RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517083.1

RNU6-548P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 548, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-548P, Length 115 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-548P-201ENST00000517083 ACAP1Q15027 740 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-548P-201ENST00000517083 ESCO1Q5FWF5 840 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-548P-201ENST00000517083 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
RNU6-548P-201ENST00000517083 LRCH3Q96II8 777 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-548P-201ENST00000517083 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
RNU6-548P-201ENST00000517083 BCS1LQ9Y276 419 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-548P-201ENST00000517083 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
RNU6-548P-201ENST00000517083 PASKQ96RG2 1323 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-548P-201ENST00000517083 UBR1Q8IWV7 1749 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-548P-201ENST00000517083 TRPM2O94759 1503 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-548P-201ENST00000517083 BARGINQ6ZT62 677 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-548P-201ENST00000517083 CAPNS2Q96L46 248 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-548P-201ENST00000517083 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-548P-201ENST00000517083 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-548P-201ENST00000517083 TECPR2O15040 1411 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-548P-201ENST00000517083 OVOS2Q6IE36 1432 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-548P-201ENST00000517083 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.86
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZFHX4Q86UP3 3567 aa3.4□□□□□ -1.86
RNU6-548P-201ENST00000517083 POTEMA6NI47 508 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-548P-201ENST00000517083 ECE1P42892 770 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-548P-201ENST00000517083 IDI1Q13907 227 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-548P-201ENST00000517083 Q7L0L9 218 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-548P-201ENST00000517083 AKT1S1Q96B36 256 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-548P-201ENST00000517083 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-548P-201ENST00000517083 MYO5CQ9NQX4 1742 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-548P-201ENST00000517083 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-548P-201ENST00000517083 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-548P-201ENST00000517083 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-548P-201ENST00000517083 HFM1A2PYH4 1435 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-548P-201ENST00000517083 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-548P-201ENST00000517083 POTEIP0CG38 1075 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-548P-201ENST00000517083 POTEJP0CG39 1038 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-548P-201ENST00000517083 CYP4F22Q6NT55 531 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-548P-201ENST00000517083 LMOD2Q6P5Q4 547 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-548P-201ENST00000517083 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-548P-201ENST00000517083 STRN4Q9NRL3 753 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-548P-201ENST00000517083 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-548P-201ENST00000517083 TTC28Q96AY4 2481 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-548P-201ENST00000517083 LAMC1P11047 1609 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-548P-201ENST00000517083 ABCA3Q99758 1704 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-548P-201ENST00000517083 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
RNU6-548P-201ENST00000517083 PTPN23Q9H3S7 1636 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-548P-201ENST00000517083 GLTPD2A6NH11 291 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-548P-201ENST00000517083 AOC2O75106 756 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-548P-201ENST00000517083 MAP2K2P36507 400 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-548P-201ENST00000517083 HDGFP51858 240 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
RNU6-548P-201ENST00000517083 MTMR10Q9NXD2 777 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-548P-201ENST00000517083 ATRXP46100 2492 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-548P-201ENST00000517083 KIF7Q2M1P5 1343 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-548P-201ENST00000517083 PRR36Q9H6K5 1346 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-548P-201ENST00000517083 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
RNU6-548P-201ENST00000517083 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-548P-201ENST00000517083 SSH2Q76I76 1423 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-548P-201ENST00000517083 POTECB2RU33 542 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-548P-201ENST00000517083 FCHSD2O94868 740 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-548P-201ENST00000517083 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
RNU6-548P-201ENST00000517083 TCP11L2Q8N4U5 519 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-548P-201ENST00000517083 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-548P-201ENST00000517083 LRRC4BQ9NT99 713 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-548P-201ENST00000517083 RPTORQ8N122 1335 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-548P-201ENST00000517083 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
RNU6-548P-201ENST00000517083 MTUS2Q5JR59 1369 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-548P-201ENST00000517083 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-548P-201ENST00000517083 LMTK2Q8IWU2 1503 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-548P-201ENST00000517083 DUOX2Q9NRD8 1548 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-548P-201ENST00000517083 POTEFA5A3E0 1075 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-548P-201ENST00000517083 GPR153Q6NV75 609 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-548P-201ENST00000517083 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-548P-201ENST00000517083 PRDM11Q9NQV5 511 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
RNU6-548P-201ENST00000517083 LTBP1Q14766 1721 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZFYVE9O95405 1425 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-548P-201ENST00000517083 CLIP1P30622 1438 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-548P-201ENST00000517083 USP6P35125 1406 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-548P-201ENST00000517083 MUC3AQ02505 3323 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-548P-201ENST00000517083 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
RNU6-548P-201ENST00000517083 RIMS2Q9UQ26 1411 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-548P-201ENST00000517083 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-548P-201ENST00000517083 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-548P-201ENST00000517083 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-548P-201ENST00000517083 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-548P-201ENST00000517083 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-548P-201ENST00000517083 CIAPIN1Q6FI81 312 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-548P-201ENST00000517083 POTEGQ6S5H5 508 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-548P-201ENST00000517083 LDHDQ86WU2 507 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-548P-201ENST00000517083 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-548P-201ENST00000517083 LURAP1LQ8IV03 231 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-548P-201ENST00000517083 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-548P-201ENST00000517083 PRO3102Q9H379 93 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-548P-201ENST00000517083 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-548P-201ENST00000517083 CCDC144AA2RUR9 1427 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-548P-201ENST00000517083 EEA1Q15075 1411 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-548P-201ENST00000517083 TNS3Q68CZ2 1445 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-548P-201ENST00000517083 NRXN1Q9ULB1 1477 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-548P-201ENST00000517083 PLCH1Q4KWH8 1693 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-548P-201ENST00000517083 NWD2Q9ULI1 1742 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-548P-201ENST00000517083 CENPFP49454 3210 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-548P-201ENST00000517083 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
RNU6-548P-201ENST00000517083 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-548P-201ENST00000517083 EVA1CP58658 441 aa3.34□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.7 ms