RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
PTPRC-211ENST00000484135 LORP23490 312 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
PTPRC-211ENST00000484135 WDR4P57081 412 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
PTPRC-211ENST00000484135 PTK2Q05397 1052 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRC-211ENST00000484135 ZBTB33Q86T24 672 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRC-211ENST00000484135 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
PTPRC-211ENST00000484135 SLC10A4Q96EP9 437 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRC-211ENST00000484135 NR5A1Q13285 461 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRC-211ENST00000484135 ERFEQ4G0M1 354 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRC-211ENST00000484135 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRC-211ENST00000484135 ERBB4Q15303 1308 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRC-211ENST00000484135 NR3C2P08235 984 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRC-211ENST00000484135 TIMP2P16035 220 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRC-211ENST00000484135 SCARF1Q14162 830 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRC-211ENST00000484135 ZFP42Q96MM3 310 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRC-211ENST00000484135 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
PTPRC-211ENST00000484135 GRM5P41594 1212 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRC-211ENST00000484135 GPSM3Q9Y4H4 160 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRC-211ENST00000484135 TRIM34Q9BYJ4 488 aa9.21□□□□□ -0.94
PTPRC-211ENST00000484135 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
PTPRC-211ENST00000484135 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
PTPRC-211ENST00000484135 ADAM32Q8TC27 787 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRC-211ENST00000484135 ITPKCQ96DU7 683 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRC-211ENST00000484135 ZFAND3Q9H8U3 227 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRC-211ENST00000484135 CCDC116Q8IYX3 515 aa9.19□□□□□ -0.94
PTPRC-211ENST00000484135 ABCC9O60706 1549 aa9.19□□□□□ -0.94
PTPRC-211ENST00000484135 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
PTPRC-211ENST00000484135 BANK1Q8NDB2 785 aa9.18□□□□□ -0.94
PTPRC-211ENST00000484135 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
PTPRC-211ENST00000484135 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
PTPRC-211ENST00000484135 OCSTAMPQ9BR26 566 aa9.18□□□□□ -0.94
PTPRC-211ENST00000484135 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
PTPRC-211ENST00000484135 APBB1O00213 710 aa9.17□□□□□ -0.94
PTPRC-211ENST00000484135 NBPF20Q3BBV1 942 aa9.17□□□□□ -0.94
PTPRC-211ENST00000484135 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
PTPRC-211ENST00000484135 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
PTPRC-211ENST00000484135 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa9.17□□□□□ -0.94
PTPRC-211ENST00000484135 UPP2O95045 317 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRC-211ENST00000484135 MTMR14Q8NCE2 650 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRC-211ENST00000484135 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRC-211ENST00000484135 ZBBXA8MT70 800 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRC-211ENST00000484135 RAB15P59190 212 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRC-211ENST00000484135 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
PTPRC-211ENST00000484135 C6orf118Q5T5N4 469 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRC-211ENST00000484135 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
PTPRC-211ENST00000484135 SNRKQ9NRH2 765 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRC-211ENST00000484135 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRC-211ENST00000484135 VSIG8P0DPA2 414 aa9.13□□□□□ -0.95
PTPRC-211ENST00000484135 KCNMA1Q12791 1236 aa9.13□□□□□ -0.95
PTPRC-211ENST00000484135 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
PTPRC-211ENST00000484135 LINC00528Q8N1L1 170 aa9.13□□□□□ -0.95
PTPRC-211ENST00000484135 MEIOBQ8N635 442 aa9.13□□□□□ -0.95
PTPRC-211ENST00000484135 SOCS7O14512 581 aa9.12□□□□□ -0.95
PTPRC-211ENST00000484135 BMP2P12643 396 aa9.12□□□□□ -0.95
PTPRC-211ENST00000484135 KCTD17Q8N5Z5 321 aa9.12□□□□□ -0.95
PTPRC-211ENST00000484135 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa9.12□□□□□ -0.95
PTPRC-211ENST00000484135 MAN1A2O60476 641 aa9.11□□□□□ -0.95
PTPRC-211ENST00000484135 FBXO45P0C2W1 286 aa9.11□□□□□ -0.95
PTPRC-211ENST00000484135 SOBPA7XYQ1 873 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRC-211ENST00000484135 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM151AQ8N4L1 468 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
PTPRC-211ENST00000484135 NR1H3Q13133 447 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRC-211ENST00000484135 CBLBQ13191 982 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRC-211ENST00000484135 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
PTPRC-211ENST00000484135 PRM3Q9NNZ6 103 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRC-211ENST00000484135 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRC-211ENST00000484135 GDF11O95390 407 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRC-211ENST00000484135 ESPNB1AK53 854 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRC-211ENST00000484135 ERVH48-1M5A8F1 160 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRC-211ENST00000484135 GPR37L1O60883 481 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRC-211ENST00000484135 Q6ZVU0 165 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRC-211ENST00000484135 SEPT12Q8IYM1 358 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF592Q92610 1267 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRC-211ENST00000484135 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRC-211ENST00000484135 PPFIA3O75145 1194 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRC-211ENST00000484135 RASSF7Q02833 373 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRC-211ENST00000484135 TRIM52Q96A61 297 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRC-211ENST00000484135 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
PTPRC-211ENST00000484135 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
PTPRC-211ENST00000484135 RELBQ01201 579 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRC-211ENST00000484135 AGBL1Q96MI9 1066 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRC-211ENST00000484135 CYLDQ9NQC7 956 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRC-211ENST00000484135 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
PTPRC-211ENST00000484135 TTLL8A6PVC2 850 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRC-211ENST00000484135 ADH1AP07327 375 aa9□□□□□ -0.97
PTPRC-211ENST00000484135 ABL2P42684 1182 aa9□□□□□ -0.97
PTPRC-211ENST00000484135 RNF20Q5VTR2 975 aa9□□□□□ -0.97
PTPRC-211ENST00000484135 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
PTPRC-211ENST00000484135 SPINT1O43278 529 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRC-211ENST00000484135 GSK3AP49840 483 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRC-211ENST00000484135 MCM6Q14566 821 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRC-211ENST00000484135 GDPD2Q9HCC8 539 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRC-211ENST00000484135 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
PTPRC-211ENST00000484135 DNMT3LQ9UJW3 386 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRC-211ENST00000484135 LILRA1O75019 489 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
PTPRC-211ENST00000484135 ADAMTS8Q9UP79 889 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRC-211ENST00000484135 FIGNL2A6NMB9 653 aa8.97□□□□□ -0.97
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