RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481564.1

MALSU1-205, Transcript of mitochondrial assembly of ribosomal large subunit 1, humanhuman

TSL 2

Gene MALSU1, Length 625 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1-205ENST00000481564 WDR17Q8IZU2 1322 aa29.12■■■□□ 2.25
MALSU1-205ENST00000481564 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa29.12■■■□□ 2.25
MALSU1-205ENST00000481564 WNK3Q9BYP7 1800 aa29.11■■■□□ 2.25
MALSU1-205ENST00000481564 NBPF14Q5TI25 921 aa29.11■■■□□ 2.25
MALSU1-205ENST00000481564 ARHGEF25Q86VW2 580 aa29.11■■■□□ 2.25
MALSU1-205ENST00000481564 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP29.11■■■□□ 2.25
MALSU1-205ENST00000481564 BCL9O00512 1426 aa29.1■■■□□ 2.25
MALSU1-205ENST00000481564 ABCC6O95255 1503 aa29.1■■■□□ 2.25
MALSU1-205ENST00000481564 SBF2Q86WG5 1849 aa29.09■■■□□ 2.25
MALSU1-205ENST00000481564 DDB1Q16531 1140 aa29.08■■■□□ 2.25
MALSU1-205ENST00000481564 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa29.08■■■□□ 2.25
MALSU1-205ENST00000481564 AXIN2Q9Y2T1 843 aa29.08■■■□□ 2.25
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MALSU1-205ENST00000481564 MON2Q7Z3U7 1717 aa29.05■■■□□ 2.24
MALSU1-205ENST00000481564 NFAT5O94916 1531 aa29.04■■■□□ 2.24
MALSU1-205ENST00000481564 USP54Q70EL1 1684 aa29.03■■■□□ 2.24
MALSU1-205ENST00000481564 CARD10Q9BWT7 1032 aa29.03■■■□□ 2.24
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MALSU1-205ENST00000481564 SPON1Q9HCB6 807 aa28.94■■■□□ 2.22
MALSU1-205ENST00000481564 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa28.93■■■□□ 2.22
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MALSU1-205ENST00000481564 CARD11Q9BXL7 1154 aa28.91■■■□□ 2.22
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MALSU1-205ENST00000481564 SOX12O15370 315 aa28.9■■■□□ 2.22
MALSU1-205ENST00000481564 CASZ1Q86V15 1759 aa28.88■■■□□ 2.21
MALSU1-205ENST00000481564 PTF1AQ7RTS3 328 aa28.88■■■□□ 2.21
MALSU1-205ENST00000481564 ERBB3P21860 1342 aa28.88■■■□□ 2.21
MALSU1-205ENST00000481564 NINLQ9Y2I6 1382 aa28.88■■■□□ 2.21
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MALSU1-205ENST00000481564 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP28.86■■■□□ 2.21
MALSU1-205ENST00000481564 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP28.86■■■□□ 2.21
MALSU1-205ENST00000481564 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP28.86■■■□□ 2.21
MALSU1-205ENST00000481564 LTN1O94822 1766 aa28.85■■■□□ 2.21
MALSU1-205ENST00000481564 NME9Q86XW9 330 aa28.84■■■□□ 2.21
MALSU1-205ENST00000481564 NHSQ6T4R5 1651 aa28.83■■■□□ 2.21
MALSU1-205ENST00000481564 TERF2IPQ9NYB0 399 aa28.82■■■□□ 2.2
MALSU1-205ENST00000481564 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP28.82■■■□□ 2.2
MALSU1-205ENST00000481564 TONSLQ96HA7 1378 aa28.81■■■□□ 2.2
MALSU1-205ENST00000481564 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa28.81■■■□□ 2.2
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MALSU1-205ENST00000481564 TMC1Q8TDI8 760 aa28.8■■■□□ 2.2
MALSU1-205ENST00000481564 A0A1W2PP64 1363 aa28.79■■■□□ 2.2
MALSU1-205ENST00000481564 SLC24A1O60721 1099 aa28.78■■■□□ 2.2
MALSU1-205ENST00000481564 IL2RBP14784 551 aa28.78■■■□□ 2.2
MALSU1-205ENST00000481564 NLRP2Q9NX02 1062 aa28.77■■■□□ 2.2
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MALSU1-205ENST00000481564 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa28.67■■■□□ 2.18
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MALSU1-205ENST00000481564 MYOM1P52179 1685 aa28.66■■■□□ 2.18
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MALSU1-205ENST00000481564 COG3Q96JB2 828 aa28.63■■■□□ 2.17
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MALSU1-205ENST00000481564 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa28.62■■■□□ 2.17
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MALSU1-205ENST00000481564 SLC27A3Q5K4L6 730 aa28.58■■■□□ 2.17
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MALSU1-205ENST00000481564 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP28.54■■■□□ 2.16
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MALSU1-205ENST00000481564 TMF1P82094 1093 aa28.52■■■□□ 2.16
MALSU1-205ENST00000481564 ZNF827Q17R98 1081 aa28.52■■■□□ 2.16
MALSU1-205ENST00000481564 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
MALSU1-205ENST00000481564 AKT1S1Q96B36 256 aa28.52■■■□□ 2.16
MALSU1-205ENST00000481564 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP28.52■■■□□ 2.16
MALSU1-205ENST00000481564 SLC16A10Q8TF71 515 aa28.51■■■□□ 2.15
MALSU1-205ENST00000481564 CGNL1Q0VF96 1302 aa28.5■■■□□ 2.15
MALSU1-205ENST00000481564 COL24A1Q17RW2 1714 aa28.5■■■□□ 2.15
MALSU1-205ENST00000481564 FBLN1P23142 703 aa28.5■■■□□ 2.15
MALSU1-205ENST00000481564 RGPD2P0DJD1 1756 aa28.5■■■□□ 2.15
MALSU1-205ENST00000481564 USP47Q96K76 1375 aa28.5■■■□□ 2.15
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