RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536509.5

LMO3-214, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 4

Gene LMO3, Length 550 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-214ENST00000536509 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
LMO3-214ENST00000536509 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa15.98■□□□□ 0.15
LMO3-214ENST00000536509 CABP2Q9NPB3 220 aa15.98■□□□□ 0.15
LMO3-214ENST00000536509 SLIT3O75094 1523 aa15.98■□□□□ 0.15
LMO3-214ENST00000536509 EVC2Q86UK5 1308 aa15.97■□□□□ 0.15
LMO3-214ENST00000536509 NLRP6P59044 892 aa15.97■□□□□ 0.15
LMO3-214ENST00000536509 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa15.96■□□□□ 0.15
LMO3-214ENST00000536509 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa15.96■□□□□ 0.15
LMO3-214ENST00000536509 OVOS2Q6IE36 1432 aa15.96■□□□□ 0.15
LMO3-214ENST00000536509 CABP1Q9NZU7 370 aa15.96■□□□□ 0.15
LMO3-214ENST00000536509 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa15.96■□□□□ 0.15
LMO3-214ENST00000536509 SBF2Q86WG5 1849 aa15.96■□□□□ 0.14
LMO3-214ENST00000536509 PEAK1Q9H792 1746 aa15.95■□□□□ 0.14
LMO3-214ENST00000536509 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
LMO3-214ENST00000536509 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
LMO3-214ENST00000536509 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
LMO3-214ENST00000536509 PIK3C2AO00443 1686 aa15.95■□□□□ 0.14
LMO3-214ENST00000536509 WNK3Q9BYP7 1800 aa15.94■□□□□ 0.14
LMO3-214ENST00000536509 COL18A1P39060 1754 aa15.94■□□□□ 0.14
LMO3-214ENST00000536509 AKAP12Q02952 1782 aa15.94■□□□□ 0.14
LMO3-214ENST00000536509 KCNH5Q8NCM2 988 aa15.93■□□□□ 0.14
LMO3-214ENST00000536509 LRRC37A3O60309 1634 aa15.93■□□□□ 0.14
LMO3-214ENST00000536509 PLSCR1O15162 318 aa15.92■□□□□ 0.14
LMO3-214ENST00000536509 DDB1Q16531 1140 aa15.92■□□□□ 0.14
LMO3-214ENST00000536509 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa15.92■□□□□ 0.14
LMO3-214ENST00000536509 L3MBTL2Q969R5 705 aa15.92■□□□□ 0.14
LMO3-214ENST00000536509 TTC21AQ8NDW8 1320 aa15.92■□□□□ 0.14
LMO3-214ENST00000536509 WDR17Q8IZU2 1322 aa15.91■□□□□ 0.14
LMO3-214ENST00000536509 ZBTB7CA1YPR0 619 aa15.9■□□□□ 0.14
LMO3-214ENST00000536509 SPON1Q9HCB6 807 aa15.9■□□□□ 0.14
LMO3-214ENST00000536509 BCL9O00512 1426 aa15.9■□□□□ 0.14
LMO3-214ENST00000536509 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
LMO3-214ENST00000536509 RGPD5Q99666 1765 aa15.9■□□□□ 0.14
LMO3-214ENST00000536509 ABCC6O95255 1503 aa15.89■□□□□ 0.13
LMO3-214ENST00000536509 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
LMO3-214ENST00000536509 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
LMO3-214ENST00000536509 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
LMO3-214ENST00000536509 ARHGEF25Q86VW2 580 aa15.88■□□□□ 0.13
LMO3-214ENST00000536509 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa15.88■□□□□ 0.13
LMO3-214ENST00000536509 KCNQ2O43526 872 aa15.87■□□□□ 0.13
LMO3-214ENST00000536509 CARD10Q9BWT7 1032 aa15.86■□□□□ 0.13
LMO3-214ENST00000536509 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
LMO3-214ENST00000536509 AXIN2Q9Y2T1 843 aa15.86■□□□□ 0.13
LMO3-214ENST00000536509 NINLQ9Y2I6 1382 aa15.86■□□□□ 0.13
LMO3-214ENST00000536509 MON2Q7Z3U7 1717 aa15.85■□□□□ 0.13
LMO3-214ENST00000536509 CAPN15O75808 1086 aa15.85■□□□□ 0.13
LMO3-214ENST00000536509 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
LMO3-214ENST00000536509 CCDC7Q96M83 1385 aa15.85■□□□□ 0.13
