RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534404.1

LRP4-205, Transcript of LDL receptor related protein 4, human

TSL 5

Gene LRP4, Length 663 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LRP4-205	ENST00000534404	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	46.08	■■■■■ 4.97
LRP4-205	ENST00000534404	CRB1	P82279	1406 aa		46.08	■■■■■ 4.97
LRP4-205	ENST00000534404	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		46.08	■■■■■ 4.97
LRP4-205	ENST00000534404	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		46.07	■■■■■ 4.97
LRP4-205	ENST00000534404	COL18A1	P39060	1754 aa		46.07	■■■■■ 4.96
LRP4-205	ENST00000534404	EP400	Q96L91	3159 aa		46.06	■■■■■ 4.96
LRP4-205	ENST00000534404	FAM182B	Q5T319	152 aa		46.05	■■■■■ 4.96
LRP4-205	ENST00000534404	USP54	Q70EL1	1684 aa		46.04	■■■■■ 4.96
LRP4-205	ENST00000534404	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		46.03	■■■■■ 4.96
LRP4-205	ENST00000534404	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	46	■■■■■ 4.95
LRP4-205	ENST00000534404	PDE3B	Q13370	1112 aa		46	■■■■■ 4.95
LRP4-205	ENST00000534404	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		46	■■■■■ 4.95
LRP4-205	ENST00000534404	COG3	Q96JB2	828 aa		45.99	■■■■■ 4.95
LRP4-205	ENST00000534404	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		45.96	■■■■■ 4.95
LRP4-205	ENST00000534404	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		45.96	■■■■■ 4.95
LRP4-205	ENST00000534404	RGPD5	Q99666	1765 aa		45.96	■■■■■ 4.95
LRP4-205	ENST00000534404	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		45.93	■■■■■ 4.94
LRP4-205	ENST00000534404	ABCC6	O95255	1503 aa		45.92	■■■■■ 4.94
LRP4-205	ENST00000534404	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	45.91	■■■■■ 4.94
LRP4-205	ENST00000534404	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		45.9	■■■■■ 4.94
LRP4-205	ENST00000534404	LTN1	O94822	1766 aa		45.89	■■■■■ 4.94
LRP4-205	ENST00000534404	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		45.89	■■■■■ 4.94
LRP4-205	ENST00000534404	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		45.86	■■■■■ 4.93
LRP4-205	ENST00000534404	BAG6	P46379	1132 aa		45.84	■■■■■ 4.93
LRP4-205	ENST00000534404	FYB1	O15117	783 aa		45.83	■■■■■ 4.93
LRP4-205	ENST00000534404	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		45.83	■■■■■ 4.93
LRP4-205	ENST00000534404	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	45.83	■■■■■ 4.93
LRP4-205	ENST00000534404	MYOM1	P52179	1685 aa		45.82	■■■■■ 4.92
LRP4-205	ENST00000534404	DDB1	Q16531	1140 aa		45.81	■■■■■ 4.92
LRP4-205	ENST00000534404	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	45.8	■■■■■ 4.92
LRP4-205	ENST00000534404	ERBB3	P21860	1342 aa		45.79	■■■■■ 4.92
LRP4-205	ENST00000534404	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		45.79	■■■■■ 4.92
LRP4-205	ENST00000534404	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		45.79	■■■■■ 4.92
LRP4-205	ENST00000534404	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		45.78	■■■■■ 4.92
LRP4-205	ENST00000534404	CCDC7	Q96M83	1385 aa		45.77	■■■■■ 4.92
LRP4-205	ENST00000534404	TRIM37	O94972	964 aa		45.77	■■■■■ 4.92
LRP4-205	ENST00000534404	IP6K1	Q92551	441 aa		45.76	■■■■■ 4.92
LRP4-205	ENST00000534404	FBLN1	P23142	703 aa		45.75	■■■■■ 4.91
LRP4-205	ENST00000534404	AMPH	P49418	695 aa		45.75	■■■■■ 4.91
LRP4-205	ENST00000534404	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		45.75	■■■■■ 4.91
LRP4-205	ENST00000534404	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		45.74	■■■■■ 4.91
LRP4-205	ENST00000534404	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		45.73	■■■■■ 4.91
LRP4-205	ENST00000534404	LRRC37A3	O60309	1634 aa		45.71	■■■■■ 4.91
LRP4-205	ENST00000534404	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		45.71	■■■■■ 4.91
LRP4-205	ENST00000534404	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		45.7	■■■■■ 4.91
LRP4-205	ENST00000534404	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	45.7	■■■■■ 4.91
LRP4-205	ENST00000534404	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	45.69	■■■■■ 4.9
LRP4-205	ENST00000534404	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	45.68	■■■■■ 4.9
LRP4-205	ENST00000534404	EXOC5	O00471	708 aa		45.66	■■■■■ 4.9
LRP4-205	ENST00000534404	HOXC9	P31274	260 aa		45.66	■■■■■ 4.9
