RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513165.1

HOXC-AS3-202, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 533 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-202ENST00000513165 COL18A1P39060 1754 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PDE3BQ13370 1112 aa23.62■■□□□ 1.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NME9Q86XW9 330 aa23.62■■□□□ 1.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 A0A1W2PP64 1363 aa23.62■■□□□ 1.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SOX12O15370 315 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 BAG6P46379 1132 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 WDR17Q8IZU2 1322 aa23.6■■□□□ 1.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa23.6■■□□□ 1.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NFAT5O94916 1531 aa23.59■■□□□ 1.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CDCA8Q53HL2 280 aa23.58■■□□□ 1.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 USP54Q70EL1 1684 aa23.57■■□□□ 1.36
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ABCC6O95255 1503 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CARD10Q9BWT7 1032 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa23.54■■□□□ 1.36
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa23.53■■□□□ 1.36
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RGPD1P0DJD0 1748 aa23.53■■□□□ 1.36
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TRIM37O94972 964 aa23.53■■□□□ 1.36
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DISP2A7MBM2 1401 aa23.52■■□□□ 1.36
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
HOXC-AS3-202ENST00000513165 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXC-AS3-202ENST00000513165 OVOS2Q6IE36 1432 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXC-AS3-202ENST00000513165 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DDB1Q16531 1140 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXC-AS3-202ENST00000513165 COG3Q96JB2 828 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RGPD5Q99666 1765 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CCDC7Q96M83 1385 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXC-AS3-202ENST00000513165 APBA3O96018 575 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CAMKK2Q96RR4 588 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ERBB3P21860 1342 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IP6K1Q92551 441 aa23.46■■□□□ 1.35
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FYB1O15117 783 aa23.45■■□□□ 1.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa23.44■■□□□ 1.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PARD3Q8TEW0 1356 aa23.44■■□□□ 1.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 EXOC5O00471 708 aa23.44■■□□□ 1.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ANKRD24Q8TF21 1146 aa23.44■■□□□ 1.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LTN1O94822 1766 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NLRP2Q9NX02 1062 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LRRC37A3O60309 1634 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 BCL9O00512 1426 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PEAK1Q9H792 1746 aa23.39■■□□□ 1.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MAP3K19Q56UN5 1328 aa23.39■■□□□ 1.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 WNK3Q9BYP7 1800 aa23.39■■□□□ 1.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP23.39■■□□□ 1.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GGNBP2Q9H3C7 697 aa23.39■■□□□ 1.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IL2RBP14784 551 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 AMPHP49418 695 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HOXC9P31274 260 aa23.37■■□□□ 1.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CARD14Q9BXL6 1004 aa23.37■■□□□ 1.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PLSCR1O15162 318 aa23.36■■□□□ 1.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FBLN1P23142 703 aa23.36■■□□□ 1.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RTL1A6NKG5 1358 aa23.33■■□□□ 1.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TNS2Q63HR2 1409 aa23.33■■□□□ 1.32
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SBF2Q86WG5 1849 aa23.32■■□□□ 1.32
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
HOXC-AS3-202ENST00000513165 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NBPF14Q5TI25 921 aa23.31■■□□□ 1.32
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MYOM1P52179 1685 aa23.31■■□□□ 1.32
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NSD3Q9BZ95 1437 aa23.3■■□□□ 1.32
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KIF24Q5T7B8 1368 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PTF1AQ7RTS3 328 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RREB1Q92766 1687 aa23.27■■□□□ 1.32
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CGNL1Q0VF96 1302 aa23.27■■□□□ 1.32
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KIF20BQ96Q89 1820 aa23.26■■□□□ 1.31
HOXC-AS3-202ENST00000513165 POLR3GLQ9BT43 218 aa23.26■■□□□ 1.31
HOXC-AS3-202ENST00000513165 INSRP06213 1382 aa23.25■■□□□ 1.31
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NBPF6Q5VWK0 638 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NBPF4Q96M43 638 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FLT4P35916 1363 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KCNQ2O43526 872 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PROM2Q8N271 834 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NUP188Q5SRE5 1749 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LRP5O75197 1615 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ACSBG1Q96GR2 724 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TXNRD1Q16881 649 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PANK3Q9H999 370 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXC-AS3-202ENST00000513165 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXC-AS3-202ENST00000513165 WASHC2AQ641Q2 1341 aa23.17■■□□□ 1.3
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa23.17■■□□□ 1.3
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NHSQ6T4R5 1651 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RGPD2P0DJD1 1756 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXC-AS3-202ENST00000513165 POLKQ9UBT6 870 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MEGF6O75095 1541 aa23.14■■□□□ 1.3
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