RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474160.1

SYF2-203, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

TSL 2

Gene SYF2, Length 438 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-203ENST00000474160 POLR3GLQ9BT43 218 aa26.15■■□□□ 1.78
SYF2-203ENST00000474160 CARD14Q9BXL6 1004 aa26.15■■□□□ 1.78
SYF2-203ENST00000474160 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
SYF2-203ENST00000474160 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
SYF2-203ENST00000474160 CGNL1Q0VF96 1302 aa26.14■■□□□ 1.77
SYF2-203ENST00000474160 WDR17Q8IZU2 1322 aa26.14■■□□□ 1.77
SYF2-203ENST00000474160 TCP11L2Q8N4U5 519 aa26.13■■□□□ 1.77
SYF2-203ENST00000474160 KIF20BQ96Q89 1820 aa26.12■■□□□ 1.77
SYF2-203ENST00000474160 AXIN2Q9Y2T1 843 aa26.12■■□□□ 1.77
SYF2-203ENST00000474160 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP26.11■■□□□ 1.77
SYF2-203ENST00000474160 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa26.11■■□□□ 1.77
SYF2-203ENST00000474160 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
SYF2-203ENST00000474160 GGNBP2Q9H3C7 697 aa26.1■■□□□ 1.77
SYF2-203ENST00000474160 LTN1O94822 1766 aa26.1■■□□□ 1.77
SYF2-203ENST00000474160 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
SYF2-203ENST00000474160 KIF7Q2M1P5 1343 aa26.09■■□□□ 1.77
SYF2-203ENST00000474160 A0A0G2JS52 829 aa26.08■■□□□ 1.77
SYF2-203ENST00000474160 MYT1Q01538 1121 aa26.08■■□□□ 1.77
SYF2-203ENST00000474160 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa26.08■■□□□ 1.77
SYF2-203ENST00000474160 KRT27Q7Z3Y8 459 aa26.08■■□□□ 1.77
SYF2-203ENST00000474160 RTL1A6NKG5 1358 aa26.07■■□□□ 1.76
SYF2-203ENST00000474160 KIF24Q5T7B8 1368 aa26.07■■□□□ 1.76
SYF2-203ENST00000474160 CCDC125Q86Z20 511 aa26.07■■□□□ 1.76
SYF2-203ENST00000474160 IP6K1Q92551 441 aa26.07■■□□□ 1.76
SYF2-203ENST00000474160 PANK3Q9H999 370 aa26.07■■□□□ 1.76
SYF2-203ENST00000474160 NSD2O96028 1365 aa26.07■■□□□ 1.76
SYF2-203ENST00000474160 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
SYF2-203ENST00000474160 CARD10Q9BWT7 1032 aa26.06■■□□□ 1.76
SYF2-203ENST00000474160 ERBB3P21860 1342 aa26.06■■□□□ 1.76
SYF2-203ENST00000474160 CCDC7Q96M83 1385 aa26.06■■□□□ 1.76
SYF2-203ENST00000474160 BRWD3Q6RI45 1802 aa26.05■■□□□ 1.76
SYF2-203ENST00000474160 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa26.05■■□□□ 1.76
SYF2-203ENST00000474160 USP35Q9P2H5 1018 aa26.05■■□□□ 1.76
SYF2-203ENST00000474160 MAP3K19Q56UN5 1328 aa26.04■■□□□ 1.76
SYF2-203ENST00000474160 RGPD5Q99666 1765 aa26.03■■□□□ 1.76
SYF2-203ENST00000474160 AMPHP49418 695 aa26.02■■□□□ 1.76
SYF2-203ENST00000474160 HOXC9P31274 260 aa26■■□□□ 1.75
SYF2-203ENST00000474160 ANKRD24Q8TF21 1146 aa26■■□□□ 1.75
SYF2-203ENST00000474160 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
SYF2-203ENST00000474160 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
SYF2-203ENST00000474160 KNSTRNQ9Y448 316 aa25.99■■□□□ 1.75
SYF2-203ENST00000474160 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa25.98■■□□□ 1.75
SYF2-203ENST00000474160 FLT4P35916 1363 aa25.96■■□□□ 1.75
SYF2-203ENST00000474160 PDE3BQ13370 1112 aa25.96■■□□□ 1.75
SYF2-203ENST00000474160 EP400Q96L91 3159 aa25.96■■□□□ 1.75
SYF2-203ENST00000474160 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
SYF2-203ENST00000474160 DISP2A7MBM2 1401 aa25.95■■□□□ 1.74
SYF2-203ENST00000474160 INSRP06213 1382 aa25.95■■□□□ 1.74
SYF2-203ENST00000474160 WASHC2AQ641Q2 1341 aa25.94■■□□□ 1.74
SYF2-203ENST00000474160 WNK3Q9BYP7 1800 aa25.94■■□□□ 1.74
