RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496764.6

ARHGEF4-210, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 4, humanhuman

TSL 5

Gene ARHGEF4, Length 840 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF4-210ENST00000496764 COG3Q96JB2 828 aa28.24■■■□□ 2.11
ARHGEF4-210ENST00000496764 NSD3Q9BZ95 1437 aa28.24■■■□□ 2.11
ARHGEF4-210ENST00000496764 ABCC6O95255 1503 aa28.23■■■□□ 2.11
ARHGEF4-210ENST00000496764 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP28.23■■■□□ 2.11
ARHGEF4-210ENST00000496764 GGNBP2Q9H3C7 697 aa28.22■■■□□ 2.11
ARHGEF4-210ENST00000496764 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa28.19■■■□□ 2.1
ARHGEF4-210ENST00000496764 KIF7Q2M1P5 1343 aa28.19■■■□□ 2.1
ARHGEF4-210ENST00000496764 USP35Q9P2H5 1018 aa28.19■■■□□ 2.1
ARHGEF4-210ENST00000496764 CRB1P82279 1406 aa28.18■■■□□ 2.1
ARHGEF4-210ENST00000496764 BARGINQ6ZT62 677 aa28.18■■■□□ 2.1
ARHGEF4-210ENST00000496764 WDR17Q8IZU2 1322 aa28.18■■■□□ 2.1
ARHGEF4-210ENST00000496764 TCP11L2Q8N4U5 519 aa28.17■■■□□ 2.1
ARHGEF4-210ENST00000496764 BRWD3Q6RI45 1802 aa28.17■■■□□ 2.1
ARHGEF4-210ENST00000496764 FBLN1P23142 703 aa28.16■■■□□ 2.1
ARHGEF4-210ENST00000496764 PANK3Q9H999 370 aa28.16■■■□□ 2.1
ARHGEF4-210ENST00000496764 LTN1O94822 1766 aa28.15■■■□□ 2.1
ARHGEF4-210ENST00000496764 KIF20BQ96Q89 1820 aa28.15■■■□□ 2.1
ARHGEF4-210ENST00000496764 A0A0G2JS52 829 aa28.14■■■□□ 2.1
ARHGEF4-210ENST00000496764 MYT1Q01538 1121 aa28.14■■■□□ 2.1
ARHGEF4-210ENST00000496764 KRT27Q7Z3Y8 459 aa28.14■■■□□ 2.1
ARHGEF4-210ENST00000496764 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.1
ARHGEF4-210ENST00000496764 MAP3K19Q56UN5 1328 aa28.14■■■□□ 2.09
ARHGEF4-210ENST00000496764 RGPD5Q99666 1765 aa28.14■■■□□ 2.09
ARHGEF4-210ENST00000496764 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa28.13■■■□□ 2.09
ARHGEF4-210ENST00000496764 IP6K1Q92551 441 aa28.12■■■□□ 2.09
ARHGEF4-210ENST00000496764 CGNL1Q0VF96 1302 aa28.12■■■□□ 2.09
ARHGEF4-210ENST00000496764 ERBB3P21860 1342 aa28.11■■■□□ 2.09
ARHGEF4-210ENST00000496764 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
ARHGEF4-210ENST00000496764 CARD10Q9BWT7 1032 aa28.09■■■□□ 2.09
ARHGEF4-210ENST00000496764 EP400Q96L91 3159 aa28.09■■■□□ 2.09
ARHGEF4-210ENST00000496764 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa28.08■■■□□ 2.09
ARHGEF4-210ENST00000496764 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
ARHGEF4-210ENST00000496764 HOXC9P31274 260 aa28.07■■■□□ 2.08
ARHGEF4-210ENST00000496764 ANKRD24Q8TF21 1146 aa28.07■■■□□ 2.08
ARHGEF4-210ENST00000496764 CCDC7Q96M83 1385 aa28.06■■■□□ 2.08
ARHGEF4-210ENST00000496764 RTL1A6NKG5 1358 aa28.05■■■□□ 2.08
ARHGEF4-210ENST00000496764 WASHC2AQ641Q2 1341 aa28.05■■■□□ 2.08
ARHGEF4-210ENST00000496764 AMPHP49418 695 aa28.04■■■□□ 2.08
ARHGEF4-210ENST00000496764 FAM182BQ5T319 152 aa28.02■■■□□ 2.08
ARHGEF4-210ENST00000496764 DISP2A7MBM2 1401 aa28.01■■■□□ 2.08
ARHGEF4-210ENST00000496764 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.07
ARHGEF4-210ENST00000496764 NLRP2Q9NX02 1062 aa28.01■■■□□ 2.07
ARHGEF4-210ENST00000496764 CCDC125Q86Z20 511 aa28■■■□□ 2.07
ARHGEF4-210ENST00000496764 PEAK1Q9H792 1746 aa27.99■■■□□ 2.07
ARHGEF4-210ENST00000496764 NSD2O96028 1365 aa27.99■■■□□ 2.07
ARHGEF4-210ENST00000496764 KIF24Q5T7B8 1368 aa27.99■■■□□ 2.07
ARHGEF4-210ENST00000496764 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP27.98■■■□□ 2.07
ARHGEF4-210ENST00000496764 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP27.98■■■□□ 2.07
ARHGEF4-210ENST00000496764 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa27.98■■■□□ 2.07
ARHGEF4-210ENST00000496764 WNK3Q9BYP7 1800 aa27.97■■■□□ 2.07
ARHGEF4-210ENST00000496764 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP27.97■■■□□ 2.07
