RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539034.1

CLIP1-AS1-202, CLIP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene CLIP1-AS1, Length 447 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa9.24□□□□□ -0.93
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 PTK2Q05397 1052 aa9.23□□□□□ -0.93
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 NBPF14Q5TI25 921 aa9.23□□□□□ -0.93
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 PDXDC2PQ6P474 469 aa9.23□□□□□ -0.93
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 STK32AQ8WU08 396 aa9.23□□□□□ -0.93
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 ZNF592Q92610 1267 aa9.23□□□□□ -0.93
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 TMEM164Q5U3C3 297 aa9.22□□□□□ -0.93
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 SPRYD7Q5W111 196 aa9.22□□□□□ -0.93
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 DEPDC4Q8N2C3 294 aa9.22□□□□□ -0.93
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 CEP126Q9P2H0 1117 aa9.22□□□□□ -0.93
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 SLFNL1Q499Z3 407 aa9.21□□□□□ -0.94
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa9.21□□□□□ -0.94
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa9.21□□□□□ -0.94
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa9.21□□□□□ -0.94
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 FAM196BA6NMK8 535 aa9.2□□□□□ -0.94
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 USP17L15C9J2P7 530 aa9.2□□□□□ -0.94
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 USP17L10C9JJH3 530 aa9.2□□□□□ -0.94
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 USP17L13C9JLJ4 530 aa9.2□□□□□ -0.94
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 USP17L12C9JPN9 530 aa9.2□□□□□ -0.94
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 USP17L11C9JVI0 530 aa9.2□□□□□ -0.94
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 USP17L21D6R901 530 aa9.2□□□□□ -0.94
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 USP17L18D6R9N7 530 aa9.2□□□□□ -0.94
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 USP17L22D6RA61 530 aa9.2□□□□□ -0.94
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 USP17L17D6RBQ6 530 aa9.2□□□□□ -0.94
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 USP17L19D6RCP7 530 aa9.2□□□□□ -0.94
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 USP17L20D6RJB6 530 aa9.2□□□□□ -0.94
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 USP17L24Q0WX57 530 aa9.2□□□□□ -0.94
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 RNF135Q8IUD6 432 aa9.2□□□□□ -0.94
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 NCOA4Q13772 614 aa9.19□□□□□ -0.94
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 ZNF697Q5TEC3 545 aa9.19□□□□□ -0.94
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 Q6ZNB5 142 aa9.19□□□□□ -0.94
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP9.19□□□□□ -0.94
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 CCDC24Q8N4L8 307 aa9.19□□□□□ -0.94
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 PHTF2Q8N3S3 785 aa9.18□□□□□ -0.94
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 PLPP7Q8NBV4 271 aa9.18□□□□□ -0.94
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 ADAM32Q8TC27 787 aa9.18□□□□□ -0.94
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa9.18□□□□□ -0.94
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 UNC93B1Q9H1C4 597 aa9.17□□□□□ -0.94
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa9.16□□□□□ -0.94
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 TNFRSF10AO00220 468 aa9.16□□□□□ -0.94
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 FOXC1Q12948 553 aa9.16□□□□□ -0.94
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 PTK7Q13308 1070 aa9.16□□□□□ -0.94
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 TRIM67Q6ZTA4 783 aa9.16□□□□□ -0.94
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa9.16□□□□□ -0.94
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 CHIC2Q9UKJ5 165 aa9.16□□□□□ -0.94
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 RASA1P20936 1047 aa9.15□□□□□ -0.94
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 LAPTM4AQ15012 233 aa9.15□□□□□ -0.94
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 CCDC27Q2M243 656 aa9.15□□□□□ -0.94
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 RPIAP49247 311 aa9.14□□□□□ -0.95
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 MAP7D1Q3KQU3 841 aa9.14□□□□□ -0.95
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 ZBTB33Q86T24 672 aa9.14□□□□□ -0.95
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 EML3Q32P44 896 aa9.13□□□□□ -0.95
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa9.13□□□□□ -0.95
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 TRAF7Q6Q0C0 670 aa9.13□□□□□ -0.95
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 SLAIN2Q9P270 581 aa9.13□□□□□ -0.95
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 FAM69CQ0P6D2 419 aa9.12□□□□□ -0.95
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 ANKMY2Q8IV38 441 aa9.12□□□□□ -0.95
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 FAM200AQ8TCP9 573 aa9.12□□□□□ -0.95
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 CARD14Q9BXL6 1004 aa9.12□□□□□ -0.95
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa9.11□□□□□ -0.95
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 TXNDC2Q86VQ3 553 aa9.11□□□□□ -0.95
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 OGFOD1Q8N543 542 aa9.11□□□□□ -0.95
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa9.1□□□□□ -0.95
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 GDF9O60383 454 aa9.1□□□□□ -0.95
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 SSFA2P28290 1259 aa9.1□□□□□ -0.95
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 CLDN10P78369 228 aa9.1□□□□□ -0.95
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 TSGA10IPQ3SY00 556 aa9.1□□□□□ -0.95
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 ZNF428Q96B54 188 aa9.1□□□□□ -0.95
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 PKD2L1Q9P0L9 805 aa9.1□□□□□ -0.95
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 DOLKQ9UPQ8 538 aa9.1□□□□□ -0.95
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 RBM25P49756 843 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 DPYDQ12882 1025 aa9.09□□□□□ -0.95
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 TRIM32Q13049 653 aa9.09□□□□□ -0.95
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 TRIM50Q86XT4 487 aa9.09□□□□□ -0.95
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 NOD1Q9Y239 953 aa9.09□□□□□ -0.95
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 SWI5Q1ZZU3 235 aa9.08□□□□□ -0.96
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 ERFEQ4G0M1 354 aa9.08□□□□□ -0.96
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 LCE2BO14633 110 aa9.07□□□□□ -0.96
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 ATP1A2P50993 1020 aa9.07□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 301.1 ms