RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472427.5

RALGPS1-212, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2

Gene RALGPS1, Length 764 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-212ENST00000472427 STRN4Q9NRL3 753 aa29.62■■■□□ 2.33
RALGPS1-212ENST00000472427 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa29.62■■■□□ 2.33
RALGPS1-212ENST00000472427 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP29.61■■■□□ 2.33
RALGPS1-212ENST00000472427 MAP3K19Q56UN5 1328 aa29.61■■■□□ 2.33
RALGPS1-212ENST00000472427 COL18A1P39060 1754 aa29.61■■■□□ 2.33
RALGPS1-212ENST00000472427 VPS72Q15906 364 aa29.6■■■□□ 2.33
RALGPS1-212ENST00000472427 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP29.6■■■□□ 2.33
RALGPS1-212ENST00000472427 KIF24Q5T7B8 1368 aa29.6■■■□□ 2.33
RALGPS1-212ENST00000472427 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP29.6■■■□□ 2.33
RALGPS1-212ENST00000472427 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP29.6■■■□□ 2.33
RALGPS1-212ENST00000472427 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP29.59■■■□□ 2.33
RALGPS1-212ENST00000472427 RXRBP28702 533 aa29.58■■■□□ 2.33
RALGPS1-212ENST00000472427 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP29.58■■■□□ 2.33
RALGPS1-212ENST00000472427 POTEAQ6S8J7 498 aa29.58■■■□□ 2.33
RALGPS1-212ENST00000472427 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP29.57■■■□□ 2.32
RALGPS1-212ENST00000472427 IP6K1Q92551 441 aa29.57■■■□□ 2.32
RALGPS1-212ENST00000472427 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa29.56■■■□□ 2.32
RALGPS1-212ENST00000472427 FLT4P35916 1363 aa29.55■■■□□ 2.32
RALGPS1-212ENST00000472427 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP29.55■■■□□ 2.32
RALGPS1-212ENST00000472427 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP29.55■■■□□ 2.32
RALGPS1-212ENST00000472427 FBLN1P23142 703 aa29.54■■■□□ 2.32
RALGPS1-212ENST00000472427 HOXC9P31274 260 aa29.54■■■□□ 2.32
RALGPS1-212ENST00000472427 AXIN2Q9Y2T1 843 aa29.54■■■□□ 2.32
RALGPS1-212ENST00000472427 RGPD5Q99666 1765 aa29.54■■■□□ 2.32
RALGPS1-212ENST00000472427 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP29.54■■■□□ 2.32
RALGPS1-212ENST00000472427 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP29.53■■■□□ 2.32
RALGPS1-212ENST00000472427 WDR17Q8IZU2 1322 aa29.52■■■□□ 2.32
RALGPS1-212ENST00000472427 CRB1P82279 1406 aa29.52■■■□□ 2.32
RALGPS1-212ENST00000472427 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
RALGPS1-212ENST00000472427 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa29.51■■■□□ 2.31
RALGPS1-212ENST00000472427 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa29.5■■■□□ 2.31
RALGPS1-212ENST00000472427 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa29.5■■■□□ 2.31
RALGPS1-212ENST00000472427 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP29.5■■■□□ 2.31
RALGPS1-212ENST00000472427 ANKRD24Q8TF21 1146 aa29.5■■■□□ 2.31
RALGPS1-212ENST00000472427 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa29.5■■■□□ 2.31
RALGPS1-212ENST00000472427 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP29.5■■■□□ 2.31
RALGPS1-212ENST00000472427 ERBB3P21860 1342 aa29.49■■■□□ 2.31
RALGPS1-212ENST00000472427 POLKQ9UBT6 870 aa29.49■■■□□ 2.31
RALGPS1-212ENST00000472427 INSRP06213 1382 aa29.48■■■□□ 2.31
RALGPS1-212ENST00000472427 PEAK1Q9H792 1746 aa29.48■■■□□ 2.31
RALGPS1-212ENST00000472427 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
RALGPS1-212ENST00000472427 GLI3P10071 1580 aa29.47■■■□□ 2.31
RALGPS1-212ENST00000472427 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa29.46■■■□□ 2.31
RALGPS1-212ENST00000472427 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP29.46■■■□□ 2.31
RALGPS1-212ENST00000472427 USP35Q9P2H5 1018 aa29.45■■■□□ 2.31
RALGPS1-212ENST00000472427 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
