RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532928.1

DDX25-208, Transcript of DEAD-box helicase 25, human

TSL 3

Gene DDX25, Length 726 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX25-208	ENST00000532928	DDB1	Q16531	1140 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DDX25-208	ENST00000532928	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DDX25-208	ENST00000532928	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
DDX25-208	ENST00000532928	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
DDX25-208	ENST00000532928	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
DDX25-208	ENST00000532928	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DDX25-208	ENST00000532928	UTRN	P46939	3433 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DDX25-208	ENST00000532928	LTN1	O94822	1766 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DDX25-208	ENST00000532928	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DDX25-208	ENST00000532928	EVC2	Q86UK5	1308 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DDX25-208	ENST00000532928	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DDX25-208	ENST00000532928	NFAT5	O94916	1531 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DDX25-208	ENST00000532928	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
DDX25-208	ENST00000532928	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
DDX25-208	ENST00000532928	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		11.15	□□□□□ -0.62
DDX25-208	ENST00000532928	MYOM1	P52179	1685 aa		11.15	□□□□□ -0.62
DDX25-208	ENST00000532928	KCNQ2	O43526	872 aa		11.15	□□□□□ -0.62
DDX25-208	ENST00000532928	NEUROD1	Q13562	356 aa		11.15	□□□□□ -0.62
DDX25-208	ENST00000532928	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		11.15	□□□□□ -0.62
DDX25-208	ENST00000532928	SPON1	Q9HCB6	807 aa		11.15	□□□□□ -0.62
DDX25-208	ENST00000532928	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
DDX25-208	ENST00000532928	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		11.14	□□□□□ -0.63
DDX25-208	ENST00000532928	PROM2	Q8N271	834 aa		11.14	□□□□□ -0.63
DDX25-208	ENST00000532928	PLSCR1	O15162	318 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDX25-208	ENST00000532928	YY1	P25490	414 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDX25-208	ENST00000532928	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
DDX25-208	ENST00000532928	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
DDX25-208	ENST00000532928	NHS	Q6T4R5	1651 aa		11.12	□□□□□ -0.63
DDX25-208	ENST00000532928	ZBTB7A	O95365	584 aa		11.12	□□□□□ -0.63
DDX25-208	ENST00000532928	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	11.12	□□□□□ -0.63
DDX25-208	ENST00000532928	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		11.11	□□□□□ -0.63
DDX25-208	ENST00000532928	USP54	Q70EL1	1684 aa		11.11	□□□□□ -0.63
DDX25-208	ENST00000532928	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
DDX25-208	ENST00000532928	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		11.11	□□□□□ -0.63
DDX25-208	ENST00000532928	ZNF692	Q9BU19	519 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
DDX25-208	ENST00000532928	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		11.11	□□□□□ -0.63
DDX25-208	ENST00000532928	BTAF1	O14981	1849 aa		11.11	□□□□□ -0.63
DDX25-208	ENST00000532928	CD163L1	Q9NR16	1453 aa		11.11	□□□□□ -0.63
DDX25-208	ENST00000532928	TNS2	Q63HR2	1409 aa		11.1	□□□□□ -0.63
DDX25-208	ENST00000532928	TXNRD1	Q16881	649 aa		11.1	□□□□□ -0.63
DDX25-208	ENST00000532928	NME9	Q86XW9	330 aa		11.1	□□□□□ -0.63
DDX25-208	ENST00000532928	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		11.1	□□□□□ -0.63
DDX25-208	ENST00000532928	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		11.1	□□□□□ -0.63
DDX25-208	ENST00000532928	BCL9	O00512	1426 aa		11.09	□□□□□ -0.63
DDX25-208	ENST00000532928	EXOC5	O00471	708 aa		11.09	□□□□□ -0.63
DDX25-208	ENST00000532928	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
DDX25-208	ENST00000532928	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
DDX25-208	ENST00000532928	ABCC6	O95255	1503 aa		11.09	□□□□□ -0.63
DDX25-208	ENST00000532928	CCDC7	Q96M83	1385 aa		11.08	□□□□□ -0.64
DDX25-208	ENST00000532928	PTGER2	P43116	358 aa		11.08	□□□□□ -0.64
