE0 1092 aa21.6■■□□□ 1.05
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USP15-216ENST00000550632 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
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USP15-216ENST00000550632 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
USP15-216ENST00000550632 KIF3CO14782 793 aa21.57■■□□□ 1.04
USP15-216ENST00000550632 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
USP15-216ENST00000550632 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
USP15-216ENST00000550632 ERBB3P21860 1342 aa21.55■■□□□ 1.04
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USP15-216ENST00000550632 APLP1P51693 650 aa21.54■■□□□ 1.04
USP15-216ENST00000550632 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
USP15-216ENST00000550632 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa21.53■■□□□ 1.04
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USP15-216ENST00000550632 ANKRD24Q8TF21 1146 aa21.51■■□□□ 1.03
USP15-216ENST00000550632 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
USP15-216ENST00000550632 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa21.5■■□□□ 1.03
USP15-216ENST00000550632 TTC21AQ8NDW8 1320 aa21.49■■□□□ 1.03
USP15-216ENST00000550632 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
USP15-216ENST00000550632 LY75O60449 1722 aa21.48■■□□□ 1.03
USP15-216ENST00000550632 NSD2O96028 1365 aa21.48■■□□□ 1.03
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