RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465399.5

ATG4B-214, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 581 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-214ENST00000465399 MON2Q7Z3U7 1717 aa20.33■□□□□ 0.84
ATG4B-214ENST00000465399 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa20.32■□□□□ 0.84
ATG4B-214ENST00000465399 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
ATG4B-214ENST00000465399 KCNH5Q8NCM2 988 aa20.31■□□□□ 0.84
ATG4B-214ENST00000465399 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa20.3■□□□□ 0.84
ATG4B-214ENST00000465399 NBPF14Q5TI25 921 aa20.3■□□□□ 0.84
ATG4B-214ENST00000465399 TTC21AQ8NDW8 1320 aa20.29■□□□□ 0.84
ATG4B-214ENST00000465399 DDB1Q16531 1140 aa20.29■□□□□ 0.84
ATG4B-214ENST00000465399 WDR17Q8IZU2 1322 aa20.28■□□□□ 0.84
ATG4B-214ENST00000465399 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
ATG4B-214ENST00000465399 SOX12O15370 315 aa20.26■□□□□ 0.83
ATG4B-214ENST00000465399 ARHGEF25Q86VW2 580 aa20.26■□□□□ 0.83
ATG4B-214ENST00000465399 AXIN2Q9Y2T1 843 aa20.26■□□□□ 0.83
ATG4B-214ENST00000465399 NFAT5O94916 1531 aa20.26■□□□□ 0.83
ATG4B-214ENST00000465399 ABCC6O95255 1503 aa20.26■□□□□ 0.83
ATG4B-214ENST00000465399 LTN1O94822 1766 aa20.26■□□□□ 0.83
ATG4B-214ENST00000465399 USP54Q70EL1 1684 aa20.26■□□□□ 0.83
ATG4B-214ENST00000465399 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa20.25■□□□□ 0.83
ATG4B-214ENST00000465399 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
ATG4B-214ENST00000465399 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa20.24■□□□□ 0.83
ATG4B-214ENST00000465399 CARD10Q9BWT7 1032 aa20.21■□□□□ 0.83
ATG4B-214ENST00000465399 PLSCR1O15162 318 aa20.2■□□□□ 0.82
ATG4B-214ENST00000465399 CARD11Q9BXL7 1154 aa20.2■□□□□ 0.82
ATG4B-214ENST00000465399 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
ATG4B-214ENST00000465399 CCDC7Q96M83 1385 aa20.2■□□□□ 0.82
ATG4B-214ENST00000465399 BCL9O00512 1426 aa20.19■□□□□ 0.82
ATG4B-214ENST00000465399 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP20.19■□□□□ 0.82
ATG4B-214ENST00000465399 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
ATG4B-214ENST00000465399 USP31Q70CQ4 1352 aa20.18■□□□□ 0.82
ATG4B-214ENST00000465399 CD163L1Q9NR16 1453 aa20.18■□□□□ 0.82
ATG4B-214ENST00000465399 TONSLQ96HA7 1378 aa20.17■□□□□ 0.82
ATG4B-214ENST00000465399 CASZ1Q86V15 1759 aa20.16■□□□□ 0.82
ATG4B-214ENST00000465399 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
ATG4B-214ENST00000465399 TMC1Q8TDI8 760 aa20.16■□□□□ 0.82
ATG4B-214ENST00000465399 SPON1Q9HCB6 807 aa20.16■□□□□ 0.82
ATG4B-214ENST00000465399 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
ATG4B-214ENST00000465399 TNS2Q63HR2 1409 aa20.16■□□□□ 0.82
ATG4B-214ENST00000465399 EXOC5O00471 708 aa20.15■□□□□ 0.82
ATG4B-214ENST00000465399 NHSQ6T4R5 1651 aa20.15■□□□□ 0.82
ATG4B-214ENST00000465399 KCNQ2O43526 872 aa20.14■□□□□ 0.81
ATG4B-214ENST00000465399 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
ATG4B-214ENST00000465399 PTF1AQ7RTS3 328 aa20.13■□□□□ 0.81
ATG4B-214ENST00000465399 NME9Q86XW9 330 aa20.13■□□□□ 0.81
ATG4B-214ENST00000465399 KAT6BQ8WYB5 2073 aa20.12■□□□□ 0.81
ATG4B-214ENST00000465399 ERBB3P21860 1342 aa20.12■□□□□ 0.81
ATG4B-214ENST00000465399 TERF2IPQ9NYB0 399 aa20.12■□□□□ 0.81
ATG4B-214ENST00000465399 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
ATG4B-214ENST00000465399 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