DDX25-208	ENST00000532928	PAPPA	Q13219	1627 aa		11.08	□□□□□ -0.64
DDX25-208	ENST00000532928	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		11.08	□□□□□ -0.64
DDX25-208	ENST00000532928	ERBB3	P21860	1342 aa		11.08	□□□□□ -0.64
DDX25-208	ENST00000532928	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		11.07	□□□□□ -0.64
DDX25-208	ENST00000532928	TMC1	Q8TDI8	760 aa		11.07	□□□□□ -0.64
DDX25-208	ENST00000532928	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		11.07	□□□□□ -0.64
DDX25-208	ENST00000532928	STK32B	Q9NY57	414 aa		11.07	□□□□□ -0.64
DDX25-208	ENST00000532928	USP31	Q70CQ4	1352 aa		11.06	□□□□□ -0.64
DDX25-208	ENST00000532928	SLC15A2	Q16348	729 aa		11.06	□□□□□ -0.64
DDX25-208	ENST00000532928	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		11.05	□□□□□ -0.64
DDX25-208	ENST00000532928	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		11.05	□□□□□ -0.64
DDX25-208	ENST00000532928	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		11.05	□□□□□ -0.64
DDX25-208	ENST00000532928	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		11.05	□□□□□ -0.64
DDX25-208	ENST00000532928		A0A1W2PP64	1363 aa		11.04	□□□□□ -0.64
DDX25-208	ENST00000532928	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		11.04	□□□□□ -0.64
DDX25-208	ENST00000532928	CHD4	Q14839	1912 aa		11.04	□□□□□ -0.64
DDX25-208	ENST00000532928	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	11.04	□□□□□ -0.64
DDX25-208	ENST00000532928	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		11.04	□□□□□ -0.64
DDX25-208	ENST00000532928	IL2RB	P14784	551 aa		11.04	□□□□□ -0.64
DDX25-208	ENST00000532928	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	11.04	□□□□□ -0.64
DDX25-208	ENST00000532928	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		11.04	□□□□□ -0.64
DDX25-208	ENST00000532928	ZNF827	Q17R98	1081 aa		11.03	□□□□□ -0.64
DDX25-208	ENST00000532928	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	11.03	□□□□□ -0.64
DDX25-208	ENST00000532928	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	11.02	□□□□□ -0.64
DDX25-208	ENST00000532928	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	11.02	□□□□□ -0.65
DDX25-208	ENST00000532928	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	11.02	□□□□□ -0.65
DDX25-208	ENST00000532928	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		11.02	□□□□□ -0.65
DDX25-208	ENST00000532928	SYT17	Q9BSW7	474 aa		11.02	□□□□□ -0.65
DDX25-208	ENST00000532928	MTFR1L	Q9H019	292 aa		11.02	□□□□□ -0.65
DDX25-208	ENST00000532928	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		11.02	□□□□□ -0.65
DDX25-208	ENST00000532928	FBLN1	P23142	703 aa		11.01	□□□□□ -0.65
DDX25-208	ENST00000532928	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		11.01	□□□□□ -0.65
DDX25-208	ENST00000532928	KCNQ4	P56696	695 aa		11	□□□□□ -0.65
DDX25-208	ENST00000532928	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	11	□□□□□ -0.65
DDX25-208	ENST00000532928	LY75	O60449	1722 aa		11	□□□□□ -0.65
DDX25-208	ENST00000532928	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		10.99	□□□□□ -0.65
DDX25-208	ENST00000532928	TONSL	Q96HA7	1378 aa		10.99	□□□□□ -0.65
DDX25-208	ENST00000532928	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	10.98	□□□□□ -0.65
DDX25-208	ENST00000532928	IP6K1	Q92551	441 aa		10.98	□□□□□ -0.65
DDX25-208	ENST00000532928	ARX	Q96QS3	562 aa		10.98	□□□□□ -0.65
DDX25-208	ENST00000532928	MEGF6	O75095	1541 aa		10.98	□□□□□ -0.65
DDX25-208	ENST00000532928	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		10.98	□□□□□ -0.65
DDX25-208	ENST00000532928	KLHL34	Q8N239	644 aa		10.97	□□□□□ -0.65
DDX25-208	ENST00000532928	AKT1S1	Q96B36	256 aa		10.97	□□□□□ -0.65
DDX25-208	ENST00000532928	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	10.97	□□□□□ -0.65
DDX25-208	ENST00000532928	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		10.97	□□□□□ -0.65
DDX25-208	ENST00000532928	NSD2	O96028	1365 aa		10.96	□□□□□ -0.65
DDX25-208	ENST00000532928	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		10.96	□□□□□ -0.65
DDX25-208	ENST00000532928	ST20-MTHFS	A0A0A6YYL1	179 aa		10.96	□□□□□ -0.65
DDX25-208	ENST00000532928	HOXC9	P31274	260 aa		10.96	□□□□□ -0.65

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.3 ms