RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484266.5

CHKB-210, Transcript of choline kinase beta, humanhuman

TSL 2

Gene CHKB, Length 1,401 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKB-210ENST00000484266 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP45.12■■■■■ 4.81
CHKB-210ENST00000484266 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP45.11■■■■■ 4.81
CHKB-210ENST00000484266 AXIN2Q9Y2T1 843 aa45.1■■■■■ 4.81
CHKB-210ENST00000484266 GLI3P10071 1580 aa45.1■■■■■ 4.81
CHKB-210ENST00000484266 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP45.09■■■■■ 4.81
CHKB-210ENST00000484266 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP45.09■■■■■ 4.81
CHKB-210ENST00000484266 STRN4Q9NRL3 753 aa45.09■■■■■ 4.81
CHKB-210ENST00000484266 MAP3K19Q56UN5 1328 aa45.06■■■■■ 4.8
CHKB-210ENST00000484266 EVA1CP58658 441 aa45.04■■■■■ 4.8
CHKB-210ENST00000484266 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP45.03■■■■■ 4.8
CHKB-210ENST00000484266 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP45.02■■■■■ 4.8
CHKB-210ENST00000484266 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP45.01■■■■■ 4.8
CHKB-210ENST00000484266 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP45■■■■■ 4.79
CHKB-210ENST00000484266 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa44.99■■■■■ 4.79
CHKB-210ENST00000484266 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa44.99■■■■■ 4.79
CHKB-210ENST00000484266 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP44.99■■■■■ 4.79
CHKB-210ENST00000484266 IP6K1Q92551 441 aa44.98■■■■■ 4.79
CHKB-210ENST00000484266 PEAK1Q9H792 1746 aa44.98■■■■■ 4.79
CHKB-210ENST00000484266 RTL1A6NKG5 1358 aa44.96■■■■■ 4.79
CHKB-210ENST00000484266 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP44.96■■■■■ 4.79
CHKB-210ENST00000484266 AMPHP49418 695 aa44.95■■■■■ 4.79
CHKB-210ENST00000484266 RGS12O14924 1447 aa44.95■■■■■ 4.79
CHKB-210ENST00000484266 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa44.94■■■■■ 4.79
CHKB-210ENST00000484266 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa44.94■■■■■ 4.79
CHKB-210ENST00000484266 MORC1Q86VD1 984 aa44.94■■■■■ 4.79
CHKB-210ENST00000484266 WDR17Q8IZU2 1322 aa44.93■■■■■ 4.78
CHKB-210ENST00000484266 HOXC9P31274 260 aa44.93■■■■■ 4.78
CHKB-210ENST00000484266 CRB1P82279 1406 aa44.93■■■■■ 4.78
CHKB-210ENST00000484266 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP44.92■■■■■ 4.78
CHKB-210ENST00000484266 ERBB3P21860 1342 aa44.91■■■■■ 4.78
CHKB-210ENST00000484266 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa44.91■■■■■ 4.78
CHKB-210ENST00000484266 KIF24Q5T7B8 1368 aa44.9■■■■■ 4.78
CHKB-210ENST00000484266 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP44.9■■■■■ 4.78
CHKB-210ENST00000484266 FLT4P35916 1363 aa44.87■■■■■ 4.77
CHKB-210ENST00000484266 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa44.86■■■■■ 4.77
CHKB-210ENST00000484266 ANKRD24Q8TF21 1146 aa44.86■■■■■ 4.77
CHKB-210ENST00000484266 USP35Q9P2H5 1018 aa44.86■■■■■ 4.77
CHKB-210ENST00000484266 POLKQ9UBT6 870 aa44.86■■■■■ 4.77
CHKB-210ENST00000484266 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa44.85■■■■■ 4.77
CHKB-210ENST00000484266 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP44.84■■■■■ 4.77
CHKB-210ENST00000484266 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP44.84■■■■■ 4.77
CHKB-210ENST00000484266 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP44.83■■■■■ 4.77
CHKB-210ENST00000484266 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP44.83■■■■■ 4.77
CHKB-210ENST00000484266 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa44.81■■■■■ 4.76
CHKB-210ENST00000484266 TCP11L2Q8N4U5 519 aa44.81■■■■■ 4.76
CHKB-210ENST00000484266 INSRP06213 1382 aa44.8■■■■■ 4.76
