RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477440.6

ARHGEF3-208, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

TSL 3

Gene ARHGEF3, Length 587 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3-208ENST00000477440 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa35.16■■■■□ 3.22
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ARHGEF3-208ENST00000477440 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP35.16■■■■□ 3.22
ARHGEF3-208ENST00000477440 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP35.16■■■■□ 3.22
ARHGEF3-208ENST00000477440 AXIN2Q9Y2T1 843 aa35.16■■■■□ 3.22
ARHGEF3-208ENST00000477440 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa35.16■■■■□ 3.22
ARHGEF3-208ENST00000477440 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP35.15■■■■□ 3.22
ARHGEF3-208ENST00000477440 SEPT12Q8IYM1 358 aa35.14■■■■□ 3.22
ARHGEF3-208ENST00000477440 GGNBP2Q9H3C7 697 aa35.14■■■■□ 3.22
ARHGEF3-208ENST00000477440 EP400Q96L91 3159 aa35.12■■■■□ 3.21
ARHGEF3-208ENST00000477440 KIF7Q2M1P5 1343 aa35.11■■■■□ 3.21
ARHGEF3-208ENST00000477440 USP35Q9P2H5 1018 aa35.11■■■■□ 3.21
ARHGEF3-208ENST00000477440 CRB1P82279 1406 aa35.09■■■■□ 3.21
ARHGEF3-208ENST00000477440 A0A0G2JS52 829 aa35.09■■■■□ 3.21
ARHGEF3-208ENST00000477440 MYT1Q01538 1121 aa35.09■■■■□ 3.21
ARHGEF3-208ENST00000477440 FBLN1P23142 703 aa35.06■■■■□ 3.2
ARHGEF3-208ENST00000477440 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP35.06■■■■□ 3.2
ARHGEF3-208ENST00000477440 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa35.06■■■■□ 3.2
ARHGEF3-208ENST00000477440 WDR17Q8IZU2 1322 aa35.06■■■■□ 3.2
ARHGEF3-208ENST00000477440 WNK3Q9BYP7 1800 aa35.05■■■■□ 3.2
ARHGEF3-208ENST00000477440 PANK3Q9H999 370 aa35.05■■■■□ 3.2
ARHGEF3-208ENST00000477440 TCP11L2Q8N4U5 519 aa35.02■■■■□ 3.2
ARHGEF3-208ENST00000477440 CGNL1Q0VF96 1302 aa35.02■■■■□ 3.2
ARHGEF3-208ENST00000477440 BARGINQ6ZT62 677 aa35.01■■■■□ 3.2
ARHGEF3-208ENST00000477440 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa35.01■■■■□ 3.2
ARHGEF3-208ENST00000477440 MAP3K19Q56UN5 1328 aa35.01■■■■□ 3.19
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ARHGEF3-208ENST00000477440 KRT27Q7Z3Y8 459 aa34.99■■■■□ 3.19
ARHGEF3-208ENST00000477440 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa34.98■■■■□ 3.19
ARHGEF3-208ENST00000477440 ERBB3P21860 1342 aa34.98■■■■□ 3.19
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ARHGEF3-208ENST00000477440 IP6K1Q92551 441 aa34.96■■■■□ 3.19
ARHGEF3-208ENST00000477440 CCDC7Q96M83 1385 aa34.96■■■■□ 3.19
ARHGEF3-208ENST00000477440 WASHC2AQ641Q2 1341 aa34.94■■■■□ 3.18
ARHGEF3-208ENST00000477440 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP34.94■■■■□ 3.18
ARHGEF3-208ENST00000477440 ANKRD24Q8TF21 1146 aa34.93■■■■□ 3.18
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ARHGEF3-208ENST00000477440 LRRC37A3O60309 1634 aa34.92■■■■□ 3.18
ARHGEF3-208ENST00000477440 RTL1A6NKG5 1358 aa34.92■■■■□ 3.18
ARHGEF3-208ENST00000477440 HOXC9P31274 260 aa34.92■■■■□ 3.18
ARHGEF3-208ENST00000477440 CARD10Q9BWT7 1032 aa34.92■■■■□ 3.18
ARHGEF3-208ENST00000477440 AMPHP49418 695 aa34.91■■■■□ 3.18
ARHGEF3-208ENST00000477440 RGPD2P0DJD1 1756 aa34.9■■■■□ 3.18
ARHGEF3-208ENST00000477440 FAM182BQ5T319 152 aa34.88■■■■□ 3.17
ARHGEF3-208ENST00000477440 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP34.86■■■■□ 3.17
ARHGEF3-208ENST00000477440 NLRP2Q9NX02 1062 aa34.86■■■■□ 3.17
ARHGEF3-208ENST00000477440 DISP2A7MBM2 1401 aa34.86■■■■□ 3.17
