RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486662.1

IWS1-209, Transcript of IWS1, SUPT6H interacting protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene IWS1, Length 870 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IWS1-209ENST00000486662 VPS72Q15906 364 aa29.1■■■□□ 2.25
IWS1-209ENST00000486662 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
IWS1-209ENST00000486662 EVA1CP58658 441 aa29.07■■■□□ 2.24
IWS1-209ENST00000486662 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP29.06■■■□□ 2.24
IWS1-209ENST00000486662 STRN4Q9NRL3 753 aa29.05■■■□□ 2.24
IWS1-209ENST00000486662 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
IWS1-209ENST00000486662 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
IWS1-209ENST00000486662 MAP3K19Q56UN5 1328 aa29.03■■■□□ 2.24
IWS1-209ENST00000486662 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
IWS1-209ENST00000486662 AXIN2Q9Y2T1 843 aa29.03■■■□□ 2.24
IWS1-209ENST00000486662 RGPD5Q99666 1765 aa29.03■■■□□ 2.24
IWS1-209ENST00000486662 FBLN1P23142 703 aa29.02■■■□□ 2.24
IWS1-209ENST00000486662 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.23
IWS1-209ENST00000486662 GLI3P10071 1580 aa29.01■■■□□ 2.23
IWS1-209ENST00000486662 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
IWS1-209ENST00000486662 IP6K1Q92551 441 aa29■■■□□ 2.23
IWS1-209ENST00000486662 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa28.99■■■□□ 2.23
IWS1-209ENST00000486662 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa28.99■■■□□ 2.23
IWS1-209ENST00000486662 AMPHP49418 695 aa28.99■■■□□ 2.23
IWS1-209ENST00000486662 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
IWS1-209ENST00000486662 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
IWS1-209ENST00000486662 MORC1Q86VD1 984 aa28.99■■■□□ 2.23
IWS1-209ENST00000486662 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
IWS1-209ENST00000486662 RTL1A6NKG5 1358 aa28.99■■■□□ 2.23
IWS1-209ENST00000486662 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
IWS1-209ENST00000486662 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa28.98■■■□□ 2.23
IWS1-209ENST00000486662 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
IWS1-209ENST00000486662 KIF24Q5T7B8 1368 aa28.97■■■□□ 2.23
IWS1-209ENST00000486662 WDR17Q8IZU2 1322 aa28.96■■■□□ 2.23
IWS1-209ENST00000486662 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa28.95■■■□□ 2.23
IWS1-209ENST00000486662 CRB1P82279 1406 aa28.95■■■□□ 2.23
IWS1-209ENST00000486662 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.23
IWS1-209ENST00000486662 HOXC9P31274 260 aa28.95■■■□□ 2.22
IWS1-209ENST00000486662 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa28.94■■■□□ 2.22
IWS1-209ENST00000486662 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
IWS1-209ENST00000486662 RGS12O14924 1447 aa28.93■■■□□ 2.22
IWS1-209ENST00000486662 ERBB3P21860 1342 aa28.93■■■□□ 2.22
IWS1-209ENST00000486662 FLT4P35916 1363 aa28.92■■■□□ 2.22
IWS1-209ENST00000486662 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa28.92■■■□□ 2.22
IWS1-209ENST00000486662 ANKRD24Q8TF21 1146 aa28.92■■■□□ 2.22
IWS1-209ENST00000486662 PEAK1Q9H792 1746 aa28.91■■■□□ 2.22
IWS1-209ENST00000486662 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa28.91■■■□□ 2.22
IWS1-209ENST00000486662 ANP32CO43423 234 aa28.9■■■□□ 2.22
IWS1-209ENST00000486662 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
IWS1-209ENST00000486662 POLKQ9UBT6 870 aa28.9■■■□□ 2.22
IWS1-209ENST00000486662 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
IWS1-209ENST00000486662 USP35Q9P2H5 1018 aa28.89■■■□□ 2.22
