RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547715.1

PTPRB-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRB, Length 639 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-205ENST00000547715 PROM2Q8N271 834 aa21.13■□□□□ 0.97
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PTPRB-205ENST00000547715 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
PTPRB-205ENST00000547715 CD163L1Q9NR16 1453 aa20.71■□□□□ 0.91
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PTPRB-205ENST00000547715 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP20.69■□□□□ 0.9
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PTPRB-205ENST00000547715 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
PTPRB-205ENST00000547715 MSH5O43196 834 aa20.68■□□□□ 0.9
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