RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511587.1

ZBED3-203, Transcript of zinc finger BED-type containing 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene ZBED3, Length 542 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3-203ENST00000511587 PDE3BQ13370 1112 aa32.04■■■□□ 2.72
ZBED3-203ENST00000511587 WDR17Q8IZU2 1322 aa32.03■■■□□ 2.72
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ZBED3-203ENST00000511587 TMC1Q8TDI8 760 aa32.03■■■□□ 2.72
ZBED3-203ENST00000511587 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP32.02■■■□□ 2.72
ZBED3-203ENST00000511587 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP32.02■■■□□ 2.72
ZBED3-203ENST00000511587 A0A1W2PP64 1363 aa32.02■■■□□ 2.72
ZBED3-203ENST00000511587 PEAK1Q9H792 1746 aa32.01■■■□□ 2.72
ZBED3-203ENST00000511587 SOX12O15370 315 aa32.01■■■□□ 2.71
ZBED3-203ENST00000511587 TRIM37O94972 964 aa32.01■■■□□ 2.71
ZBED3-203ENST00000511587 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP32■■■□□ 2.71
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ZBED3-203ENST00000511587 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa31.97■■■□□ 2.71
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ZBED3-203ENST00000511587 OVOS2Q6IE36 1432 aa31.95■■■□□ 2.71
ZBED3-203ENST00000511587 LTN1O94822 1766 aa31.95■■■□□ 2.71
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ZBED3-203ENST00000511587 SLC24A1O60721 1099 aa31.93■■■□□ 2.7
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ZBED3-203ENST00000511587 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa31.92■■■□□ 2.7
ZBED3-203ENST00000511587 CARD10Q9BWT7 1032 aa31.92■■■□□ 2.7
ZBED3-203ENST00000511587 LRP5O75197 1615 aa31.92■■■□□ 2.7
ZBED3-203ENST00000511587 USP47Q96K76 1375 aa31.92■■■□□ 2.7
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ZBED3-203ENST00000511587 DDB1Q16531 1140 aa31.9■■■□□ 2.7
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ZBED3-203ENST00000511587 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP31.89■■■□□ 2.7
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ZBED3-203ENST00000511587 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa31.85■■■□□ 2.69
ZBED3-203ENST00000511587 BCL9O00512 1426 aa31.84■■■□□ 2.69
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ZBED3-203ENST00000511587 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa31.82■■■□□ 2.68
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ZBED3-203ENST00000511587 PCGF6Q9BYE7 350 aa31.75■■■□□ 2.67
ZBED3-203ENST00000511587 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP31.74■■■□□ 2.67
ZBED3-203ENST00000511587 NLRP2Q9NX02 1062 aa31.74■■■□□ 2.67
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ZBED3-203ENST00000511587 PTF1AQ7RTS3 328 aa31.73■■■□□ 2.67
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ZBED3-203ENST00000511587 FBLN1P23142 703 aa31.65■■■□□ 2.66
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ZBED3-203ENST00000511587 RGPD2P0DJD1 1756 aa31.6■■■□□ 2.65
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ZBED3-203ENST00000511587 MEGF6O75095 1541 aa31.5■■■□□ 2.63
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ZBED3-203ENST00000511587 FLT4P35916 1363 aa31.47■■■□□ 2.63
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ZBED3-203ENST00000511587 DOT1LQ8TEK3 1739 aa31.43■■■□□ 2.62
ZBED3-203ENST00000511587 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP31.42■■■□□ 2.62
ZBED3-203ENST00000511587 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP31.41■■■□□ 2.62
ZBED3-203ENST00000511587 SPON1Q9HCB6 807 aa31.41■■■□□ 2.62
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