RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489731.1

NOTCH2-204, Transcript of notch 2, humanhuman

TSL 5

Gene NOTCH2, Length 414 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH2-204ENST00000489731 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
NOTCH2-204ENST00000489731 NFAT5O94916 1531 aa16.02■□□□□ 0.15
NOTCH2-204ENST00000489731 NGEFQ8N5V2 710 aa16.01■□□□□ 0.15
NOTCH2-204ENST00000489731 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
NOTCH2-204ENST00000489731 CCDC184Q52MB2 194 aa16■□□□□ 0.15
NOTCH2-204ENST00000489731 CABLES1Q8TDN4 633 aa16■□□□□ 0.15
NOTCH2-204ENST00000489731 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa15.99■□□□□ 0.15
NOTCH2-204ENST00000489731 FCHSD2O94868 740 aa15.99■□□□□ 0.15
NOTCH2-204ENST00000489731 FBLN1P23142 703 aa15.99■□□□□ 0.15
NOTCH2-204ENST00000489731 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa15.99■□□□□ 0.15
NOTCH2-204ENST00000489731 KIAA0232Q92628 1395 aa15.99■□□□□ 0.15
NOTCH2-204ENST00000489731 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
NOTCH2-204ENST00000489731 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
NOTCH2-204ENST00000489731 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa15.98■□□□□ 0.15
NOTCH2-204ENST00000489731 IL13P35225 146 aa15.98■□□□□ 0.15
NOTCH2-204ENST00000489731 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
NOTCH2-204ENST00000489731 ADAMTS8Q9UP79 889 aa15.97■□□□□ 0.15
NOTCH2-204ENST00000489731 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
NOTCH2-204ENST00000489731 EVA1CP58658 441 aa15.96■□□□□ 0.15
NOTCH2-204ENST00000489731 RUNDC1Q96C34 613 aa15.96■□□□□ 0.15
NOTCH2-204ENST00000489731 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.14
NOTCH2-204ENST00000489731 ANKRD24Q8TF21 1146 aa15.95■□□□□ 0.14
NOTCH2-204ENST00000489731 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
NOTCH2-204ENST00000489731 LTN1O94822 1766 aa15.95■□□□□ 0.14
NOTCH2-204ENST00000489731 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP15.94■□□□□ 0.14
NOTCH2-204ENST00000489731 SHPRHQ149N8 1683 aa15.94■□□□□ 0.14
NOTCH2-204ENST00000489731 ERBB3P21860 1342 aa15.94■□□□□ 0.14
NOTCH2-204ENST00000489731 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
NOTCH2-204ENST00000489731 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
NOTCH2-204ENST00000489731 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
NOTCH2-204ENST00000489731 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
NOTCH2-204ENST00000489731 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
NOTCH2-204ENST00000489731 CHRNA2Q15822 529 aa15.92■□□□□ 0.14
NOTCH2-204ENST00000489731 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
NOTCH2-204ENST00000489731 SULT6B1Q6IMI4 303 aa15.92■□□□□ 0.14
NOTCH2-204ENST00000489731 IGSF1Q8N6C5 1336 aa15.92■□□□□ 0.14
NOTCH2-204ENST00000489731 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa15.91■□□□□ 0.14
NOTCH2-204ENST00000489731 ADAMTS2O95450 1211 aa15.91■□□□□ 0.14
NOTCH2-204ENST00000489731 NLRP2Q9NX02 1062 aa15.91■□□□□ 0.14
NOTCH2-204ENST00000489731 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa15.9■□□□□ 0.14
NOTCH2-204ENST00000489731 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
NOTCH2-204ENST00000489731 LMOD3Q0VAK6 560 aa15.9■□□□□ 0.14
NOTCH2-204ENST00000489731 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa15.9■□□□□ 0.14
NOTCH2-204ENST00000489731 EYA1Q99502 592 aa15.9■□□□□ 0.14
NOTCH2-204ENST00000489731 PEAK1Q9H792 1746 aa15.9■□□□□ 0.14
NOTCH2-204ENST00000489731 WDR17Q8IZU2 1322 aa15.9■□□□□ 0.14
NOTCH2-204ENST00000489731 ABCA3Q99758 1704 aa15.89■□□□□ 0.13
NOTCH2-204ENST00000489731 FAM83GA6ND36 823 aa15.89■□□□□ 0.13
