RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495904.1

VSTM2A-207, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 2A, humanhuman

TSL 3

Gene VSTM2A, Length 865 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM2A-207ENST00000495904 NSD2O96028 1365 aa29.37■■■□□ 2.29
VSTM2A-207ENST00000495904 NRAPQ86VF7 1730 aa29.36■■■□□ 2.29
VSTM2A-207ENST00000495904 ZBTB7CA1YPR0 619 aa29.35■■■□□ 2.29
VSTM2A-207ENST00000495904 KRT27Q7Z3Y8 459 aa29.34■■■□□ 2.29
VSTM2A-207ENST00000495904 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP29.34■■■□□ 2.29
VSTM2A-207ENST00000495904 ABCC6O95255 1503 aa29.33■■■□□ 2.29
VSTM2A-207ENST00000495904 KIF20BQ96Q89 1820 aa29.32■■■□□ 2.28
VSTM2A-207ENST00000495904 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa29.31■■■□□ 2.28
VSTM2A-207ENST00000495904 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa29.31■■■□□ 2.28
VSTM2A-207ENST00000495904 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
VSTM2A-207ENST00000495904 EVA1CP58658 441 aa29.3■■■□□ 2.28
VSTM2A-207ENST00000495904 LMO7Q8WWI1 1683 aa29.29■■■□□ 2.28
VSTM2A-207ENST00000495904 A0A0G2JS52 829 aa29.29■■■□□ 2.28
VSTM2A-207ENST00000495904 MYT1Q01538 1121 aa29.29■■■□□ 2.28
VSTM2A-207ENST00000495904 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP29.28■■■□□ 2.28
VSTM2A-207ENST00000495904 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa29.27■■■□□ 2.28
VSTM2A-207ENST00000495904 STRN4Q9NRL3 753 aa29.26■■■□□ 2.27
VSTM2A-207ENST00000495904 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP29.24■■■□□ 2.27
VSTM2A-207ENST00000495904 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP29.24■■■□□ 2.27
VSTM2A-207ENST00000495904 RTL1A6NKG5 1358 aa29.24■■■□□ 2.27
VSTM2A-207ENST00000495904 MAP3K19Q56UN5 1328 aa29.23■■■□□ 2.27
VSTM2A-207ENST00000495904 KIF24Q5T7B8 1368 aa29.23■■■□□ 2.27
VSTM2A-207ENST00000495904 AMPHP49418 695 aa29.22■■■□□ 2.27
VSTM2A-207ENST00000495904 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP29.22■■■□□ 2.27
VSTM2A-207ENST00000495904 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa29.22■■■□□ 2.27
VSTM2A-207ENST00000495904 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa29.21■■■□□ 2.27
VSTM2A-207ENST00000495904 IP6K1Q92551 441 aa29.21■■■□□ 2.27
VSTM2A-207ENST00000495904 AXIN2Q9Y2T1 843 aa29.21■■■□□ 2.27
VSTM2A-207ENST00000495904 COL18A1P39060 1754 aa29.21■■■□□ 2.27
VSTM2A-207ENST00000495904 MORC1Q86VD1 984 aa29.2■■■□□ 2.26
VSTM2A-207ENST00000495904 WDR17Q8IZU2 1322 aa29.2■■■□□ 2.26
VSTM2A-207ENST00000495904 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa29.18■■■□□ 2.26
VSTM2A-207ENST00000495904 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa29.18■■■□□ 2.26
VSTM2A-207ENST00000495904 DEFB132Q7Z7B7 95 aa29.18■■■□□ 2.26
VSTM2A-207ENST00000495904 CRB1P82279 1406 aa29.18■■■□□ 2.26
VSTM2A-207ENST00000495904 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
VSTM2A-207ENST00000495904 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
VSTM2A-207ENST00000495904 LTN1O94822 1766 aa29.16■■■□□ 2.26
VSTM2A-207ENST00000495904 HOXC9P31274 260 aa29.16■■■□□ 2.26
VSTM2A-207ENST00000495904 ERBB3P21860 1342 aa29.16■■■□□ 2.26
VSTM2A-207ENST00000495904 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa29.15■■■□□ 2.26
VSTM2A-207ENST00000495904 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
VSTM2A-207ENST00000495904 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa29.15■■■□□ 2.26
VSTM2A-207ENST00000495904 FLT4P35916 1363 aa29.14■■■□□ 2.26
VSTM2A-207ENST00000495904 FBLN1P23142 703 aa29.14■■■□□ 2.26
VSTM2A-207ENST00000495904 BAG6P46379 1132 aa29.13■■■□□ 2.25
VSTM2A-207ENST00000495904 TCP11L2Q8N4U5 519 aa29.13■■■□□ 2.25
VSTM2A-207ENST00000495904 BARGINQ6ZT62 677 aa29.12■■■□□ 2.25
