RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455321.1

PGGT1BP1-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 1, humanhuman

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Gene PGGT1BP1, Length 1,023 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PLEKHD1A6NEE1 506 aa13□□□□□ -0.33
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 TXNDC2Q86VQ3 553 aa12.81□□□□□ -0.36
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 NEO1Q92859 1461 aa12.79□□□□□ -0.36
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 FAM174AQ8TBP5 190 aa12.79□□□□□ -0.36
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP12.79□□□□□ -0.36
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GPSM3Q9Y4H4 160 aa12.79□□□□□ -0.36
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa12.79□□□□□ -0.36
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa12.79□□□□□ -0.36
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PREX2Q70Z35 1606 aa12.78□□□□□ -0.36
PGGT1BP1-201ENST00000455321 USP17L15C9J2P7 530 aa12.78□□□□□ -0.36
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