RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477612.5

COL9A3-211, Transcript of collagen type IX alpha 3 chain, humanhuman

TSL 3

Gene COL9A3, Length 635 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3-211ENST00000477612 CRB1P82279 1406 aa30.49■■■□□ 2.47
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COL9A3-211ENST00000477612 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa30.47■■■□□ 2.47
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COL9A3-211ENST00000477612 OVOS2Q6IE36 1432 aa30.47■■■□□ 2.47
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COL9A3-211ENST00000477612 DDB1Q16531 1140 aa30.25■■■□□ 2.43
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COL9A3-211ENST00000477612 MAP3K19Q56UN5 1328 aa30.22■■■□□ 2.43
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COL9A3-211ENST00000477612 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP30.19■■■□□ 2.42
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COL9A3-211ENST00000477612 NLRP2Q9NX02 1062 aa30.17■■■□□ 2.42
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COL9A3-211ENST00000477612 CGNL1Q0VF96 1302 aa30.09■■■□□ 2.41
COL9A3-211ENST00000477612 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa30.09■■■□□ 2.41
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COL9A3-211ENST00000477612 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
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COL9A3-211ENST00000477612 FLT4P35916 1363 aa30.03■■■□□ 2.4
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COL9A3-211ENST00000477612 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa30■■■□□ 2.39
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COL9A3-211ENST00000477612 NBPF4Q96M43 638 aa29.99■■■□□ 2.39
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COL9A3-211ENST00000477612 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP29.98■■■□□ 2.39
COL9A3-211ENST00000477612 PTF1AQ7RTS3 328 aa29.98■■■□□ 2.39
COL9A3-211ENST00000477612 KAT6BQ8WYB5 2073 aa29.97■■■□□ 2.39
COL9A3-211ENST00000477612 SHANK3Q9BYB0 1731 aa29.97■■■□□ 2.39
COL9A3-211ENST00000477612 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa29.97■■■□□ 2.39
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COL9A3-211ENST00000477612 KIF7Q2M1P5 1343 aa29.93■■■□□ 2.38
COL9A3-211ENST00000477612 MEGF6O75095 1541 aa29.92■■■□□ 2.38
COL9A3-211ENST00000477612 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP29.92■■■□□ 2.38
COL9A3-211ENST00000477612 NCAPD2Q15021 1401 aa29.9■■■□□ 2.38
COL9A3-211ENST00000477612 LRP5O75197 1615 aa29.9■■■□□ 2.38
COL9A3-211ENST00000477612 KCNQ2O43526 872 aa29.9■■■□□ 2.38
COL9A3-211ENST00000477612 BTAF1O14981 1849 aa29.89■■■□□ 2.38
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