LRP4-205	ENST00000534404	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	45.66	■■■■■ 4.9
LRP4-205	ENST00000534404	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		45.65	■■■■■ 4.9
LRP4-205	ENST00000534404	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	45.64	■■■■■ 4.9
LRP4-205	ENST00000534404	DISP2	A7MBM2	1401 aa		45.64	■■■■■ 4.9
LRP4-205	ENST00000534404	APBA3	O96018	575 aa		45.64	■■■■■ 4.9
LRP4-205	ENST00000534404	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		45.6	■■■■■ 4.89
LRP4-205	ENST00000534404	IL2RB	P14784	551 aa		45.59	■■■■■ 4.89
LRP4-205	ENST00000534404	RTL1	A6NKG5	1358 aa		45.58	■■■■■ 4.89
LRP4-205	ENST00000534404	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	45.57	■■■■■ 4.89
LRP4-205	ENST00000534404	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	45.55	■■■■■ 4.88
LRP4-205	ENST00000534404	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	45.53	■■■■■ 4.88
LRP4-205	ENST00000534404	PEAK1	Q9H792	1746 aa		45.52	■■■■■ 4.88
LRP4-205	ENST00000534404	PANK3	Q9H999	370 aa		45.52	■■■■■ 4.88
LRP4-205	ENST00000534404	TNS2	Q63HR2	1409 aa		45.51	■■■■■ 4.88
LRP4-205	ENST00000534404	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		45.49	■■■■■ 4.87
LRP4-205	ENST00000534404	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	45.47	■■■■■ 4.87
LRP4-205	ENST00000534404	FLT4	P35916	1363 aa		45.44	■■■■■ 4.86
LRP4-205	ENST00000534404	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	45.43	■■■■■ 4.86
LRP4-205	ENST00000534404	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		45.43	■■■■■ 4.86
LRP4-205	ENST00000534404	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		45.43	■■■■■ 4.86
LRP4-205	ENST00000534404	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		45.42	■■■■■ 4.86
LRP4-205	ENST00000534404	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	45.41	■■■■■ 4.86
LRP4-205	ENST00000534404	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		45.41	■■■■■ 4.86
LRP4-205	ENST00000534404	INSR	P06213	1382 aa		45.4	■■■■■ 4.86
LRP4-205	ENST00000534404	BCL9	O00512	1426 aa		45.4	■■■■■ 4.86
LRP4-205	ENST00000534404	SBF2	Q86WG5	1849 aa		45.4	■■■■■ 4.86
LRP4-205	ENST00000534404	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		45.37	■■■■■ 4.85
LRP4-205	ENST00000534404	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	45.36	■■■■■ 4.85
LRP4-205	ENST00000534404	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	45.36	■■■■■ 4.85
LRP4-205	ENST00000534404	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		45.36	■■■■■ 4.85
LRP4-205	ENST00000534404	NBPF4	Q96M43	638 aa		45.36	■■■■■ 4.85
LRP4-205	ENST00000534404	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		45.35	■■■■■ 4.85
LRP4-205	ENST00000534404	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		45.34	■■■■■ 4.85
LRP4-205	ENST00000534404	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		45.33	■■■■■ 4.85
LRP4-205	ENST00000534404	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	45.33	■■■■■ 4.85
LRP4-205	ENST00000534404	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		45.31	■■■■■ 4.84
LRP4-205	ENST00000534404	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		45.31	■■■■■ 4.84
LRP4-205	ENST00000534404	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		45.31	■■■■■ 4.84
LRP4-205	ENST00000534404	PLSCR1	O15162	318 aa		45.29	■■■■■ 4.84
LRP4-205	ENST00000534404	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	45.28	■■■■■ 4.84
LRP4-205	ENST00000534404	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		45.28	■■■■■ 4.84
LRP4-205	ENST00000534404	NSD2	O96028	1365 aa		45.27	■■■■■ 4.84
LRP4-205	ENST00000534404	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	45.26	■■■■■ 4.84
LRP4-205	ENST00000534404	NBPF14	Q5TI25	921 aa		45.26	■■■■■ 4.84
LRP4-205	ENST00000534404	POLK	Q9UBT6	870 aa		45.26	■■■■■ 4.84
LRP4-205	ENST00000534404	RREB1	Q92766	1687 aa		45.25	■■■■■ 4.83
LRP4-205	ENST00000534404	KCNQ2	O43526	872 aa		45.25	■■■■■ 4.83
LRP4-205	ENST00000534404	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	45.25	■■■■■ 4.83
LRP4-205	ENST00000534404	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		45.24	■■■■■ 4.83
LRP4-205	ENST00000534404	MEGF6	O75095	1541 aa		45.23	■■■■■ 4.83

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