RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531226.5

PACSIN3-208, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 5

Gene PACSIN3, Length 654 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-208ENST00000531226 GGNBP2Q9H3C7 697 aa26.26■■□□□ 1.79
PACSIN3-208ENST00000531226 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa26.25■■□□□ 1.79
PACSIN3-208ENST00000531226 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa26.25■■□□□ 1.79
PACSIN3-208ENST00000531226 WNK3Q9BYP7 1800 aa26.24■■□□□ 1.79
PACSIN3-208ENST00000531226 EVA1CP58658 441 aa26.24■■□□□ 1.79
PACSIN3-208ENST00000531226 PANK3Q9H999 370 aa26.24■■□□□ 1.79
PACSIN3-208ENST00000531226 CCDC7Q96M83 1385 aa26.23■■□□□ 1.79
PACSIN3-208ENST00000531226 CGNL1Q0VF96 1302 aa26.23■■□□□ 1.79
PACSIN3-208ENST00000531226 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa26.23■■□□□ 1.79
PACSIN3-208ENST00000531226 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
PACSIN3-208ENST00000531226 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa26.21■■□□□ 1.79
PACSIN3-208ENST00000531226 AXIN2Q9Y2T1 843 aa26.21■■□□□ 1.79
PACSIN3-208ENST00000531226 WASHC2AQ641Q2 1341 aa26.2■■□□□ 1.79
PACSIN3-208ENST00000531226 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
PACSIN3-208ENST00000531226 CRB1P82279 1406 aa26.2■■□□□ 1.78
PACSIN3-208ENST00000531226 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
PACSIN3-208ENST00000531226 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
PACSIN3-208ENST00000531226 WDR17Q8IZU2 1322 aa26.16■■□□□ 1.78
PACSIN3-208ENST00000531226 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
PACSIN3-208ENST00000531226 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
PACSIN3-208ENST00000531226 PEAK1Q9H792 1746 aa26.16■■□□□ 1.78
PACSIN3-208ENST00000531226 MAP3K19Q56UN5 1328 aa26.15■■□□□ 1.78
PACSIN3-208ENST00000531226 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
PACSIN3-208ENST00000531226 SEPT12Q8IYM1 358 aa26.15■■□□□ 1.78
PACSIN3-208ENST00000531226 NSD2O96028 1365 aa26.15■■□□□ 1.78
PACSIN3-208ENST00000531226 FBLN1P23142 703 aa26.14■■□□□ 1.78
PACSIN3-208ENST00000531226 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
PACSIN3-208ENST00000531226 RGPD2P0DJD1 1756 aa26.13■■□□□ 1.77
PACSIN3-208ENST00000531226 RTL1A6NKG5 1358 aa26.13■■□□□ 1.77
PACSIN3-208ENST00000531226 USP35Q9P2H5 1018 aa26.13■■□□□ 1.77
PACSIN3-208ENST00000531226 BARGINQ6ZT62 677 aa26.12■■□□□ 1.77
PACSIN3-208ENST00000531226 TCP11L2Q8N4U5 519 aa26.12■■□□□ 1.77
PACSIN3-208ENST00000531226 IP6K1Q92551 441 aa26.12■■□□□ 1.77
PACSIN3-208ENST00000531226 ERBB3P21860 1342 aa26.12■■□□□ 1.77
PACSIN3-208ENST00000531226 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa26.11■■□□□ 1.77
PACSIN3-208ENST00000531226 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
PACSIN3-208ENST00000531226 KNSTRNQ9Y448 316 aa26.11■■□□□ 1.77
PACSIN3-208ENST00000531226 A0A0G2JS52 829 aa26.1■■□□□ 1.77
PACSIN3-208ENST00000531226 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa26.1■■□□□ 1.77
PACSIN3-208ENST00000531226 MYT1Q01538 1121 aa26.1■■□□□ 1.77
PACSIN3-208ENST00000531226 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
PACSIN3-208ENST00000531226 HOXC9P31274 260 aa26.09■■□□□ 1.77
PACSIN3-208ENST00000531226 AMPHP49418 695 aa26.09■■□□□ 1.77
PACSIN3-208ENST00000531226 LRRC37A3O60309 1634 aa26.08■■□□□ 1.77
PACSIN3-208ENST00000531226 KIF24Q5T7B8 1368 aa26.07■■□□□ 1.76
PACSIN3-208ENST00000531226 ANKRD24Q8TF21 1146 aa26.07■■□□□ 1.76
PACSIN3-208ENST00000531226 CARD10Q9BWT7 1032 aa26.06■■□□□ 1.76
PACSIN3-208ENST00000531226 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
PACSIN3-208ENST00000531226 FLT4P35916 1363 aa26.05■■□□□ 1.76