ARHGEF4-210ENST00000496764 KNSTRNQ9Y448 316 aa27.97■■■□□ 2.07
ARHGEF4-210ENST00000496764 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa27.97■■■□□ 2.07
ARHGEF4-210ENST00000496764 FLT4P35916 1363 aa27.97■■■□□ 2.07
ARHGEF4-210ENST00000496764 LRRC37A3O60309 1634 aa27.96■■■□□ 2.07
ARHGEF4-210ENST00000496764 PDE3BQ13370 1112 aa27.96■■■□□ 2.07
ARHGEF4-210ENST00000496764 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP27.96■■■□□ 2.07
ARHGEF4-210ENST00000496764 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa27.95■■■□□ 2.06
ARHGEF4-210ENST00000496764 INSRP06213 1382 aa27.95■■■□□ 2.06
ARHGEF4-210ENST00000496764 DDB1Q16531 1140 aa27.94■■■□□ 2.06
ARHGEF4-210ENST00000496764 FAM196AQ6ZSG2 479 aa27.93■■■□□ 2.06
ARHGEF4-210ENST00000496764 POLKQ9UBT6 870 aa27.93■■■□□ 2.06
ARHGEF4-210ENST00000496764 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
ARHGEF4-210ENST00000496764 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP27.91■■■□□ 2.06
ARHGEF4-210ENST00000496764 IL2RBP14784 551 aa27.89■■■□□ 2.06
ARHGEF4-210ENST00000496764 NBPF6Q5VWK0 638 aa27.89■■■□□ 2.06
ARHGEF4-210ENST00000496764 NBPF4Q96M43 638 aa27.89■■■□□ 2.06
ARHGEF4-210ENST00000496764 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP27.88■■■□□ 2.05
ARHGEF4-210ENST00000496764 MORC1Q86VD1 984 aa27.88■■■□□ 2.05
ARHGEF4-210ENST00000496764 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP27.88■■■□□ 2.05
ARHGEF4-210ENST00000496764 TNS2Q63HR2 1409 aa27.87■■■□□ 2.05
ARHGEF4-210ENST00000496764 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
ARHGEF4-210ENST00000496764 EXOC5O00471 708 aa27.86■■■□□ 2.05
ARHGEF4-210ENST00000496764 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa27.85■■■□□ 2.05
ARHGEF4-210ENST00000496764 RGPD2P0DJD1 1756 aa27.84■■■□□ 2.05
ARHGEF4-210ENST00000496764 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
ARHGEF4-210ENST00000496764 DEFB132Q7Z7B7 95 aa27.84■■■□□ 2.05
ARHGEF4-210ENST00000496764 TRIM37O94972 964 aa27.83■■■□□ 2.05
ARHGEF4-210ENST00000496764 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.05
ARHGEF4-210ENST00000496764 BCL9O00512 1426 aa27.83■■■□□ 2.05
ARHGEF4-210ENST00000496764 USHBP1Q8N6Y0 703 aa27.82■■■□□ 2.04
ARHGEF4-210ENST00000496764 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa27.82■■■□□ 2.04
ARHGEF4-210ENST00000496764 RGPD1P0DJD0 1748 aa27.81■■■□□ 2.04
ARHGEF4-210ENST00000496764 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
ARHGEF4-210ENST00000496764 MEGF6O75095 1541 aa27.8■■■□□ 2.04
ARHGEF4-210ENST00000496764 NCAPD2Q15021 1401 aa27.79■■■□□ 2.04
ARHGEF4-210ENST00000496764 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP27.79■■■□□ 2.04
ARHGEF4-210ENST00000496764 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP27.77■■■□□ 2.04
ARHGEF4-210ENST00000496764 BAG6P46379 1132 aa27.76■■■□□ 2.03
ARHGEF4-210ENST00000496764 EYA1Q99502 592 aa27.75■■■□□ 2.03
ARHGEF4-210ENST00000496764 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP27.73■■■□□ 2.03
ARHGEF4-210ENST00000496764 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP27.73■■■□□ 2.03
ARHGEF4-210ENST00000496764 PTF1AQ7RTS3 328 aa27.73■■■□□ 2.03
ARHGEF4-210ENST00000496764 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa27.72■■■□□ 2.03
ARHGEF4-210ENST00000496764 APBA3O96018 575 aa27.71■■■□□ 2.03
ARHGEF4-210ENST00000496764 SBF2Q86WG5 1849 aa27.71■■■□□ 2.03
ARHGEF4-210ENST00000496764 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP27.7■■■□□ 2.02
ARHGEF4-210ENST00000496764 CAMKK2Q96RR4 588 aa27.7■■■□□ 2.02
ARHGEF4-210ENST00000496764 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP27.7■■■□□ 2.02
ARHGEF4-210ENST00000496764 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP27.69■■■□□ 2.02
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