LMO3-214ENST00000536509 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa15.85■□□□□ 0.13
LMO3-214ENST00000536509 USP54Q70EL1 1684 aa15.84■□□□□ 0.13
LMO3-214ENST00000536509 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa15.84■□□□□ 0.13
LMO3-214ENST00000536509 NFAT5O94916 1531 aa15.84■□□□□ 0.13
LMO3-214ENST00000536509 EXOC5O00471 708 aa15.83■□□□□ 0.12
LMO3-214ENST00000536509 CASZ1Q86V15 1759 aa15.82■□□□□ 0.12
LMO3-214ENST00000536509 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
LMO3-214ENST00000536509 USP31Q70CQ4 1352 aa15.8■□□□□ 0.12
LMO3-214ENST00000536509 SIN3AQ96ST3 1273 aa15.8■□□□□ 0.12
LMO3-214ENST00000536509 LTN1O94822 1766 aa15.8■□□□□ 0.12
LMO3-214ENST00000536509 TNS2Q63HR2 1409 aa15.79■□□□□ 0.12
LMO3-214ENST00000536509 SOX12O15370 315 aa15.79■□□□□ 0.12
LMO3-214ENST00000536509 YY1P25490 414 aa15.79■□□□□ 0.12
LMO3-214ENST00000536509 NEUROD1Q13562 356 aa15.79■□□□□ 0.12
LMO3-214ENST00000536509 NHSQ6T4R5 1651 aa15.78■□□□□ 0.12
LMO3-214ENST00000536509 TXNRD1Q16881 649 aa15.77■□□□□ 0.12
LMO3-214ENST00000536509 PROM2Q8N271 834 aa15.77■□□□□ 0.12
LMO3-214ENST00000536509 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.12
LMO3-214ENST00000536509 STK32BQ9NY57 414 aa15.77■□□□□ 0.12
LMO3-214ENST00000536509 ERBB3P21860 1342 aa15.76■□□□□ 0.11
LMO3-214ENST00000536509 PTF1AQ7RTS3 328 aa15.76■□□□□ 0.11
LMO3-214ENST00000536509 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
LMO3-214ENST00000536509 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
LMO3-214ENST00000536509 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP15.75■□□□□ 0.11
LMO3-214ENST00000536509 CARD11Q9BXL7 1154 aa15.75■□□□□ 0.11
LMO3-214ENST00000536509 TERF2IPQ9NYB0 399 aa15.75■□□□□ 0.11
LMO3-214ENST00000536509 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
LMO3-214ENST00000536509 KAT6BQ8WYB5 2073 aa15.74■□□□□ 0.11
LMO3-214ENST00000536509 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
LMO3-214ENST00000536509 CD163L1Q9NR16 1453 aa15.74■□□□□ 0.11
LMO3-214ENST00000536509 IL2RBP14784 551 aa15.74■□□□□ 0.11
LMO3-214ENST00000536509 POLA2Q14181 598 aa15.74■□□□□ 0.11
LMO3-214ENST00000536509 SLC15A2Q16348 729 aa15.74■□□□□ 0.11
LMO3-214ENST00000536509 NLRP2Q9NX02 1062 aa15.74■□□□□ 0.11
LMO3-214ENST00000536509 SLC24A1O60721 1099 aa15.73■□□□□ 0.11
LMO3-214ENST00000536509 NME9Q86XW9 330 aa15.72■□□□□ 0.11
LMO3-214ENST00000536509 TMC1Q8TDI8 760 aa15.72■□□□□ 0.11
LMO3-214ENST00000536509 MTFR1LQ9H019 292 aa15.72■□□□□ 0.11
LMO3-214ENST00000536509 BTAF1O14981 1849 aa15.72■□□□□ 0.11
LMO3-214ENST00000536509 MYOM1P52179 1685 aa15.72■□□□□ 0.11
LMO3-214ENST00000536509 ZBTB7AO95365 584 aa15.71■□□□□ 0.11
LMO3-214ENST00000536509 PTGER2P43116 358 aa15.71■□□□□ 0.11
LMO3-214ENST00000536509 ANKRD24Q8TF21 1146 aa15.7■□□□□ 0.1
LMO3-214ENST00000536509 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP15.69■□□□□ 0.1
LMO3-214ENST00000536509 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa15.69■□□□□ 0.1
LMO3-214ENST00000536509 PAPPAQ13219 1627 aa15.68■□□□□ 0.1
LMO3-214ENST00000536509 CHD4Q14839 1912 aa15.68■□□□□ 0.1
LMO3-214ENST00000536509 A0A1W2PP64 1363 aa15.68■□□□□ 0.1
LMO3-214ENST00000536509 TONSLQ96HA7 1378 aa15.68■□□□□ 0.1
LMO3-214ENST00000536509 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP15.68■□□□□ 0.1
LMO3-214ENST00000536509 IP6K1Q92551 441 aa15.67■□□□□ 0.1
LMO3-214ENST00000536509 ACSBG1Q96GR2 724 aa15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.7 ms