RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498648.5

STRADB-210, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta, humanhuman

TSL 3

Gene STRADB, Length 535 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADB-210ENST00000498648 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
STRADB-210ENST00000498648 F12P00748 615 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
STRADB-210ENST00000498648 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
STRADB-210ENST00000498648 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa7.14□□□□□ -1.27
STRADB-210ENST00000498648 PRIMPOLQ96LW4 560 aa7.14□□□□□ -1.27
STRADB-210ENST00000498648 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
STRADB-210ENST00000498648 LHX6Q9UPM6 363 aa7.14□□□□□ -1.27
STRADB-210ENST00000498648 CFHP08603 1231 aa7.13□□□□□ -1.27
STRADB-210ENST00000498648 LDLRAD1Q5T700 205 aa7.13□□□□□ -1.27
STRADB-210ENST00000498648 C9orf131Q5VYM1 1079 aa7.13□□□□□ -1.27
STRADB-210ENST00000498648 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
STRADB-210ENST00000498648 KIAA1024Q9UPX6 916 aa7.13□□□□□ -1.27
STRADB-210ENST00000498648 NOD1Q9Y239 953 aa7.13□□□□□ -1.27
STRADB-210ENST00000498648 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
STRADB-210ENST00000498648 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
STRADB-210ENST00000498648 SEC13P55735 322 aa7.12□□□□□ -1.27
STRADB-210ENST00000498648 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP7.12□□□□□ -1.27
STRADB-210ENST00000498648 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
STRADB-210ENST00000498648 GPR153Q6NV75 609 aa7.12□□□□□ -1.27
STRADB-210ENST00000498648 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
STRADB-210ENST00000498648 POLR3GLQ9BT43 218 aa7.12□□□□□ -1.27
STRADB-210ENST00000498648 TANGO6Q9C0B7 1094 aa7.12□□□□□ -1.27
STRADB-210ENST00000498648 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa7.12□□□□□ -1.27
STRADB-210ENST00000498648 GPSM3Q9Y4H4 160 aa7.12□□□□□ -1.27
STRADB-210ENST00000498648 P4HBP07237 508 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
STRADB-210ENST00000498648 TINF2Q9BSI4 451 aa7.11□□□□□ -1.27
STRADB-210ENST00000498648 LNPKQ9C0E8 428 aa7.11□□□□□ -1.27
STRADB-210ENST00000498648 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
STRADB-210ENST00000498648 KIAA1468Q9P260 1216 aa7.11□□□□□ -1.27
STRADB-210ENST00000498648 SEPT3Q9UH03 358 aa7.11□□□□□ -1.27
STRADB-210ENST00000498648 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
STRADB-210ENST00000498648 SLC4A3P48751 1232 aa7.1□□□□□ -1.27
STRADB-210ENST00000498648 DOK7Q18PE1 504 aa7.1□□□□□ -1.27
STRADB-210ENST00000498648 Q3C1V9 767 aa7.1□□□□□ -1.27
STRADB-210ENST00000498648 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
STRADB-210ENST00000498648 OCSTAMPQ9BR26 566 aa7.1□□□□□ -1.27
STRADB-210ENST00000498648 MAP10Q9P2G4 905 aa7.1□□□□□ -1.27
STRADB-210ENST00000498648 BRPF3Q9ULD4 1205 aa7.1□□□□□ -1.27
STRADB-210ENST00000498648 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa7.1□□□□□ -1.27
STRADB-210ENST00000498648 PTK2Q05397 1052 aa7.09□□□□□ -1.27
STRADB-210ENST00000498648 MTMR3Q13615 1198 aa7.09□□□□□ -1.27
STRADB-210ENST00000498648 MORN1Q5T089 497 aa7.09□□□□□ -1.27
STRADB-210ENST00000498648 NT5DC4Q86YG4 428 aa7.09□□□□□ -1.27
STRADB-210ENST00000498648 SLC43A3Q8NBI5 491 aa7.09□□□□□ -1.27
STRADB-210ENST00000498648 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
STRADB-210ENST00000498648 RBCK1Q9BYM8 510 aa7.09□□□□□ -1.27
STRADB-210ENST00000498648 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
STRADB-210ENST00000498648 GTF2IP78347 998 aa7.08□□□□□ -1.28