CHKB-210ENST00000484266 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa44.8■■■■■ 4.76
CHKB-210ENST00000484266 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP44.8■■■■■ 4.76
CHKB-210ENST00000484266 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP44.79■■■■■ 4.76
CHKB-210ENST00000484266 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP44.79■■■■■ 4.76
CHKB-210ENST00000484266 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP44.78■■■■■ 4.76
CHKB-210ENST00000484266 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP44.78■■■■■ 4.76
CHKB-210ENST00000484266 BRWD3Q6RI45 1802 aa44.78■■■■■ 4.76
CHKB-210ENST00000484266 BARGINQ6ZT62 677 aa44.77■■■■■ 4.76
CHKB-210ENST00000484266 CARD10Q9BWT7 1032 aa44.77■■■■■ 4.76
CHKB-210ENST00000484266 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP44.77■■■■■ 4.76
CHKB-210ENST00000484266 WNK3Q9BYP7 1800 aa44.77■■■■■ 4.76
CHKB-210ENST00000484266 RGPD2P0DJD1 1756 aa44.76■■■■■ 4.76
CHKB-210ENST00000484266 SEPT12Q8IYM1 358 aa44.75■■■■■ 4.76
CHKB-210ENST00000484266 NLRP2Q9NX02 1062 aa44.73■■■■■ 4.75
CHKB-210ENST00000484266 A0A0G2JS52 829 aa44.7■■■■■ 4.75
CHKB-210ENST00000484266 MYT1Q01538 1121 aa44.7■■■■■ 4.75
CHKB-210ENST00000484266 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP44.67■■■■■ 4.74
CHKB-210ENST00000484266 DISP2A7MBM2 1401 aa44.64■■■■■ 4.74
CHKB-210ENST00000484266 MTHFSP49914 203 aa44.6■■■■■ 4.73
CHKB-210ENST00000484266 NBPF6Q5VWK0 638 aa44.6■■■■■ 4.73
CHKB-210ENST00000484266 NBPF4Q96M43 638 aa44.6■■■■■ 4.73
CHKB-210ENST00000484266 LRRC37A3O60309 1634 aa44.6■■■■■ 4.73
CHKB-210ENST00000484266 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP44.57■■■■■ 4.72
CHKB-210ENST00000484266 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP44.56■■■■■ 4.72
CHKB-210ENST00000484266 KRT27Q7Z3Y8 459 aa44.56■■■■■ 4.72
CHKB-210ENST00000484266 PARD3Q8TEW0 1356 aa44.54■■■■■ 4.72
CHKB-210ENST00000484266 USHBP1Q8N6Y0 703 aa44.52■■■■■ 4.72
CHKB-210ENST00000484266 IL2RBP14784 551 aa44.51■■■■■ 4.72
CHKB-210ENST00000484266 NCAPD2Q15021 1401 aa44.5■■■■■ 4.71
CHKB-210ENST00000484266 SOCS7O14512 581 aa44.49■■■■■ 4.71
CHKB-210ENST00000484266 PPP2R1AP30153 589 aa44.49■■■■■ 4.71
CHKB-210ENST00000484266 EYA1Q99502 592 aa44.48■■■■■ 4.71
CHKB-210ENST00000484266 DDB1Q16531 1140 aa44.47■■■■■ 4.71
CHKB-210ENST00000484266 MEGF6O75095 1541 aa44.44■■■■■ 4.7
CHKB-210ENST00000484266 PDE3BQ13370 1112 aa44.44■■■■■ 4.7
CHKB-210ENST00000484266 EP400Q96L91 3159 aa44.44■■■■■ 4.7
CHKB-210ENST00000484266 RGPD1P0DJD0 1748 aa44.43■■■■■ 4.7
CHKB-210ENST00000484266 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP44.43■■■■■ 4.7
CHKB-210ENST00000484266 TNS2Q63HR2 1409 aa44.43■■■■■ 4.7
CHKB-210ENST00000484266 IL13P35225 146 aa44.41■■■■■ 4.7
CHKB-210ENST00000484266 IGSF1Q8N6C5 1336 aa44.41■■■■■ 4.7
CHKB-210ENST00000484266 FAM182BQ5T319 152 aa44.41■■■■■ 4.7
CHKB-210ENST00000484266 EXOC5O00471 708 aa44.39■■■■■ 4.7
CHKB-210ENST00000484266 RALBP1Q15311 655 aa44.39■■■■■ 4.7
CHKB-210ENST00000484266 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa44.37■■■■■ 4.69
CHKB-210ENST00000484266 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa44.36■■■■■ 4.69
CHKB-210ENST00000484266 SHANK3Q9BYB0 1731 aa44.34■■■■■ 4.69
CHKB-210ENST00000484266 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP44.33■■■■■ 4.69
CHKB-210ENST00000484266 TATP17735 454 aaPredicted RBP44.32■■■■■ 4.68
CHKB-210ENST00000484266 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP44.32■■■■■ 4.68
CHKB-210ENST00000484266 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP44.32■■■■■ 4.68
CHKB-210ENST00000484266 CFAP53Q96M91 514 aa44.3■■■■■ 4.68
CHKB-210ENST00000484266 PKD1L3Q7Z443 1732 aa44.28■■■■■ 4.68
CHKB-210ENST00000484266 FAM196AQ6ZSG2 479 aa44.27■■■■■ 4.68
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