ARHGEF3-208ENST00000477440 NSD2O96028 1365 aa34.86■■■■□ 3.17
ARHGEF3-208ENST00000477440 KNSTRNQ9Y448 316 aa34.83■■■■□ 3.17
ARHGEF3-208ENST00000477440 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa34.83■■■■□ 3.17
ARHGEF3-208ENST00000477440 FLT4P35916 1363 aa34.83■■■■□ 3.17
ARHGEF3-208ENST00000477440 KIF24Q5T7B8 1368 aa34.81■■■■□ 3.16
ARHGEF3-208ENST00000477440 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP34.79■■■■□ 3.16
ARHGEF3-208ENST00000477440 PDE3BQ13370 1112 aa34.79■■■■□ 3.16
ARHGEF3-208ENST00000477440 INSRP06213 1382 aa34.78■■■■□ 3.16
ARHGEF3-208ENST00000477440 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa34.78■■■■□ 3.16
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ARHGEF3-208ENST00000477440 DDB1Q16531 1140 aa34.76■■■■□ 3.16
ARHGEF3-208ENST00000477440 CCDC125Q86Z20 511 aa34.75■■■■□ 3.15
ARHGEF3-208ENST00000477440 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP34.74■■■■□ 3.15
ARHGEF3-208ENST00000477440 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP34.74■■■■□ 3.15
ARHGEF3-208ENST00000477440 POLKQ9UBT6 870 aa34.74■■■■□ 3.15
ARHGEF3-208ENST00000477440 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP34.74■■■■□ 3.15
ARHGEF3-208ENST00000477440 TNS2Q63HR2 1409 aa34.72■■■■□ 3.15
ARHGEF3-208ENST00000477440 MORC1Q86VD1 984 aa34.72■■■■□ 3.15
ARHGEF3-208ENST00000477440 IL2RBP14784 551 aa34.7■■■■□ 3.15
ARHGEF3-208ENST00000477440 FAM196AQ6ZSG2 479 aa34.7■■■■□ 3.15
ARHGEF3-208ENST00000477440 SBF2Q86WG5 1849 aa34.69■■■■□ 3.14
ARHGEF3-208ENST00000477440 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa34.69■■■■□ 3.14
ARHGEF3-208ENST00000477440 NBPF6Q5VWK0 638 aa34.68■■■■□ 3.14
ARHGEF3-208ENST00000477440 NBPF4Q96M43 638 aa34.68■■■■□ 3.14
ARHGEF3-208ENST00000477440 EXOC5O00471 708 aa34.65■■■■□ 3.14
ARHGEF3-208ENST00000477440 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP34.65■■■■□ 3.14
ARHGEF3-208ENST00000477440 USHBP1Q8N6Y0 703 aa34.65■■■■□ 3.14
ARHGEF3-208ENST00000477440 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP34.65■■■■□ 3.14
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ARHGEF3-208ENST00000477440 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP34.63■■■■□ 3.13
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ARHGEF3-208ENST00000477440 TRIM37O94972 964 aa34.62■■■■□ 3.13
ARHGEF3-208ENST00000477440 DEFB132Q7Z7B7 95 aa34.62■■■■□ 3.13
ARHGEF3-208ENST00000477440 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa34.6■■■■□ 3.13
ARHGEF3-208ENST00000477440 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP34.58■■■■□ 3.13
ARHGEF3-208ENST00000477440 NCAPD2Q15021 1401 aa34.57■■■■□ 3.13
ARHGEF3-208ENST00000477440 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP34.56■■■■□ 3.12
ARHGEF3-208ENST00000477440 BCL9O00512 1426 aa34.55■■■■□ 3.12
ARHGEF3-208ENST00000477440 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP34.55■■■■□ 3.12
ARHGEF3-208ENST00000477440 BAG6P46379 1132 aa34.54■■■■□ 3.12
ARHGEF3-208ENST00000477440 EYA1Q99502 592 aa34.52■■■■□ 3.12
ARHGEF3-208ENST00000477440 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa34.51■■■■□ 3.12
ARHGEF3-208ENST00000477440 NHSQ6T4R5 1651 aa34.5■■■■□ 3.11
ARHGEF3-208ENST00000477440 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP34.49■■■■□ 3.11
ARHGEF3-208ENST00000477440 PKD1L3Q7Z443 1732 aa34.49■■■■□ 3.11
ARHGEF3-208ENST00000477440 KAT6BQ8WYB5 2073 aa34.48■■■■□ 3.11
ARHGEF3-208ENST00000477440 APBA3O96018 575 aa34.47■■■■□ 3.11
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