RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516272.1

RNU6-277P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 277, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-277P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-277P-201ENST00000516272 LORP23490 312 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
RNU6-277P-201ENST00000516272 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
RNU6-277P-201ENST00000516272 FKBPLQ9UIM3 349 aa7.46□□□□□ -1.22
RNU6-277P-201ENST00000516272 FIGNL2A6NMB9 653 aa7.45□□□□□ -1.22
RNU6-277P-201ENST00000516272 TTLL8A6PVC2 850 aa7.45□□□□□ -1.22
RNU6-277P-201ENST00000516272 VSIG8P0DPA2 414 aa7.45□□□□□ -1.22
RNU6-277P-201ENST00000516272 NR6A1Q15406 480 aa7.45□□□□□ -1.22
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP7.45□□□□□ -1.22
RNU6-277P-201ENST00000516272 PDXDC2PQ6P474 469 aa7.45□□□□□ -1.22
RNU6-277P-201ENST00000516272 AP1G2O75843 785 aa7.44□□□□□ -1.22
RNU6-277P-201ENST00000516272 CBLBQ13191 982 aa7.44□□□□□ -1.22
RNU6-277P-201ENST00000516272 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
RNU6-277P-201ENST00000516272 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
RNU6-277P-201ENST00000516272 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
RNU6-277P-201ENST00000516272 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
RNU6-277P-201ENST00000516272 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
RNU6-277P-201ENST00000516272 PTK2Q05397 1052 aa7.42□□□□□ -1.22
RNU6-277P-201ENST00000516272 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
RNU6-277P-201ENST00000516272 SH3D19Q5HYK7 790 aa7.42□□□□□ -1.22
RNU6-277P-201ENST00000516272 DDRGK1Q96HY6 314 aa7.42□□□□□ -1.22
RNU6-277P-201ENST00000516272 KDM4CQ9H3R0 1056 aa7.42□□□□□ -1.22
RNU6-277P-201ENST00000516272 RAB15P59190 212 aa7.41□□□□□ -1.22
RNU6-277P-201ENST00000516272 RELBQ01201 579 aa7.41□□□□□ -1.22
RNU6-277P-201ENST00000516272 PTSQ03393 145 aa7.41□□□□□ -1.22
RNU6-277P-201ENST00000516272 PNMA1Q8ND90 353 aa7.41□□□□□ -1.22
RNU6-277P-201ENST00000516272 FAM117AQ9C073 453 aa7.41□□□□□ -1.22
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
RNU6-277P-201ENST00000516272 Q6ZVU0 165 aa7.4□□□□□ -1.22
RNU6-277P-201ENST00000516272 AGBL1Q96MI9 1066 aa7.4□□□□□ -1.22
RNU6-277P-201ENST00000516272 SPINT1O43278 529 aa7.39□□□□□ -1.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 ADAM32Q8TC27 787 aa7.39□□□□□ -1.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 NBPF20Q3BBV1 942 aa7.38□□□□□ -1.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa7.38□□□□□ -1.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP7.38□□□□□ -1.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa7.38□□□□□ -1.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 PPP2R2DQ66LE6 453 aa7.37□□□□□ -1.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 CCDC155Q8N6L0 562 aa7.37□□□□□ -1.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 GPSM3Q9Y4H4 160 aa7.37□□□□□ -1.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 CDC14CA4D256 554 aa7.36□□□□□ -1.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 USP17L8P0C7I0 530 aa7.36□□□□□ -1.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 EPS8L1Q8TE68 723 aa7.36□□□□□ -1.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 OCSTAMPQ9BR26 566 aa7.36□□□□□ -1.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa7.36□□□□□ -1.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 KRT76Q01546 638 aa7.34□□□□□ -1.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
RNU6-277P-201ENST00000516272 VWA5B2Q8N398 1253 aa7.33□□□□□ -1.24
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLC35F4A4IF30 521 aa7.32□□□□□ -1.24
RNU6-277P-201ENST00000516272 ERVH48-1M5A8F1 160 aa7.32□□□□□ -1.24
RNU6-277P-201ENST00000516272 ADH1AP07327 375 aa7.32□□□□□ -1.24
RNU6-277P-201ENST00000516272 ITGA6P23229 1130 aa7.32□□□□□ -1.24
RNU6-277P-201ENST00000516272 RFC5P40937 340 aa7.32□□□□□ -1.24
RNU6-277P-201ENST00000516272 SV2AQ7L0J3 742 aa7.32□□□□□ -1.24
RNU6-277P-201ENST00000516272 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
RNU6-277P-201ENST00000516272 SVOPQ8N4V2 548 aa7.31□□□□□ -1.24
RNU6-277P-201ENST00000516272 RNF217Q8TC41 542 aa7.31□□□□□ -1.24
RNU6-277P-201ENST00000516272 BCANQ96GW7 911 aa7.31□□□□□ -1.24
RNU6-277P-201ENST00000516272 RNFT1Q5M7Z0 435 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-277P-201ENST00000516272 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
RNU6-277P-201ENST00000516272 CYLDQ9NQC7 956 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-277P-201ENST00000516272 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
RNU6-277P-201ENST00000516272 ADD1P35611 737 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
RNU6-277P-201ENST00000516272 PTGIRP43119 386 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU6-277P-201ENST00000516272 KCNMA1Q12791 1236 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU6-277P-201ENST00000516272 TRIM52Q96A61 297 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU6-277P-201ENST00000516272 ADAMTS8Q9UP79 889 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU6-277P-201ENST00000516272 LILRA1O75019 489 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU6-277P-201ENST00000516272 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
RNU6-277P-201ENST00000516272 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU6-277P-201ENST00000516272 KCTD17Q8N5Z5 321 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU6-277P-201ENST00000516272 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU6-277P-201ENST00000516272 ESPNB1AK53 854 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
RNU6-277P-201ENST00000516272 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU6-277P-201ENST00000516272 TMEM151AQ8N4L1 468 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU6-277P-201ENST00000516272 MEN1O00255 615 aa7.26□□□□□ -1.25
RNU6-277P-201ENST00000516272 GDF11O95390 407 aa7.26□□□□□ -1.25
RNU6-277P-201ENST00000516272 TMEM259Q4ZIN3 620 aa7.26□□□□□ -1.25
RNU6-277P-201ENST00000516272 SEPT12Q8IYM1 358 aa7.26□□□□□ -1.25
RNU6-277P-201ENST00000516272 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa7.25□□□□□ -1.25
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZBBXA8MT70 800 aa7.25□□□□□ -1.25
RNU6-277P-201ENST00000516272 RHOQP17081 205 aa7.25□□□□□ -1.25
RNU6-277P-201ENST00000516272 RASSF7Q02833 373 aa7.25□□□□□ -1.25
RNU6-277P-201ENST00000516272 TRIM34Q9BYJ4 488 aa7.25□□□□□ -1.25
RNU6-277P-201ENST00000516272 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa7.24□□□□□ -1.25
RNU6-277P-201ENST00000516272 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
RNU6-277P-201ENST00000516272 MARSP56192 900 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
RNU6-277P-201ENST00000516272 NEUROD2Q15784 382 aa7.24□□□□□ -1.25
RNU6-277P-201ENST00000516272 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
RNU6-277P-201ENST00000516272 WHAMMQ8TF30 809 aa7.24□□□□□ -1.25
RNU6-277P-201ENST00000516272 ADAMTS2O95450 1211 aa7.23□□□□□ -1.25
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