VSTM2A-207ENST00000495904 ANKRD24Q8TF21 1146 aa29.12■■■□□ 2.25
VSTM2A-207ENST00000495904 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP29.11■■■□□ 2.25
VSTM2A-207ENST00000495904 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
VSTM2A-207ENST00000495904 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
VSTM2A-207ENST00000495904 CARD10Q9BWT7 1032 aa29.1■■■□□ 2.25
VSTM2A-207ENST00000495904 USP35Q9P2H5 1018 aa29.1■■■□□ 2.25
VSTM2A-207ENST00000495904 INSRP06213 1382 aa29.1■■■□□ 2.25
VSTM2A-207ENST00000495904 POLKQ9UBT6 870 aa29.09■■■□□ 2.25
VSTM2A-207ENST00000495904 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa29.09■■■□□ 2.25
VSTM2A-207ENST00000495904 FAM182BQ5T319 152 aa29.08■■■□□ 2.25
VSTM2A-207ENST00000495904 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
VSTM2A-207ENST00000495904 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa29.06■■■□□ 2.24
VSTM2A-207ENST00000495904 FAM196AQ6ZSG2 479 aa29.06■■■□□ 2.24
VSTM2A-207ENST00000495904 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP29.06■■■□□ 2.24
VSTM2A-207ENST00000495904 NLRP2Q9NX02 1062 aa29.06■■■□□ 2.24
VSTM2A-207ENST00000495904 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
VSTM2A-207ENST00000495904 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
VSTM2A-207ENST00000495904 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
VSTM2A-207ENST00000495904 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa29.04■■■□□ 2.24
VSTM2A-207ENST00000495904 RGPD1P0DJD0 1748 aa29.03■■■□□ 2.24
VSTM2A-207ENST00000495904 PDE3BQ13370 1112 aa29.02■■■□□ 2.24
VSTM2A-207ENST00000495904 RGPD5Q99666 1765 aa29.02■■■□□ 2.24
VSTM2A-207ENST00000495904 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
VSTM2A-207ENST00000495904 PEAK1Q9H792 1746 aa29■■■□□ 2.23
VSTM2A-207ENST00000495904 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
VSTM2A-207ENST00000495904 DISP2A7MBM2 1401 aa28.99■■■□□ 2.23
VSTM2A-207ENST00000495904 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
VSTM2A-207ENST00000495904 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
VSTM2A-207ENST00000495904 TRIM37O94972 964 aa28.95■■■□□ 2.22
VSTM2A-207ENST00000495904 IL2RBP14784 551 aa28.93■■■□□ 2.22
VSTM2A-207ENST00000495904 MTHFSP49914 203 aa28.93■■■□□ 2.22
VSTM2A-207ENST00000495904 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
VSTM2A-207ENST00000495904 DDB1Q16531 1140 aa28.91■■■□□ 2.22
VSTM2A-207ENST00000495904 NBPF6Q5VWK0 638 aa28.91■■■□□ 2.22
VSTM2A-207ENST00000495904 NBPF4Q96M43 638 aa28.91■■■□□ 2.22
VSTM2A-207ENST00000495904 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
VSTM2A-207ENST00000495904 CAMKK2Q96RR4 588 aa28.9■■■□□ 2.22
VSTM2A-207ENST00000495904 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
VSTM2A-207ENST00000495904 APBA3O96018 575 aa28.89■■■□□ 2.22
VSTM2A-207ENST00000495904 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
VSTM2A-207ENST00000495904 PARD3Q8TEW0 1356 aa28.88■■■□□ 2.21
VSTM2A-207ENST00000495904 EXOC5O00471 708 aa28.87■■■□□ 2.21
VSTM2A-207ENST00000495904 RALBP1Q15311 655 aa28.87■■■□□ 2.21
VSTM2A-207ENST00000495904 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa28.86■■■□□ 2.21
VSTM2A-207ENST00000495904 CFAP53Q96M91 514 aa28.86■■■□□ 2.21
VSTM2A-207ENST00000495904 WNK3Q9BYP7 1800 aa28.85■■■□□ 2.21
VSTM2A-207ENST00000495904 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP28.85■■■□□ 2.21
VSTM2A-207ENST00000495904 PPP2R1AP30153 589 aa28.85■■■□□ 2.21
VSTM2A-207ENST00000495904 EYA1Q99502 592 aa28.85■■■□□ 2.21
VSTM2A-207ENST00000495904 NCAPD2Q15021 1401 aa28.85■■■□□ 2.21
VSTM2A-207ENST00000495904 TNS2Q63HR2 1409 aa28.84■■■□□ 2.21
VSTM2A-207ENST00000495904 LRRC37A3O60309 1634 aa28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 137.9 ms