RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507538.1

RASGEF1B-205, Transcript of RasGEF domain family member 1B, humanhuman

TSL 3

Gene RASGEF1B, Length 691 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1B-205ENST00000507538 KNSTRNQ9Y448 316 aa24.7■■□□□ 1.54
RASGEF1B-205ENST00000507538 RGS12O14924 1447 aa24.69■■□□□ 1.54
RASGEF1B-205ENST00000507538 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa24.69■■□□□ 1.54
RASGEF1B-205ENST00000507538 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa24.69■■□□□ 1.54
RASGEF1B-205ENST00000507538 AXIN2Q9Y2T1 843 aa24.69■■□□□ 1.54
RASGEF1B-205ENST00000507538 COL18A1P39060 1754 aa24.69■■□□□ 1.54
RASGEF1B-205ENST00000507538 NSD2O96028 1365 aa24.68■■□□□ 1.54
RASGEF1B-205ENST00000507538 MAP3K19Q56UN5 1328 aa24.67■■□□□ 1.54
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RASGEF1B-205ENST00000507538 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa24.65■■□□□ 1.54
RASGEF1B-205ENST00000507538 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
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RASGEF1B-205ENST00000507538 IP6K1Q92551 441 aa24.63■■□□□ 1.53
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RASGEF1B-205ENST00000507538 WDR17Q8IZU2 1322 aa24.62■■□□□ 1.53
RASGEF1B-205ENST00000507538 LTN1O94822 1766 aa24.62■■□□□ 1.53
RASGEF1B-205ENST00000507538 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
RASGEF1B-205ENST00000507538 CRB1P82279 1406 aa24.62■■□□□ 1.53
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RASGEF1B-205ENST00000507538 ERBB3P21860 1342 aa24.6■■□□□ 1.53
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RASGEF1B-205ENST00000507538 SEPT12Q8IYM1 358 aa24.58■■□□□ 1.53
RASGEF1B-205ENST00000507538 TCP11L2Q8N4U5 519 aa24.58■■□□□ 1.53
RASGEF1B-205ENST00000507538 ANKRD24Q8TF21 1146 aa24.58■■□□□ 1.53
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RASGEF1B-205ENST00000507538 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa24.57■■□□□ 1.52
RASGEF1B-205ENST00000507538 FLT4P35916 1363 aa24.56■■□□□ 1.52
RASGEF1B-205ENST00000507538 BARGINQ6ZT62 677 aa24.56■■□□□ 1.52
RASGEF1B-205ENST00000507538 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
RASGEF1B-205ENST00000507538 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa24.55■■□□□ 1.52
RASGEF1B-205ENST00000507538 A0A0G2JS52 829 aa24.55■■□□□ 1.52
RASGEF1B-205ENST00000507538 MYT1Q01538 1121 aa24.55■■□□□ 1.52
RASGEF1B-205ENST00000507538 CARD10Q9BWT7 1032 aa24.55■■□□□ 1.52
RASGEF1B-205ENST00000507538 SOCS7O14512 581 aa24.54■■□□□ 1.52
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RASGEF1B-205ENST00000507538 PEAK1Q9H792 1746 aa24.54■■□□□ 1.52
RASGEF1B-205ENST00000507538 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa24.53■■□□□ 1.52
RASGEF1B-205ENST00000507538 RGPD5Q99666 1765 aa24.53■■□□□ 1.52
RASGEF1B-205ENST00000507538 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
RASGEF1B-205ENST00000507538 POLKQ9UBT6 870 aa24.53■■□□□ 1.52
RASGEF1B-205ENST00000507538 INSRP06213 1382 aa24.53■■□□□ 1.52
RASGEF1B-205ENST00000507538 NLRP2Q9NX02 1062 aa24.52■■□□□ 1.52
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RASGEF1B-205ENST00000507538 NBPF4Q96M43 638 aa24.42■■□□□ 1.5
RASGEF1B-205ENST00000507538 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
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RASGEF1B-205ENST00000507538 DDB1Q16531 1140 aa24.39■■□□□ 1.49
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RASGEF1B-205ENST00000507538 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
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RASGEF1B-205ENST00000507538 EP400Q96L91 3159 aa24.22■■□□□ 1.47
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