RALGPS1-212ENST00000472427 A0A0G2JS52 829 aa29.43■■■□□ 2.3
RALGPS1-212ENST00000472427 MYT1Q01538 1121 aa29.43■■■□□ 2.3
RALGPS1-212ENST00000472427 TCP11L2Q8N4U5 519 aa29.43■■■□□ 2.3
RALGPS1-212ENST00000472427 NLRP2Q9NX02 1062 aa29.43■■■□□ 2.3
RALGPS1-212ENST00000472427 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa29.42■■■□□ 2.3
RALGPS1-212ENST00000472427 CARD10Q9BWT7 1032 aa29.42■■■□□ 2.3
RALGPS1-212ENST00000472427 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP29.4■■■□□ 2.3
RALGPS1-212ENST00000472427 RGS12O14924 1447 aa29.38■■■□□ 2.29
RALGPS1-212ENST00000472427 BARGINQ6ZT62 677 aa29.38■■■□□ 2.29
RALGPS1-212ENST00000472427 MTHFSP49914 203 aa29.37■■■□□ 2.29
RALGPS1-212ENST00000472427 RALBP1Q15311 655 aa29.37■■■□□ 2.29
RALGPS1-212ENST00000472427 PARD3Q8TEW0 1356 aa29.37■■■□□ 2.29
RALGPS1-212ENST00000472427 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
RALGPS1-212ENST00000472427 CFAP53Q96M91 514 aa29.34■■■□□ 2.29
RALGPS1-212ENST00000472427 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP29.33■■■□□ 2.29
RALGPS1-212ENST00000472427 SEPT12Q8IYM1 358 aa29.33■■■□□ 2.29
RALGPS1-212ENST00000472427 WNK3Q9BYP7 1800 aa29.33■■■□□ 2.29
RALGPS1-212ENST00000472427 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa29.32■■■□□ 2.28
RALGPS1-212ENST00000472427 PPP2R1AP30153 589 aa29.32■■■□□ 2.28
RALGPS1-212ENST00000472427 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP29.3■■■□□ 2.28
RALGPS1-212ENST00000472427 ILDR2Q71H61 639 aa29.28■■■□□ 2.28
RALGPS1-212ENST00000472427 RGPD2P0DJD1 1756 aa29.28■■■□□ 2.28
RALGPS1-212ENST00000472427 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP29.28■■■□□ 2.28
RALGPS1-212ENST00000472427 IL2RBP14784 551 aa29.27■■■□□ 2.28
RALGPS1-212ENST00000472427 NBPF6Q5VWK0 638 aa29.27■■■□□ 2.28
RALGPS1-212ENST00000472427 NBPF4Q96M43 638 aa29.27■■■□□ 2.28
RALGPS1-212ENST00000472427 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP29.25■■■□□ 2.27
RALGPS1-212ENST00000472427 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa29.25■■■□□ 2.27
RALGPS1-212ENST00000472427 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP29.24■■■□□ 2.27
RALGPS1-212ENST00000472427 DISP2A7MBM2 1401 aa29.24■■■□□ 2.27
RALGPS1-212ENST00000472427 DDB1Q16531 1140 aa29.24■■■□□ 2.27
RALGPS1-212ENST00000472427 PDE3BQ13370 1112 aa29.23■■■□□ 2.27
RALGPS1-212ENST00000472427 KRT27Q7Z3Y8 459 aa29.23■■■□□ 2.27
RALGPS1-212ENST00000472427 USHBP1Q8N6Y0 703 aa29.23■■■□□ 2.27
RALGPS1-212ENST00000472427 EYA1Q99502 592 aa29.22■■■□□ 2.27
RALGPS1-212ENST00000472427 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP29.22■■■□□ 2.27
RALGPS1-212ENST00000472427 LRRC37A3O60309 1634 aa29.22■■■□□ 2.27
RALGPS1-212ENST00000472427 BRWD3Q6RI45 1802 aa29.22■■■□□ 2.27
RALGPS1-212ENST00000472427 ANP32CO43423 234 aa29.2■■■□□ 2.26
RALGPS1-212ENST00000472427 TATP17735 454 aaPredicted RBP29.2■■■□□ 2.26
RALGPS1-212ENST00000472427 IL13P35225 146 aa29.2■■■□□ 2.26
RALGPS1-212ENST00000472427 NUDCQ9Y266 331 aa29.2■■■□□ 2.26
RALGPS1-212ENST00000472427 NCAPD2Q15021 1401 aa29.2■■■□□ 2.26
RALGPS1-212ENST00000472427 IGSF1Q8N6C5 1336 aa29.2■■■□□ 2.26
RALGPS1-212ENST00000472427 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP29.19■■■□□ 2.26
RALGPS1-212ENST00000472427 EXOC5O00471 708 aa29.19■■■□□ 2.26
RALGPS1-212ENST00000472427 TNS2Q63HR2 1409 aa29.19■■■□□ 2.26
RALGPS1-212ENST00000472427 RGPD1P0DJD0 1748 aa29.16■■■□□ 2.26
RALGPS1-212ENST00000472427 MEGF6O75095 1541 aa29.15■■■□□ 2.26
RALGPS1-212ENST00000472427 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa29.15■■■□□ 2.26
RALGPS1-212ENST00000472427 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
RALGPS1-212ENST00000472427 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa29.13■■■□□ 2.25
RALGPS1-212ENST00000472427 SULT6B1Q6IMI4 303 aa29.12■■■□□ 2.25
RALGPS1-212ENST00000472427 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.1 ms