NOTCH2-204ENST00000489731 HMOX1P09601 288 aa15.89■□□□□ 0.13
NOTCH2-204ENST00000489731 PRKAR2BP31323 418 aa15.89■□□□□ 0.13
NOTCH2-204ENST00000489731 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa15.89■□□□□ 0.13
NOTCH2-204ENST00000489731 BTG4Q9NY30 223 aa15.89■□□□□ 0.13
NOTCH2-204ENST00000489731 AXIN2Q9Y2T1 843 aa15.89■□□□□ 0.13
NOTCH2-204ENST00000489731 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
NOTCH2-204ENST00000489731 AMOTQ4VCS5 1084 aa15.88■□□□□ 0.13
NOTCH2-204ENST00000489731 GAS2L2Q8NHY3 880 aa15.88■□□□□ 0.13
NOTCH2-204ENST00000489731 NGLY1Q96IV0 654 aa15.88■□□□□ 0.13
NOTCH2-204ENST00000489731 RSPH6AQ9H0K4 717 aa15.88■□□□□ 0.13
NOTCH2-204ENST00000489731 KDRP35968 1356 aa15.87■□□□□ 0.13
NOTCH2-204ENST00000489731 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
NOTCH2-204ENST00000489731 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
NOTCH2-204ENST00000489731 CCDC146Q8IYE0 955 aa15.87■□□□□ 0.13
NOTCH2-204ENST00000489731 STRN4Q9NRL3 753 aa15.87■□□□□ 0.13
NOTCH2-204ENST00000489731 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
NOTCH2-204ENST00000489731 ZBED9Q6R2W3 1325 aa15.87■□□□□ 0.13
NOTCH2-204ENST00000489731 TATP17735 454 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
NOTCH2-204ENST00000489731 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
NOTCH2-204ENST00000489731 CARD10Q9BWT7 1032 aa15.86■□□□□ 0.13
NOTCH2-204ENST00000489731 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
NOTCH2-204ENST00000489731 APAF1O14727 1248 aa15.85■□□□□ 0.13
NOTCH2-204ENST00000489731 PDE3BQ13370 1112 aa15.85■□□□□ 0.13
NOTCH2-204ENST00000489731 NBPF6Q5VWK0 638 aa15.85■□□□□ 0.13
NOTCH2-204ENST00000489731 TCP11L2Q8N4U5 519 aa15.85■□□□□ 0.13
NOTCH2-204ENST00000489731 NBPF4Q96M43 638 aa15.85■□□□□ 0.13
NOTCH2-204ENST00000489731 C8orf37Q96NL8 207 aa15.85■□□□□ 0.13
NOTCH2-204ENST00000489731 PLEKHF1Q96S99 279 aa15.85■□□□□ 0.13
NOTCH2-204ENST00000489731 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
NOTCH2-204ENST00000489731 CCDC27Q2M243 656 aa15.84■□□□□ 0.13
NOTCH2-204ENST00000489731 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
NOTCH2-204ENST00000489731 CRB1P82279 1406 aa15.84■□□□□ 0.13
NOTCH2-204ENST00000489731 NFE2L2Q16236 605 aa15.83■□□□□ 0.12
NOTCH2-204ENST00000489731 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
NOTCH2-204ENST00000489731 SPG7Q9UQ90 795 aa15.83■□□□□ 0.12
NOTCH2-204ENST00000489731 LMO7Q8WWI1 1683 aa15.83■□□□□ 0.12
NOTCH2-204ENST00000489731 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa15.83■□□□□ 0.12
NOTCH2-204ENST00000489731 COL18A1P39060 1754 aa15.82■□□□□ 0.12
NOTCH2-204ENST00000489731 RIPK4P57078 832 aa15.82■□□□□ 0.12
NOTCH2-204ENST00000489731 UNC5CLQ8IV45 518 aa15.82■□□□□ 0.12
NOTCH2-204ENST00000489731 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP15.82■□□□□ 0.12
NOTCH2-204ENST00000489731 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP15.81■□□□□ 0.12
NOTCH2-204ENST00000489731 RGPD1P0DJD0 1748 aa15.81■□□□□ 0.12
NOTCH2-204ENST00000489731 TMPOP42166 694 aaKnown RBP15.81■□□□□ 0.12
NOTCH2-204ENST00000489731 NCAPD2Q15021 1401 aa15.81■□□□□ 0.12
NOTCH2-204ENST00000489731 C1orf141Q5JVX7 400 aa15.81■□□□□ 0.12
NOTCH2-204ENST00000489731 AEBP1Q8IUX7 1158 aa15.81■□□□□ 0.12
NOTCH2-204ENST00000489731 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP15.81■□□□□ 0.12
NOTCH2-204ENST00000489731 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP15.81■□□□□ 0.12
NOTCH2-204ENST00000489731 IL2RBP14784 551 aa15.8■□□□□ 0.12
NOTCH2-204ENST00000489731 NEUROD2Q15784 382 aa15.8■□□□□ 0.12
NOTCH2-204ENST00000489731 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.3 ms