RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492539.5

NELFE-212, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 583 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-212ENST00000492539 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa28.52■■■□□ 2.16
NELFE-212ENST00000492539 MON2Q7Z3U7 1717 aa28.51■■■□□ 2.15
NELFE-212ENST00000492539 NEUROD1Q13562 356 aa28.5■■■□□ 2.15
NELFE-212ENST00000492539 AXIN2Q9Y2T1 843 aa28.5■■■□□ 2.15
NELFE-212ENST00000492539 WDR17Q8IZU2 1322 aa28.49■■■□□ 2.15
NELFE-212ENST00000492539 TTC21AQ8NDW8 1320 aa28.49■■■□□ 2.15
NELFE-212ENST00000492539 ARHGEF25Q86VW2 580 aa28.49■■■□□ 2.15
NELFE-212ENST00000492539 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa28.48■■■□□ 2.15
NELFE-212ENST00000492539 KCNH5Q8NCM2 988 aa28.48■■■□□ 2.15
NELFE-212ENST00000492539 NFAT5O94916 1531 aa28.48■■■□□ 2.15
NELFE-212ENST00000492539 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa28.47■■■□□ 2.15
NELFE-212ENST00000492539 DDB1Q16531 1140 aa28.46■■■□□ 2.15
NELFE-212ENST00000492539 USP54Q70EL1 1684 aa28.45■■■□□ 2.15
NELFE-212ENST00000492539 NBPF14Q5TI25 921 aa28.45■■■□□ 2.14
NELFE-212ENST00000492539 ABCC6O95255 1503 aa28.44■■■□□ 2.14
NELFE-212ENST00000492539 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
NELFE-212ENST00000492539 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP28.42■■■□□ 2.14
NELFE-212ENST00000492539 BCL9O00512 1426 aa28.42■■■□□ 2.14
NELFE-212ENST00000492539 PLSCR1O15162 318 aa28.4■■■□□ 2.14
NELFE-212ENST00000492539 CD163L1Q9NR16 1453 aa28.4■■■□□ 2.14
NELFE-212ENST00000492539 CARD10Q9BWT7 1032 aa28.39■■■□□ 2.14
NELFE-212ENST00000492539 USP31Q70CQ4 1352 aa28.38■■■□□ 2.13
NELFE-212ENST00000492539 SOX12O15370 315 aa28.38■■■□□ 2.13
NELFE-212ENST00000492539 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
NELFE-212ENST00000492539 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
NELFE-212ENST00000492539 LTN1O94822 1766 aa28.35■■■□□ 2.13
NELFE-212ENST00000492539 PTF1AQ7RTS3 328 aa28.35■■■□□ 2.13
NELFE-212ENST00000492539 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa28.34■■■□□ 2.13
NELFE-212ENST00000492539 CCDC7Q96M83 1385 aa28.34■■■□□ 2.13
NELFE-212ENST00000492539 CARD11Q9BXL7 1154 aa28.33■■■□□ 2.13
NELFE-212ENST00000492539 CASZ1Q86V15 1759 aa28.32■■■□□ 2.12
NELFE-212ENST00000492539 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
NELFE-212ENST00000492539 TNS2Q63HR2 1409 aa28.31■■■□□ 2.12
NELFE-212ENST00000492539 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP28.3■■■□□ 2.12
NELFE-212ENST00000492539 SPON1Q9HCB6 807 aa28.29■■■□□ 2.12
NELFE-212ENST00000492539 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
NELFE-212ENST00000492539 EXOC5O00471 708 aa28.28■■■□□ 2.12
NELFE-212ENST00000492539 KCNQ2O43526 872 aa28.28■■■□□ 2.12
NELFE-212ENST00000492539 NME9Q86XW9 330 aa28.28■■■□□ 2.12
NELFE-212ENST00000492539 PROM2Q8N271 834 aa28.28■■■□□ 2.12
NELFE-212ENST00000492539 ERBB3P21860 1342 aa28.27■■■□□ 2.12
NELFE-212ENST00000492539 NHSQ6T4R5 1651 aa28.27■■■□□ 2.12
NELFE-212ENST00000492539 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.12
NELFE-212ENST00000492539 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
NELFE-212ENST00000492539 TMC1Q8TDI8 760 aa28.24■■■□□ 2.11
NELFE-212ENST00000492539 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
NELFE-212ENST00000492539 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa28.24■■■□□ 2.11
NELFE-212ENST00000492539 A0A1W2PP64 1363 aa28.24■■■□□ 2.11
