RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511347.5

SPATA20-217, Transcript of spermatogenesis associated 20, humanhuman

TSL 5

Gene SPATA20, Length 1,035 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA20-217ENST00000511347 GGNBP2Q9H3C7 697 aa22.21■■□□□ 1.15
SPATA20-217ENST00000511347 USP35Q9P2H5 1018 aa22.21■■□□□ 1.15
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SPATA20-217ENST00000511347 USP54Q70EL1 1684 aa22.2■■□□□ 1.14
SPATA20-217ENST00000511347 NSD3Q9BZ95 1437 aa22.19■■□□□ 1.14
SPATA20-217ENST00000511347 MYOM1P52179 1685 aa22.19■■□□□ 1.14
SPATA20-217ENST00000511347 TCP11L2Q8N4U5 519 aa22.18■■□□□ 1.14
SPATA20-217ENST00000511347 FBLN1P23142 703 aa22.17■■□□□ 1.14
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SPATA20-217ENST00000511347 COL18A1P39060 1754 aa22.17■■□□□ 1.14
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SPATA20-217ENST00000511347 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa22.16■■□□□ 1.14
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SPATA20-217ENST00000511347 FAM182BQ5T319 152 aa22.06■■□□□ 1.12
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SPATA20-217ENST00000511347 WASHC2AQ641Q2 1341 aa22.04■■□□□ 1.12
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SPATA20-217ENST00000511347 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa22.01■■□□□ 1.11
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SPATA20-217ENST00000511347 BCL9O00512 1426 aa21.82■■□□□ 1.08
SPATA20-217ENST00000511347 TATP17735 454 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
SPATA20-217ENST00000511347 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
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SPATA20-217ENST00000511347 MEGF6O75095 1541 aa21.81■■□□□ 1.08
SPATA20-217ENST00000511347 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
SPATA20-217ENST00000511347 RGPD1P0DJD0 1748 aa21.8■■□□□ 1.08
SPATA20-217ENST00000511347 MTHFSP49914 203 aa21.79■■□□□ 1.08
SPATA20-217ENST00000511347 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
SPATA20-217ENST00000511347 PTF1AQ7RTS3 328 aa21.79■■□□□ 1.08
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