PACSIN3-208ENST00000531226 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
PACSIN3-208ENST00000531226 KRT27Q7Z3Y8 459 aa26.04■■□□□ 1.76
PACSIN3-208ENST00000531226 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa26.02■■□□□ 1.76
PACSIN3-208ENST00000531226 DISP2A7MBM2 1401 aa26.02■■□□□ 1.76
PACSIN3-208ENST00000531226 INSRP06213 1382 aa26.01■■□□□ 1.75
PACSIN3-208ENST00000531226 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP26.01■■□□□ 1.75
PACSIN3-208ENST00000531226 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
PACSIN3-208ENST00000531226 NLRP2Q9NX02 1062 aa26■■□□□ 1.75
PACSIN3-208ENST00000531226 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
PACSIN3-208ENST00000531226 MORC1Q86VD1 984 aa25.99■■□□□ 1.75
PACSIN3-208ENST00000531226 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa25.98■■□□□ 1.75
PACSIN3-208ENST00000531226 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
PACSIN3-208ENST00000531226 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa25.98■■□□□ 1.75
PACSIN3-208ENST00000531226 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
PACSIN3-208ENST00000531226 POLKQ9UBT6 870 aa25.98■■□□□ 1.75
PACSIN3-208ENST00000531226 EP400Q96L91 3159 aa25.96■■□□□ 1.75
PACSIN3-208ENST00000531226 RGPD1P0DJD0 1748 aa25.96■■□□□ 1.75
PACSIN3-208ENST00000531226 SBF2Q86WG5 1849 aa25.94■■□□□ 1.74
PACSIN3-208ENST00000531226 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
PACSIN3-208ENST00000531226 PDE3BQ13370 1112 aa25.93■■□□□ 1.74
PACSIN3-208ENST00000531226 TNS2Q63HR2 1409 aa25.92■■□□□ 1.74
PACSIN3-208ENST00000531226 DDB1Q16531 1140 aa25.92■■□□□ 1.74
PACSIN3-208ENST00000531226 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
PACSIN3-208ENST00000531226 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
PACSIN3-208ENST00000531226 IL2RBP14784 551 aa25.91■■□□□ 1.74
PACSIN3-208ENST00000531226 FAM182BQ5T319 152 aa25.91■■□□□ 1.74
PACSIN3-208ENST00000531226 SHANK3Q9BYB0 1731 aa25.91■■□□□ 1.74
PACSIN3-208ENST00000531226 NBPF6Q5VWK0 638 aa25.88■■□□□ 1.73
PACSIN3-208ENST00000531226 NBPF4Q96M43 638 aa25.88■■□□□ 1.73
PACSIN3-208ENST00000531226 CCDC125Q86Z20 511 aa25.87■■□□□ 1.73
PACSIN3-208ENST00000531226 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa25.87■■□□□ 1.73
PACSIN3-208ENST00000531226 NCAPD2Q15021 1401 aa25.87■■□□□ 1.73
PACSIN3-208ENST00000531226 FAM196AQ6ZSG2 479 aa25.86■■□□□ 1.73
PACSIN3-208ENST00000531226 MEGF6O75095 1541 aa25.86■■□□□ 1.73
PACSIN3-208ENST00000531226 EXOC5O00471 708 aa25.85■■□□□ 1.73
PACSIN3-208ENST00000531226 USHBP1Q8N6Y0 703 aa25.84■■□□□ 1.73
PACSIN3-208ENST00000531226 PKD1L3Q7Z443 1732 aa25.83■■□□□ 1.73
PACSIN3-208ENST00000531226 KAT6BQ8WYB5 2073 aa25.83■■□□□ 1.73
PACSIN3-208ENST00000531226 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
PACSIN3-208ENST00000531226 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
PACSIN3-208ENST00000531226 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
PACSIN3-208ENST00000531226 BCL9O00512 1426 aa25.8■■□□□ 1.72
PACSIN3-208ENST00000531226 EYA1Q99502 592 aa25.8■■□□□ 1.72
PACSIN3-208ENST00000531226 MTHFSP49914 203 aa25.78■■□□□ 1.72
PACSIN3-208ENST00000531226 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
PACSIN3-208ENST00000531226 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa25.78■■□□□ 1.72
PACSIN3-208ENST00000531226 NHSQ6T4R5 1651 aa25.77■■□□□ 1.72
PACSIN3-208ENST00000531226 IGSF1Q8N6C5 1336 aa25.76■■□□□ 1.71
PACSIN3-208ENST00000531226 TRIM37O94972 964 aa25.75■■□□□ 1.71
PACSIN3-208ENST00000531226 TATP17735 454 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
PACSIN3-208ENST00000531226 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
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