STRADB-210ENST00000498648 TSGA10IPQ3SY00 556 aa7.08□□□□□ -1.28
STRADB-210ENST00000498648 PDXDC2PQ6P474 469 aa7.08□□□□□ -1.28
STRADB-210ENST00000498648 ZNF662Q6ZS27 426 aa7.08□□□□□ -1.28
STRADB-210ENST00000498648 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa7.08□□□□□ -1.28
STRADB-210ENST00000498648 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
STRADB-210ENST00000498648 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
STRADB-210ENST00000498648 SFI1A8K8P3 1242 aa7.07□□□□□ -1.28
STRADB-210ENST00000498648 RIMBP2O15034 1052 aa7.07□□□□□ -1.28
STRADB-210ENST00000498648 HDGFP51858 240 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
STRADB-210ENST00000498648 EVX2Q03828 476 aa7.07□□□□□ -1.28
STRADB-210ENST00000498648 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP7.07□□□□□ -1.28
STRADB-210ENST00000498648 CCDC102BQ68D86 513 aa7.07□□□□□ -1.28
STRADB-210ENST00000498648 TMC7Q7Z402 723 aa7.07□□□□□ -1.28
STRADB-210ENST00000498648 TMEM87AQ8NBN3 555 aa7.07□□□□□ -1.28
STRADB-210ENST00000498648 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP7.07□□□□□ -1.28
STRADB-210ENST00000498648 MKNK1Q9BUB5 465 aa7.07□□□□□ -1.28
STRADB-210ENST00000498648 TGIF2Q9GZN2 237 aa7.07□□□□□ -1.28
STRADB-210ENST00000498648 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
STRADB-210ENST00000498648 NLRP2Q9NX02 1062 aa7.07□□□□□ -1.28
STRADB-210ENST00000498648 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa7.07□□□□□ -1.28
STRADB-210ENST00000498648 METRNQ9UJH8 293 aa7.07□□□□□ -1.28
STRADB-210ENST00000498648 TREHO43280 583 aa7.06□□□□□ -1.28
STRADB-210ENST00000498648 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
STRADB-210ENST00000498648 PTPRNQ16849 979 aa7.06□□□□□ -1.28
STRADB-210ENST00000498648 KMT5BQ4FZB7 885 aa7.06□□□□□ -1.28
STRADB-210ENST00000498648 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa7.06□□□□□ -1.28
STRADB-210ENST00000498648 TPCN2Q8NHX9 752 aa7.06□□□□□ -1.28
STRADB-210ENST00000498648 ARMC5Q96C12 935 aa7.06□□□□□ -1.28
STRADB-210ENST00000498648 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
STRADB-210ENST00000498648 DOLKQ9UPQ8 538 aa7.06□□□□□ -1.28
STRADB-210ENST00000498648 TLDC2A0PJX2 215 aa7.05□□□□□ -1.28
STRADB-210ENST00000498648 NPR3P17342 541 aa7.05□□□□□ -1.28
STRADB-210ENST00000498648 WEE1P30291 646 aa7.05□□□□□ -1.28
STRADB-210ENST00000498648 FGD1P98174 961 aa7.05□□□□□ -1.28
STRADB-210ENST00000498648 FANCCQ00597 558 aa7.05□□□□□ -1.28
STRADB-210ENST00000498648 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
STRADB-210ENST00000498648 CAPN12Q6ZSI9 719 aa7.05□□□□□ -1.28
STRADB-210ENST00000498648 HELQQ8TDG4 1101 aa7.05□□□□□ -1.28
STRADB-210ENST00000498648 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
STRADB-210ENST00000498648 ZBED2Q9BTP6 218 aa7.05□□□□□ -1.28
STRADB-210ENST00000498648 ATP2B1P20020 1258 aa7.04□□□□□ -1.28
STRADB-210ENST00000498648 ITGAEP38570 1179 aa7.04□□□□□ -1.28
STRADB-210ENST00000498648 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
STRADB-210ENST00000498648 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
STRADB-210ENST00000498648 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa7.04□□□□□ -1.28
STRADB-210ENST00000498648 TMC4Q7Z404 712 aa7.04□□□□□ -1.28
STRADB-210ENST00000498648 ADAM32Q8TC27 787 aa7.04□□□□□ -1.28
STRADB-210ENST00000498648 RNF34Q969K3 372 aa7.04□□□□□ -1.28
STRADB-210ENST00000498648 COL26A1Q96A83 441 aa7.04□□□□□ -1.28
STRADB-210ENST00000498648 KCNK17Q96T54 332 aa7.04□□□□□ -1.28
STRADB-210ENST00000498648 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
STRADB-210ENST00000498648 CCSER2Q9H7U1 834 aa7.04□□□□□ -1.28
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