IWS1-209ENST00000486662 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
IWS1-209ENST00000486662 TCP11L2Q8N4U5 519 aa28.88■■■□□ 2.21
IWS1-209ENST00000486662 CARD10Q9BWT7 1032 aa28.88■■■□□ 2.21
IWS1-209ENST00000486662 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
IWS1-209ENST00000486662 INSRP06213 1382 aa28.88■■■□□ 2.21
IWS1-209ENST00000486662 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
IWS1-209ENST00000486662 BARGINQ6ZT62 677 aa28.86■■■□□ 2.21
IWS1-209ENST00000486662 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa28.85■■■□□ 2.21
IWS1-209ENST00000486662 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP28.85■■■□□ 2.21
IWS1-209ENST00000486662 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
IWS1-209ENST00000486662 RALBP1Q15311 655 aa28.84■■■□□ 2.21
IWS1-209ENST00000486662 SEPT12Q8IYM1 358 aa28.84■■■□□ 2.21
IWS1-209ENST00000486662 NLRP2Q9NX02 1062 aa28.84■■■□□ 2.21
IWS1-209ENST00000486662 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa28.83■■■□□ 2.21
IWS1-209ENST00000486662 A0A0G2JS52 829 aa28.83■■■□□ 2.21
IWS1-209ENST00000486662 MYT1Q01538 1121 aa28.83■■■□□ 2.21
IWS1-209ENST00000486662 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP28.83■■■□□ 2.21
IWS1-209ENST00000486662 PARD3Q8TEW0 1356 aa28.8■■■□□ 2.2
IWS1-209ENST00000486662 WNK3Q9BYP7 1800 aa28.79■■■□□ 2.2
IWS1-209ENST00000486662 BRWD3Q6RI45 1802 aa28.78■■■□□ 2.2
IWS1-209ENST00000486662 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP28.77■■■□□ 2.2
IWS1-209ENST00000486662 RGPD2P0DJD1 1756 aa28.76■■■□□ 2.19
IWS1-209ENST00000486662 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
IWS1-209ENST00000486662 MTHFSP49914 203 aa28.74■■■□□ 2.19
IWS1-209ENST00000486662 DISP2A7MBM2 1401 aa28.73■■■□□ 2.19
IWS1-209ENST00000486662 NBPF6Q5VWK0 638 aa28.72■■■□□ 2.19
IWS1-209ENST00000486662 KRT27Q7Z3Y8 459 aa28.72■■■□□ 2.19
IWS1-209ENST00000486662 NBPF4Q96M43 638 aa28.72■■■□□ 2.19
IWS1-209ENST00000486662 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
IWS1-209ENST00000486662 PPP2R1AP30153 589 aa28.71■■■□□ 2.19
IWS1-209ENST00000486662 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
IWS1-209ENST00000486662 IL2RBP14784 551 aa28.7■■■□□ 2.18
IWS1-209ENST00000486662 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP28.69■■■□□ 2.18
IWS1-209ENST00000486662 LRRC37A3O60309 1634 aa28.69■■■□□ 2.18
IWS1-209ENST00000486662 PDE3BQ13370 1112 aa28.68■■■□□ 2.18
IWS1-209ENST00000486662 DDB1Q16531 1140 aa28.67■■■□□ 2.18
IWS1-209ENST00000486662 MIER1Q8N108 512 aa28.66■■■□□ 2.18
IWS1-209ENST00000486662 USHBP1Q8N6Y0 703 aa28.66■■■□□ 2.18
IWS1-209ENST00000486662 EYA1Q99502 592 aa28.66■■■□□ 2.18
IWS1-209ENST00000486662 NCAPD2Q15021 1401 aa28.65■■■□□ 2.18
IWS1-209ENST00000486662 EXOC5O00471 708 aa28.64■■■□□ 2.18
IWS1-209ENST00000486662 TNS2Q63HR2 1409 aa28.62■■■□□ 2.17
IWS1-209ENST00000486662 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa28.62■■■□□ 2.17
IWS1-209ENST00000486662 IL13P35225 146 aa28.61■■■□□ 2.17
IWS1-209ENST00000486662 CFAP53Q96M91 514 aa28.61■■■□□ 2.17
IWS1-209ENST00000486662 IGSF1Q8N6C5 1336 aa28.61■■■□□ 2.17
IWS1-209ENST00000486662 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa28.61■■■□□ 2.17
IWS1-209ENST00000486662 MEGF6O75095 1541 aa28.59■■■□□ 2.17
IWS1-209ENST00000486662 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
IWS1-209ENST00000486662 TATP17735 454 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
IWS1-209ENST00000486662 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
IWS1-209ENST00000486662 RGPD1P0DJD0 1748 aa28.58■■■□□ 2.17
IWS1-209ENST00000486662 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms