RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492897.3

HOXB-AS3-214, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3

Gene HOXB-AS3, Length 309 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-214ENST00000492897 PARD3Q8TEW0 1356 aa21.15■□□□□ 0.98
HOXB-AS3-214ENST00000492897 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa21.15■□□□□ 0.98
HOXB-AS3-214ENST00000492897 ZBTB7CA1YPR0 619 aa21.15■□□□□ 0.98
HOXB-AS3-214ENST00000492897 NME9Q86XW9 330 aa21.15■□□□□ 0.98
HOXB-AS3-214ENST00000492897 CARD10Q9BWT7 1032 aa21.15■□□□□ 0.98
HOXB-AS3-214ENST00000492897 USP54Q70EL1 1684 aa21.15■□□□□ 0.98
HOXB-AS3-214ENST00000492897 ABCC6O95255 1503 aa21.14■□□□□ 0.98
HOXB-AS3-214ENST00000492897 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-214ENST00000492897 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa21.14■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-214ENST00000492897 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP21.14■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-214ENST00000492897 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-214ENST00000492897 A0A1W2PP64 1363 aa21.13■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-214ENST00000492897 APBA3O96018 575 aa21.13■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-214ENST00000492897 TMC1Q8TDI8 760 aa21.13■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-214ENST00000492897 SLC24A1O60721 1099 aa21.12■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-214ENST00000492897 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-214ENST00000492897 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-214ENST00000492897 TERF2IPQ9NYB0 399 aa21.12■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-214ENST00000492897 PEAK1Q9H792 1746 aa21.12■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-214ENST00000492897 BCL9O00512 1426 aa21.12■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-214ENST00000492897 NINLQ9Y2I6 1382 aa21.11■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-214ENST00000492897 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-214ENST00000492897 SOX12O15370 315 aa21.11■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-214ENST00000492897 DDB1Q16531 1140 aa21.1■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-214ENST00000492897 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-214ENST00000492897 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-214ENST00000492897 OVOS2Q6IE36 1432 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-214ENST00000492897 LRRC37A3O60309 1634 aa21.08■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-214ENST00000492897 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-214ENST00000492897 LRP5O75197 1615 aa21.07■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-214ENST00000492897 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-214ENST00000492897 ERBB3P21860 1342 aa21.06■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-214ENST00000492897 CCDC7Q96M83 1385 aa21.06■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-214ENST00000492897 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa21.05■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-214ENST00000492897 PLSCR1O15162 318 aa21.04■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-214ENST00000492897 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa21.04■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-214ENST00000492897 PTF1AQ7RTS3 328 aa21.04■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-214ENST00000492897 USP47Q96K76 1375 aa21.03■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-214ENST00000492897 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP21.03■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-214ENST00000492897 RGPD5Q99666 1765 aa21.02■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-214ENST00000492897 RREB1Q92766 1687 aa21.02■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-214ENST00000492897 CLSPNQ9HAW4 1339 aa21.02■□□□□ 0.95