ATG4B-214ENST00000465399 A0A1W2PP64 1363 aa20.1■□□□□ 0.81
ATG4B-214ENST00000465399 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa20.1■□□□□ 0.81
ATG4B-214ENST00000465399 NLRP2Q9NX02 1062 aa20.1■□□□□ 0.81
ATG4B-214ENST00000465399 NINLQ9Y2I6 1382 aa20.09■□□□□ 0.81
ATG4B-214ENST00000465399 BTAF1O14981 1849 aa20.09■□□□□ 0.81
ATG4B-214ENST00000465399 PROM2Q8N271 834 aa20.08■□□□□ 0.81
ATG4B-214ENST00000465399 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
ATG4B-214ENST00000465399 IL2RBP14784 551 aa20.07■□□□□ 0.8
ATG4B-214ENST00000465399 TXNRD1Q16881 649 aa20.07■□□□□ 0.8
ATG4B-214ENST00000465399 ANKRD24Q8TF21 1146 aa20.07■□□□□ 0.8
ATG4B-214ENST00000465399 DCAF8L1A6NGE4 600 aa20.06■□□□□ 0.8
ATG4B-214ENST00000465399 STK32BQ9NY57 414 aa20.06■□□□□ 0.8
ATG4B-214ENST00000465399 MYOM1P52179 1685 aa20.06■□□□□ 0.8
ATG4B-214ENST00000465399 ACSBG1Q96GR2 724 aa20.04■□□□□ 0.8
ATG4B-214ENST00000465399 SLC24A1O60721 1099 aa20.02■□□□□ 0.8
ATG4B-214ENST00000465399 ZBTB7AO95365 584 aa20.02■□□□□ 0.8
ATG4B-214ENST00000465399 SLC15A2Q16348 729 aa20.02■□□□□ 0.8
ATG4B-214ENST00000465399 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
ATG4B-214ENST00000465399 PAPPAQ13219 1627 aa20.02■□□□□ 0.79
ATG4B-214ENST00000465399 RGPD2P0DJD1 1756 aa20■□□□□ 0.79
ATG4B-214ENST00000465399 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa20■□□□□ 0.79
ATG4B-214ENST00000465399 YY1P25490 414 aa20■□□□□ 0.79
ATG4B-214ENST00000465399 IP6K1Q92551 441 aa20■□□□□ 0.79
ATG4B-214ENST00000465399 TESK2Q96S53 571 aa20■□□□□ 0.79
ATG4B-214ENST00000465399 COG3Q96JB2 828 aa19.99■□□□□ 0.79
ATG4B-214ENST00000465399 DOT1LQ8TEK3 1739 aa19.97■□□□□ 0.79
ATG4B-214ENST00000465399 PTGER2P43116 358 aa19.97■□□□□ 0.79
ATG4B-214ENST00000465399 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
ATG4B-214ENST00000465399 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
ATG4B-214ENST00000465399 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa19.96■□□□□ 0.79
ATG4B-214ENST00000465399 SHANK3Q9BYB0 1731 aa19.96■□□□□ 0.79
ATG4B-214ENST00000465399 MTFR1LQ9H019 292 aa19.96■□□□□ 0.79
ATG4B-214ENST00000465399 QSER1Q2KHR3 1735 aa19.96■□□□□ 0.79
ATG4B-214ENST00000465399 KIF20BQ96Q89 1820 aa19.95■□□□□ 0.78
ATG4B-214ENST00000465399 AMPHP49418 695 aa19.94■□□□□ 0.78
ATG4B-214ENST00000465399 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
ATG4B-214ENST00000465399 MAP3K19Q56UN5 1328 aa19.94■□□□□ 0.78
ATG4B-214ENST00000465399 HOXC9P31274 260 aa19.93■□□□□ 0.78
ATG4B-214ENST00000465399 TMF1P82094 1093 aa19.92■□□□□ 0.78
ATG4B-214ENST00000465399 LY75O60449 1722 aa19.92■□□□□ 0.78
ATG4B-214ENST00000465399 RTL1A6NKG5 1358 aa19.92■□□□□ 0.78
ATG4B-214ENST00000465399 USP47Q96K76 1375 aa19.91■□□□□ 0.78
ATG4B-214ENST00000465399 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa19.9■□□□□ 0.78
ATG4B-214ENST00000465399 CHD4Q14839 1912 aa19.9■□□□□ 0.78
ATG4B-214ENST00000465399 SLC27A3Q5K4L6 730 aa19.89■□□□□ 0.77
ATG4B-214ENST00000465399 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP19.89■□□□□ 0.77
ATG4B-214ENST00000465399 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP19.89■□□□□ 0.77
ATG4B-214ENST00000465399 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP19.89■□□□□ 0.77
ATG4B-214ENST00000465399 LRRC4BQ9NT99 713 aa19.89■□□□□ 0.77
ATG4B-214ENST00000465399 MEGF6O75095 1541 aa19.88■□□□□ 0.77
ATG4B-214ENST00000465399 FBLN1P23142 703 aa19.88■□□□□ 0.77
ATG4B-214ENST00000465399 ZNF827Q17R98 1081 aa19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.6 ms