SYF2-203ENST00000474160 NLRP2Q9NX02 1062 aa25.94■■□□□ 1.74
SYF2-203ENST00000474160 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
SYF2-203ENST00000474160 FAM196AQ6ZSG2 479 aa25.93■■□□□ 1.74
SYF2-203ENST00000474160 FBLN1P23142 703 aa25.92■■□□□ 1.74
SYF2-203ENST00000474160 DDB1Q16531 1140 aa25.92■■□□□ 1.74
SYF2-203ENST00000474160 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
SYF2-203ENST00000474160 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
SYF2-203ENST00000474160 LRRC37A3O60309 1634 aa25.88■■□□□ 1.73
SYF2-203ENST00000474160 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa25.88■■□□□ 1.73
SYF2-203ENST00000474160 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
SYF2-203ENST00000474160 IL2RBP14784 551 aa25.88■■□□□ 1.73
SYF2-203ENST00000474160 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
SYF2-203ENST00000474160 EXOC5O00471 708 aa25.87■■□□□ 1.73
SYF2-203ENST00000474160 MORC1Q86VD1 984 aa25.87■■□□□ 1.73
SYF2-203ENST00000474160 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
SYF2-203ENST00000474160 POLKQ9UBT6 870 aa25.86■■□□□ 1.73
SYF2-203ENST00000474160 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa25.86■■□□□ 1.73
SYF2-203ENST00000474160 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa25.86■■□□□ 1.73
SYF2-203ENST00000474160 BCL9O00512 1426 aa25.86■■□□□ 1.73
SYF2-203ENST00000474160 TNS2Q63HR2 1409 aa25.86■■□□□ 1.73
SYF2-203ENST00000474160 PEAK1Q9H792 1746 aa25.85■■□□□ 1.73
SYF2-203ENST00000474160 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa25.85■■□□□ 1.73
SYF2-203ENST00000474160 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
SYF2-203ENST00000474160 RGPD1P0DJD0 1748 aa25.83■■□□□ 1.73
SYF2-203ENST00000474160 BAG6P46379 1132 aa25.8■■□□□ 1.72
SYF2-203ENST00000474160 FAM182BQ5T319 152 aa25.8■■□□□ 1.72
SYF2-203ENST00000474160 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
SYF2-203ENST00000474160 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
SYF2-203ENST00000474160 NBPF6Q5VWK0 638 aa25.78■■□□□ 1.72
SYF2-203ENST00000474160 NBPF4Q96M43 638 aa25.78■■□□□ 1.72
SYF2-203ENST00000474160 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
SYF2-203ENST00000474160 NCAPD2Q15021 1401 aa25.77■■□□□ 1.72
SYF2-203ENST00000474160 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa25.75■■□□□ 1.71
SYF2-203ENST00000474160 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa25.75■■□□□ 1.71
SYF2-203ENST00000474160 PARD3Q8TEW0 1356 aa25.74■■□□□ 1.71
SYF2-203ENST00000474160 TRIM37O94972 964 aa25.74■■□□□ 1.71
SYF2-203ENST00000474160 RGPD2P0DJD1 1756 aa25.73■■□□□ 1.71
SYF2-203ENST00000474160 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
SYF2-203ENST00000474160 TATP17735 454 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
SYF2-203ENST00000474160 MEGF6O75095 1541 aa25.7■■□□□ 1.7
SYF2-203ENST00000474160 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
SYF2-203ENST00000474160 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
SYF2-203ENST00000474160 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
SYF2-203ENST00000474160 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.7
SYF2-203ENST00000474160 DEFB132Q7Z7B7 95 aa25.69■■□□□ 1.7
SYF2-203ENST00000474160 EYA1Q99502 592 aa25.69■■□□□ 1.7
SYF2-203ENST00000474160 SBF2Q86WG5 1849 aa25.68■■□□□ 1.7
SYF2-203ENST00000474160 APBA3O96018 575 aa25.67■■□□□ 1.7
SYF2-203ENST00000474160 USHBP1Q8N6Y0 703 aa25.67■■□□□ 1.7
SYF2-203ENST00000474160 IGSF1Q8N6C5 1336 aa25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.5 ms