NELFE-212ENST00000492539 TONSLQ96HA7 1378 aa28.24■■■□□ 2.11
NELFE-212ENST00000492539 NINLQ9Y2I6 1382 aa28.21■■■□□ 2.11
NELFE-212ENST00000492539 TXNRD1Q16881 649 aa28.2■■■□□ 2.1
NELFE-212ENST00000492539 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.1
NELFE-212ENST00000492539 TERF2IPQ9NYB0 399 aa28.19■■■□□ 2.1
NELFE-212ENST00000492539 NLRP2Q9NX02 1062 aa28.18■■■□□ 2.1
NELFE-212ENST00000492539 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
NELFE-212ENST00000492539 IL2RBP14784 551 aa28.17■■■□□ 2.1
NELFE-212ENST00000492539 ANKRD24Q8TF21 1146 aa28.17■■■□□ 2.1
NELFE-212ENST00000492539 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP28.16■■■□□ 2.1
NELFE-212ENST00000492539 BTAF1O14981 1849 aa28.15■■■□□ 2.1
NELFE-212ENST00000492539 PAPPAQ13219 1627 aa28.14■■■□□ 2.1
NELFE-212ENST00000492539 TESK2Q96S53 571 aa28.14■■■□□ 2.1
NELFE-212ENST00000492539 MYOM1P52179 1685 aa28.13■■■□□ 2.09
NELFE-212ENST00000492539 STK32BQ9NY57 414 aa28.13■■■□□ 2.09
NELFE-212ENST00000492539 SLC15A2Q16348 729 aa28.12■■■□□ 2.09
NELFE-212ENST00000492539 ACSBG1Q96GR2 724 aa28.11■■■□□ 2.09
NELFE-212ENST00000492539 IP6K1Q92551 441 aa28.1■■■□□ 2.09
NELFE-212ENST00000492539 KAT6BQ8WYB5 2073 aa28.1■■■□□ 2.09
NELFE-212ENST00000492539 ZBTB7AO95365 584 aa28.09■■■□□ 2.09
NELFE-212ENST00000492539 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa28.08■■■□□ 2.09
NELFE-212ENST00000492539 PTGER2P43116 358 aa28.08■■■□□ 2.09
NELFE-212ENST00000492539 SLC24A1O60721 1099 aa28.05■■■□□ 2.08
NELFE-212ENST00000492539 YY1P25490 414 aa28.05■■■□□ 2.08
NELFE-212ENST00000492539 RGPD2P0DJD1 1756 aa28.04■■■□□ 2.08
NELFE-212ENST00000492539 COG3Q96JB2 828 aa28.03■■■□□ 2.08
NELFE-212ENST00000492539 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP28.03■■■□□ 2.08
NELFE-212ENST00000492539 SHANK3Q9BYB0 1731 aa28.03■■■□□ 2.08
NELFE-212ENST00000492539 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa28.02■■■□□ 2.08
NELFE-212ENST00000492539 MAP3K19Q56UN5 1328 aa28.02■■■□□ 2.08
NELFE-212ENST00000492539 DCAF8L1A6NGE4 600 aa28.02■■■□□ 2.08
NELFE-212ENST00000492539 MTFR1LQ9H019 292 aa28.01■■■□□ 2.07
NELFE-212ENST00000492539 HOXC9P31274 260 aa28■■■□□ 2.07
NELFE-212ENST00000492539 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
NELFE-212ENST00000492539 SGIP1Q9BQI5 828 aa28■■■□□ 2.07
NELFE-212ENST00000492539 QSER1Q2KHR3 1735 aa28■■■□□ 2.07
NELFE-212ENST00000492539 DOT1LQ8TEK3 1739 aa27.99■■■□□ 2.07
NELFE-212ENST00000492539 LRRC4BQ9NT99 713 aa27.97■■■□□ 2.07
NELFE-212ENST00000492539 RTL1A6NKG5 1358 aa27.97■■■□□ 2.07
NELFE-212ENST00000492539 FBLN1P23142 703 aa27.96■■■□□ 2.07
NELFE-212ENST00000492539 ZNF827Q17R98 1081 aa27.96■■■□□ 2.07
NELFE-212ENST00000492539 AMPHP49418 695 aa27.95■■■□□ 2.06
NELFE-212ENST00000492539 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP27.95■■■□□ 2.06
NELFE-212ENST00000492539 LY75O60449 1722 aa27.95■■■□□ 2.06
NELFE-212ENST00000492539 MEGF6O75095 1541 aa27.94■■■□□ 2.06
NELFE-212ENST00000492539 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP27.94■■■□□ 2.06
NELFE-212ENST00000492539 UTRNP46939 3433 aa27.93■■■□□ 2.06
NELFE-212ENST00000492539 KIF20BQ96Q89 1820 aa27.93■■■□□ 2.06
NELFE-212ENST00000492539 SYT17Q9BSW7 474 aa27.93■■■□□ 2.06
NELFE-212ENST00000492539 COL24A1Q17RW2 1714 aa27.92■■■□□ 2.06
NELFE-212ENST00000492539 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa27.92■■■□□ 2.06
NELFE-212ENST00000492539 USP47Q96K76 1375 aa27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45 ms