HOXB-AS3-214ENST00000492897 WNK3Q9BYP7 1800 aa21.01■□□□□ 0.95
HOXB-AS3-214ENST00000492897 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa21.01■□□□□ 0.95
HOXB-AS3-214ENST00000492897 EXOC5O00471 708 aa21.01■□□□□ 0.95
HOXB-AS3-214ENST00000492897 IP6K1Q92551 441 aa21■□□□□ 0.95
HOXB-AS3-214ENST00000492897 TMF1P82094 1093 aa20.99■□□□□ 0.95
HOXB-AS3-214ENST00000492897 PROM2Q8N271 834 aa20.99■□□□□ 0.95
HOXB-AS3-214ENST00000492897 ANKRD24Q8TF21 1146 aa20.99■□□□□ 0.95
HOXB-AS3-214ENST00000492897 TNS2Q63HR2 1409 aa20.98■□□□□ 0.95
HOXB-AS3-214ENST00000492897 NUP188Q5SRE5 1749 aa20.98■□□□□ 0.95
HOXB-AS3-214ENST00000492897 NLRP2Q9NX02 1062 aa20.97■□□□□ 0.95
HOXB-AS3-214ENST00000492897 SBF2Q86WG5 1849 aa20.97■□□□□ 0.95
HOXB-AS3-214ENST00000492897 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
HOXB-AS3-214ENST00000492897 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa20.96■□□□□ 0.95
HOXB-AS3-214ENST00000492897 FYB1O15117 783 aa20.96■□□□□ 0.95
HOXB-AS3-214ENST00000492897 NBPF14Q5TI25 921 aa20.96■□□□□ 0.95
HOXB-AS3-214ENST00000492897 IL2RBP14784 551 aa20.95■□□□□ 0.94
HOXB-AS3-214ENST00000492897 COG3Q96JB2 828 aa20.95■□□□□ 0.94
HOXB-AS3-214ENST00000492897 MAP3K19Q56UN5 1328 aa20.95■□□□□ 0.94
HOXB-AS3-214ENST00000492897 LTN1O94822 1766 aa20.94■□□□□ 0.94
HOXB-AS3-214ENST00000492897 FBLN1P23142 703 aa20.93■□□□□ 0.94
HOXB-AS3-214ENST00000492897 HOXC9P31274 260 aa20.92■□□□□ 0.94
HOXB-AS3-214ENST00000492897 CDCA8Q53HL2 280 aa20.92■□□□□ 0.94
HOXB-AS3-214ENST00000492897 KCNQ2O43526 872 aa20.91■□□□□ 0.94
HOXB-AS3-214ENST00000492897 CARD14Q9BXL6 1004 aa20.9■□□□□ 0.94
HOXB-AS3-214ENST00000492897 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
HOXB-AS3-214ENST00000492897 RTL1A6NKG5 1358 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXB-AS3-214ENST00000492897 GGNBP2Q9H3C7 697 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXB-AS3-214ENST00000492897 TXNRD1Q16881 649 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXB-AS3-214ENST00000492897 PCGF6Q9BYE7 350 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXB-AS3-214ENST00000492897 AMPHP49418 695 aa20.85■□□□□ 0.93
HOXB-AS3-214ENST00000492897 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
HOXB-AS3-214ENST00000492897 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
HOXB-AS3-214ENST00000492897 NHSQ6T4R5 1651 aa20.83■□□□□ 0.93
HOXB-AS3-214ENST00000492897 ACSBG1Q96GR2 724 aa20.83■□□□□ 0.93
HOXB-AS3-214ENST00000492897 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.92
HOXB-AS3-214ENST00000492897 NBPF6Q5VWK0 638 aa20.82■□□□□ 0.92
HOXB-AS3-214ENST00000492897 NBPF4Q96M43 638 aa20.82■□□□□ 0.92
HOXB-AS3-214ENST00000492897 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
HOXB-AS3-214ENST00000492897 SPON1Q9HCB6 807 aa20.82■□□□□ 0.92
HOXB-AS3-214ENST00000492897 KIF24Q5T7B8 1368 aa20.82■□□□□ 0.92
HOXB-AS3-214ENST00000492897 MYOM1P52179 1685 aa20.8■□□□□ 0.92
HOXB-AS3-214ENST00000492897 SLC15A2Q16348 729 aa20.8■□□□□ 0.92
HOXB-AS3-214ENST00000492897 INSRP06213 1382 aa20.8■□□□□ 0.92
HOXB-AS3-214ENST00000492897 NSD3Q9BZ95 1437 aa20.79■□□□□ 0.92
HOXB-AS3-214ENST00000492897 MEGF6O75095 1541 aa20.79■□□□□ 0.92
HOXB-AS3-214ENST00000492897 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa20.79■□□□□ 0.92
HOXB-AS3-214ENST00000492897 CASZ1Q86V15 1759 aa20.79■□□□□ 0.92
HOXB-AS3-214ENST00000492897 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
HOXB-AS3-214ENST00000492897 FLT4P35916 1363 aa20.77■□□□□ 0.92
HOXB-AS3-214ENST00000492897 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
HOXB-AS3-214ENST00000492897 CGNL1Q0VF96 1302 aa20.77■□□□□ 0.91
HOXB-AS3-214ENST00000492897 LRRC4BQ9NT99 713 aa20.76■□□□□ 0.91
HOXB-AS3-214ENST00000492897 STK32BQ9NY57 414 aa20.76■□□□□ 0.91
HOXB-AS3-214ENST00000492897 PAPPAQ13219 1627 aa20.75■□□□□ 0.91
HOXB-AS3-214ENST00000492897 NSD2O96028 1365 aa20.75■□□□□ 0.91
HOXB-AS3-214ENST00000492897 PTGER2P43116 358 aa20.75■□□□□ 0.91
HOXB-AS3-214ENST00000492897 NCAPD2Q15021 1401 aa20.73■□□□□ 0.91
HOXB-AS3-214ENST00000492897 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.6 ms